La proteína grande rica en prolina BAT2 es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen BAT2 . [5] [6] [7]
PRRC2A | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | PRRC2A , BAT2, D6S51, D6S51E, G2, bobina en espiral rica en prolina 2A | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 142580 MGI : 1915467 HomoloGene : 10567 GeneCards : PRRC2A | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (ARNm) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (proteína) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ubicación (UCSC) | Crónicas 6: 31,62 - 31,64 Mb | Crónicas 17: 35,15 - 35,16 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
Función
Se ha localizado un grupo de genes, BAT1-BAT5, en las proximidades de los genes de TNF alfa y TNF beta . Estos genes están todos dentro de la región de clase III del complejo principal de histocompatibilidad humano . Este gen tiene repeticiones de microsatélites que están asociadas con la edad de inicio de la diabetes mellitus insulinodependiente (IDDM) y posiblemente se cree que está involucrado con el proceso inflamatorio de destrucción de células beta pancreáticas durante el desarrollo de IDDM. Este gen también es un gen candidato para el desarrollo de artritis reumatoide. Hay dos transcripciones empalmadas alternativamente que codifican diferentes isoformas descritas para este gen. [7]
Interacciones
Se ha demostrado que BAT2 interactúa con:
- C1QBP , [8]
- EIF3S6 , [8]
- HNRNPA1 , [8]
- IFT88 , [8]
- IMMT , [8] y
- UBAP2L . [8]
Referencias
- ^ Un b c ENSG00000206427, ENSG00000231825, ENSG00000231370, ENSG00000226618, ENSG00000225164, ENSG00000225748 GRCh38: liberación Ensembl 89: ENSG00000204469, ENSG00000206427, ENSG00000231825, ENSG00000231370, ENSG00000226618, ENSG00000225164, ENSG00000225748 - Ensembl , mayo de 2.017 mil
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024393 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Banerji J, Sands J, Strominger JL, Spies T (abril de 1990). "Un par de genes del complejo principal de histocompatibilidad humano codifica proteínas grandes ricas en prolina con múltiples motivos repetidos y un único dominio similar a la ubiquitina" . Proc Natl Acad Sci USA . 87 (6): 2374–8. Código Bibliográfico : 1990PNAS ... 87.2374B . doi : 10.1073 / pnas.87.6.2374 . PMC 53689 . PMID 2156268 .
- ^ Iris FJ, Bougueleret L, Prieur S, Caterina D, Primas G, Perrot V, Jurka J, Rodriguez-Tome P, Claverie JM, Dausset J, et al. (Junio de 1993). "Agrupación densa de Alu y un nuevo miembro potencial de la familia NF kappa B dentro de un segmento de HLA clase III de 90 kilobase". Nat Genet . 3 (2): 137–45. doi : 10.1038 / ng0293-137 . PMID 8499947 . S2CID 33041319 .
- ^ a b "Entrez Gene: BAT2 HLA-B asociado transcripción 2" .
- ^ a b c d e f Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (enero de 2004). "Análisis de un sistema de dos híbridos de levadura de alto rendimiento y su uso para predecir la función de proteínas intracelulares codificadas dentro de la región de clase III del MHC humano". Genómica . 83 (1): 153–67. doi : 10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0 . PMID 14667819 .
Otras lecturas
- Spies T, Bresnahan M, Strominger JL (1989). "El complejo principal de histocompatibilidad humano contiene un mínimo de 19 genes entre el grupo del complemento y HLA-B" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 86 (22): 8955–8. Código Bibliográfico : 1989PNAS ... 86.8955S . doi : 10.1073 / pnas.86.22.8955 . PMC 298409 . PMID 2813433 .
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). "Normalización y resta: dos enfoques para facilitar el descubrimiento de genes" . Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
- Singal DP, Li J, Zhu Y (2000). "Región HLA clase III y susceptibilidad a la artritis reumatoide". Clin. Exp. Rheumatol . 18 (4): 485–91. PMID 10949724 .
- Hashimoto M, Nakamura N, Obayashi H, et al. (2000). "Contribución genética del polimorfismo de microsatélites del gen BAT2 a la edad de inicio de la diabetes mellitus insulinodependiente". Tararear. Genet . 105 (3): 197–9. doi : 10.1007 / s004390051089 . PMID 10987645 .
- Matsuzaka Y, Makino S, Nakajima K, et al. (2002). "Nuevos marcadores de microsatélites polimórficos en la región humana de clase III del MHC". Antígenos tisulares . 57 (5): 397–404. doi : 10.1034 / j.1399-0039.2001.057005397.x . PMID 11556964 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH y col. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humano y de ratón de longitud completa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. doi : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, et al. (2003). "La secuencia de ADN y análisis del cromosoma 6 humano" . Naturaleza . 425 (6960): 805-11. Código Bib : 2003Natur.425..805M . doi : 10.1038 / nature02055 . PMID 14574404 .
- Xie T, Rowen L, Aguado B, et al. (2004). "Análisis de la región de clase III del complejo de histocompatibilidad principal de densidad genética y su comparación con el ratón" . Genome Res . 13 (12): 2621–36. doi : 10.1101 / gr.1736803 . PMC 403804 . PMID 14656967 .
- Lehner B, Semple JI, Brown SE y col. (2004). "Análisis de un sistema de dos híbridos de levadura de alto rendimiento y su uso para predecir la función de proteínas intracelulares codificadas dentro de la región de clase III del MHC humano". Genómica . 83 (1): 153–67. doi : 10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0 . PMID 14667819 .
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "Caracterización a gran escala de fosfoproteínas nucleares de células HeLa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Código Bibliográfico : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA y col. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
- Schneiders A, Thiel S, Winkler J y col. (2005). "Los anticuerpos generados por una nueva vacuna de ADN identifican el polipéptido BAT2 codificado por MHC de clase III". Vacuna . 23 (19): 2540–50. doi : 10.1016 / j.vaccine.2004.08.003 . PMID 15752841 .
- Kim JE, Tannenbaum SR, White FM (2005). "Fosfoproteoma global de células de adenocarcinoma de colon humano HT-29". J. Proteome Res . 4 (4): 1339–46. doi : 10.1021 / pr050048h . PMID 16083285 .
- Lim J, Hao T, Shaw C y col. (2006). "Una red de interacción proteína-proteína para ataxias hereditarias humanas y trastornos de la degeneración de las células de Purkinje". Celular . 125 (4): 801-14. doi : 10.1016 / j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .
- Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, et al. (2006). "Un enfoque basado en la probabilidad para el análisis de fosforilación de proteínas de alto rendimiento y la localización del sitio". Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. doi : 10.1038 / nbt1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F y col. (2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización". Celular . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
enlaces externos
- Ubicación del genoma humano PRRC2A y página de detalles del gen PRRC2A en UCSC Genome Browser .