La ataxina-2 es una proteína que en humanos está codificada por el gen ATXN2 . [5] [6] Las mutaciones en ATXN2 causan ataxia espinocerebelosa tipo 2 (SCA2).
ATXN2 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | ATXN2 , ASL13, ATX2, SCA2, TNRC13, ataxina 2 | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 601517 MGI : 1277223 HomoloGene : 2234 GeneCards : ATXN2 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (ARNm) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (proteína) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ubicación (UCSC) | Crónicas 12: 111,44 - 111,6 Mb | Crónicas 5: 121,71 - 121,82 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
Estructura proteica
Ataxin-2 contiene los siguientes dominios proteicos: [7]
- Dos dominios LSm , que probablemente le permitan unirse al ARN
- Un motivo PAM2, que se predice que se asociará con la proteína de unión a poli (A)
- Un tracto de poliglutamina en algunas especies (ubicado cerca del terminal amino en primates y entre los dominios LSm en insectos) [8]
Se ha descrito una posible variante de la transcripción, a la que le falta un exón codificante interno; sin embargo, su naturaleza completa no es segura. [9]
Especies, tejidos y distribución subcelular
ATXN2 se conserva en eucariotas . La mayoría de los vertebrados tienen dos ortólogos del gen (llamados ATXN2 y ATXN2L en humanos), con la excepción de las aves que solo tienen uno. Las especies de plantas tienen de dos a seis ortólogos ATXN2 . [8]
ATXN2 se expresa de forma ubicua en diferentes tejidos. Dentro de las células individuales, se localiza en el aparato de Golgi y en los gránulos de estrés . [10]
Función
La ataxina-2 participa en la regulación de la traducción del ARNm a través de sus interacciones con la proteína de unión a poli (A). También participa en la formación de gránulos de estrés y cuerpos P , que también juegan un papel en la regulación del ARN. [10]
Significación clínica
Ataxia espinocerebelosa tipo 2 (SCA2)
El tracto de poliglutamina en la ataxina-2 humana es inestable y puede expandirse a medida que se transmite de generación en generación. Los alelos normales suelen tener 22 o 23 repeticiones, pero pueden contener hasta 31 repeticiones. Las expansiones más largas pueden causar ataxia espinocerebelosa tipo 2 (SCA2), un trastorno genético progresivo fatal en el que las neuronas degeneran en el cerebelo , la oliva inferior , la protuberancia y otras áreas. Los síntomas de SCA2 incluyen ataxia (pérdida de movimientos coordinados), parkinsonismo y demencia en algunos casos. [11] El alelo de la enfermedad generalmente contiene 34-52 repeticiones CAG, pero puede contener tan solo 32 o más de 100, y puede expandirse en tamaño cuando se transmite a generaciones sucesivas. Se desconoce cómo la expansión de poliglutamina en ataxina-2 conduce a estos síntomas.
Esclerosis lateral amiotrófica (ELA)
En 2010, el trabajo de Aaron Gitler y Nancy Bonini en la Universidad de Pensilvania descubrió que las expansiones repetidas de CAG de tamaño intermedio están significativamente asociadas con el riesgo de desarrollar esclerosis lateral amiotrófica (enfermedad de Lou Gehrig). [12]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000204842 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000042605 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Gispert S, Twells R, Orozco G, Brice A, Weber J, Heredero L, Scheufler K, Riley B, Allotey R, Nothers C (julio de 1993). "Asignación cromosómica del segundo locus de ataxia cerebelosa autosómica dominante (SCA2) al cromosoma 12q23-24.1". Genética de la naturaleza . 4 (3): 295–9. doi : 10.1038 / ng0793-295 . PMID 8358438 . S2CID 7387082 .
- ^ Margolis RL, Abraham MR, Gatchell SB, Li SH, Kidwai AS, Breschel TS, Stine OC, Callahan C, McInnis MG, Ross CA (julio de 1997). "ADNc con repeticiones largas de trinucleótidos CAG del cerebro humano". Genética humana . 100 (1): 114–22. doi : 10.1007 / s004390050476 . PMID 9225980 . S2CID 25999127 .
- ^ Albrecht M, Golatta M, Wüllner U, Lengauer T (agosto de 2004). "Análisis estructural y funcional de ataxina-2 y ataxina-3". Revista europea de bioquímica . 271 (15): 3155–70. doi : 10.1111 / j.1432-1033.2004.04245.x . PMID 15265035 .
- ^ a b Jiménez-López D, Guzmán P (julio de 2014). "Información sobre la evolución y la estructura del dominio de las proteínas Ataxin-2 en eucariotas" . Notas de investigación de BMC . 7 : 453. doi : 10.1186 / 1756-0500-7-453 . PMC 4105795 . PMID 25027299 .
- ^ "Gen Entrez: ATXN2 ataxina 2" .
- ^ a b Orr HT (abril de 2012). "Biología celular de la ataxia espinocerebelosa" . The Journal of Cell Biology . 197 (2): 167–77. doi : 10.1083 / jcb.201105092 . PMC 3328388 . PMID 22508507 .
- ^ Referencia, Genética Inicio. "SCA2" . Referencia casera de la genética . Consultado el 11 de enero de 2018 .
- ^ Elden AC, Kim HJ, Hart MP, Chen-Plotkin AS, Johnson BS, Fang X, Armakola M, Geser F, Greene R, Lu MM, Padmanabhan A, Clay-Falcone D, McCluskey L, Elman L, Juhr D, Gruber PJ, Rüb U, Auburger G, Trojanowski JQ, Lee VM, Van Deerlin VM, Bonini NM, Gitler AD (agosto de 2010). "Las expansiones de poliglutamina de longitud intermedia ataxina-2 están asociadas con un mayor riesgo de ELA" . Naturaleza . 466 (7310): 1069–75. doi : 10.1038 / nature09320 . PMC 2965417 . PMID 20740007 .
Otras lecturas
- Stevanin G, Dürr A, Brice A (enero de 2000). "Avances clínicos y moleculares en ataxias cerebelosas autosómicas dominantes: del genotipo al fenotipo y fisiopatología" . Revista europea de genética humana . 8 (1): 4–18. doi : 10.1038 / sj.ejhg.5200403 . PMID 10713882 .
- Pulst SM, Nechiporuk A, Nechiporuk T, Gispert S, Chen XN, Lopes-Cendes I, Pearlman S, Starkman S, Orozco-Diaz G, Lunkes A, DeJong P, Rouleau GA, Auburger G, Korenberg JR, Figueroa C, Sahba S (noviembre de 1996). "Expansión moderada de una repetición de trinucleótidos normalmente bialélicos en la ataxia espinocerebelosa tipo 2". Genética de la naturaleza . 14 (3): 269–76. doi : 10.1038 / ng1196-269 . PMID 8896555 . S2CID 12365475 .
- Sanpei K, Takano H, Igarashi S, Sato T, Oyake M, Sasaki H, Wakisaka A, Tashiro K, Ishida Y, Ikeuchi T, Koide R, Saito M, Sato A, Tanaka T, Hanyu S, Takiyama Y, Nishizawa M , Shimizu N, Nomura Y, Segawa M, Iwabuchi K, Eguchi I, Tanaka H, Takahashi H, Tsuji S (noviembre de 1996). "Identificación del gen de la ataxia espinocerebelosa tipo 2 mediante una técnica de identificación directa de expansión repetida y clonación, DIRECTA". Genética de la naturaleza . 14 (3): 277–84. doi : 10.1038 / ng1196-277 . PMID 8896556 . S2CID 24971010 .
- Imbert G, Saudou F, Yvert G, Devys D, Trottier Y, Garnier JM, Weber C, Mandel JL, Cancel G, Abbas N, Dürr A, Didierjean O, Stevanin G, Agid Y, Brice A (noviembre de 1996). "La clonación del gen de la ataxia espinocerebelosa 2 revela un locus con alta sensibilidad a las repeticiones expandidas de CAG / glutamina". Genética de la naturaleza . 14 (3): 285–91. doi : 10.1038 / ng1196-285 . PMID 8896557 . S2CID 9304975 .
- Sahba S, Nechiporuk A, Figueroa KP, Nechiporuk T, Pulst SM (febrero de 1998). "Estructura genómica del gen humano para la ataxia espinocerebelosa tipo 2 (SCA2) en el cromosoma 12q24.1". Genómica . 47 (3): 359–64. doi : 10.1006 / geno.1997.5131 . PMID 9480749 .
- Huynh DP, Del Bigio MR, Ho DH, Pulst SM (febrero de 1999). "Expresión de ataxina-2 en cerebros de individuos normales y pacientes con enfermedad de Alzheimer y ataxia espinocerebelosa 2". Annals of Neurology . 45 (2): 232–41. doi : 10.1002 / 1531-8249 (199902) 45: 2 <232 :: AID-ANA14> 3.0.CO; 2-7 . PMID 9989626 .
- Huynh DP, Figueroa K, Hoang N, Pulst SM (septiembre de 2000). "La localización nuclear o la formación de cuerpos de inclusión de ataxina-2 no son necesarias para la patogénesis de SCA2 en ratones o humanos". Genética de la naturaleza . 26 (1): 44–50. doi : 10.1038 / 79162 . PMID 10973246 . S2CID 14489237 .
- Affaitati A, de Cristofaro T, Feliciello A, Varrone S (abril de 2001). "Identificación de empalme alternativo del gen de la ataxia espinocerebelosa tipo 2". Gene . 267 (1): 89–93. doi : 10.1016 / S0378-1119 (01) 00402-4 . PMID 11311558 .
- Kiehl TR, Shibata H, Vo T, Huynh DP, Pulst SM (agosto de 2001). "Identificación y expresión de un ortólogo de ratón de A2BP1". Genoma de mamíferos . 12 (8): 595–601. doi : 10.1007 / s00335-001-2056-4 . PMID 11471052 . S2CID 7340712 .
- Choudhry S, Mukerji M, Srivastava AK, Jain S, Brahmachari SK (octubre de 2001). "Inestabilidad de repetición CAG en el locus SCA2: anclaje de interrupciones CAA y polimorfismos de nucleótido único enlazados" . Genética molecular humana . 10 (21): 2437–46. doi : 10.1093 / hmg / 10.21.2437 . PMID 11689490 .
- Pang JT, Giunti P, Chamberlain S, An SF, Vitaliani R, Scaravilli T, Martinian L, Wood NW, Scaravilli F, Ansorge O (marzo de 2002). "Inclusiones intranucleares neuronales en SCA2: un estudio genético, morfológico e inmunohistoquímico de dos casos" . Cerebro . 125 (Pt 3): 656–63. doi : 10.1093 / cerebro / awf060 . PMID 11872620 .
- Satterfield TF, Jackson SM, Pallanck LJ (diciembre de 2002). "Un homólogo de Drosophila del gen de la enfermedad de poliglutamina SCA2 es un regulador sensible a la dosis de la formación de filamentos de actina" . Genética . 162 (4): 1687–702. PMC 1462369 . PMID 12524342 .
- Wiedemeyer R, Westermann F, Wittke I, Nowock J, Schwab M (enero de 2003). "Ataxin-2 promueve la apoptosis de las células del neuroblastoma humano" . Oncogén . 22 (3): 401-11. doi : 10.1038 / sj.onc.1206150 . PMID 12545161 .
- Payami H, Nutt J, Gancher S, Bird T, McNeal MG, Seltzer WK, Hussey J, Lockhart P, Gwinn-Hardy K, Singleton AA, Singleton AB, Hardy J, Farrer M (abril de 2003). "SCA2 puede presentarse como parkinsonismo sensible a levodopa". Trastornos del movimiento . 18 (4): 425–9. doi : 10.1002 / mds.10375 . PMID 12671950 . S2CID 35401117 .
- Svetel M, Djarmati A, Dragasević N, Savić D, Culjković B, Romac S, Kostić VS (septiembre de 2003). "Mutaciones SCA2 y SCA3 en parkinsonismo sensible a la dopa de inicio joven". Revista europea de neurología . 10 (5): 597. doi : 10.1046 / j.1468-1331.2003.00671.x . PMID 12940846 . S2CID 30076827 .
- Brenneis C, Bösch SM, Schocke M, Wenning GK, Poewe W (octubre de 2003). "Patrón de atrofia en SCA2 determinado por morfometría basada en voxel". NeuroReport . 14 (14): 1799–802. doi : 10.1097 / 00001756-200310060-00008 . PMID 14534423 . S2CID 26149005 .
enlaces externos
- Entrada de GeneReviews / NIH / NCBI / UW sobre la ataxia espinocerebelosa tipo 2
- Ubicación del genoma humano ATXN2 y página de detalles del gen ATXN2 en UCSC Genome Browser .