Geobacillus stearothermophilus (anteriormente Bacillus stearothermophilus ) [1] [2] es una bacteria grampositiva con forma de varilla y miembro de la división Firmicutes . La bacteria es un termófilo y se distribuye ampliamente en el suelo, las aguas termales, los sedimentos del océano y es una causa de deterioro en los productos alimenticios. Crecerá dentro de un rango de temperatura de 30 a 75 ° C. Algunas cepas son capaces de oxidar el monóxido de carbono de forma aeróbica. Se usa comúnmente como organismo de desafío paraestudios de validación de esterilización y verificación periódica de los ciclos de esterilización. El indicador biológico contiene esporas.del organismo en papel de filtro dentro de un vial. Después de la esterilización, se cierra la tapa, se tritura una ampolla de medio de crecimiento dentro del vial y se incuba todo el vial . Un cambio de color y / o turbidez indica los resultados del proceso de esterilización; ningún cambio indica que se alcanzaron las condiciones de esterilización, de lo contrario el crecimiento de las esporas indica que no se ha cumplido el proceso de esterilización. Recientemente , se está utilizando una cepa con etiqueta fluorescente , Rapid Readout (tm), para verificar la esterilización, ya que la fluorescencia azul visible aparece en aproximadamente una décima parte del tiempo necesario para el cambio de color del indicador de pH, y un sensor de luz económico puede detectar el crecimiento. colonias.
Geobacillus stearothermophilus | |
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clasificación cientifica | |
Reino: | |
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Familia: | |
Género: | |
Especies: | G. stearothermophilus |
Nombre binomial | |
Geobacillus stearothermophilus |
Los indicadores biológicos se utilizan junto con indicadores químicos e indicadores de proceso para validar los procesos de esterilización.
Fue descrito por primera vez en 1920 como Bacillus stearothermophilus , [3] pero, junto con Bacillus thermoglucosidasius , fue reclasificado como miembro del género Geobacillus en 2001. [4]
Aplicaciones en biología molecular
ADN polimerasa
ADN polimerasa I | ||||||
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Identificadores | ||||||
Organismo | ||||||
Símbolo | PolA | |||||
PDB | 2XY5 | |||||
UniProt | E1C9K5 | |||||
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Intrón termoestable Grupo II Transcriptasa inversa GsI-IIC | ||||||
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Identificadores | ||||||
Organismo | ||||||
Símbolo | TRT | |||||
PDB | 6AR1 | |||||
UniProt | E2GM63 | |||||
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Recientemente, una ADN polimerasa derivada de estas bacterias, la Bst polimerasa, se ha vuelto importante en aplicaciones de biología molecular.
La polimerasa Bst tiene una actividad similar a la helicasa , lo que le permite desenrollar las cadenas de ADN. Su temperatura de funcionamiento óptima está entre 60 y 65 ° C y se desnaturaliza a temperaturas superiores a 70 ° C. Estas características lo hacen útil en amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP) . [5] LAMP es similar a la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) pero no requiere el paso de alta temperatura (96 ° C) requerido para desnaturalizar el ADN.
La transcriptasa inversa
En 2013, se descubrió que una transcriptasa inversa de intrón termoestable del grupo II (TGIRT), GsI-IIC-MRF, de G. stearothermophilus conservaba la actividad hasta 70 ° C y mostraba una alta procesividad y una baja tasa de error. [6] Estas propiedades hacen que esta enzima sea útil para la transcripción inversa de moléculas de ARN largas y / o altamente estructuradas . Un método para determinar la estructura secundaria del ARN , DMS-MaPseq, utiliza esta enzima porque convierte el ARN normal en ADN con precisión, pero introduce mutaciones en bases no apareadas que han sido metiladas por dimetilsulfato , y las mutaciones pueden identificarse mediante secuenciación . [7]
Referencias
- ^ Coorevits, A; Dinsdale, AE; Halket, G; Lebbe, L; De Vos, P; Van Landschoot, A; Logan, NA (julio de 2012). "Revisión taxonómica del género Geobacillus: enmienda de Geobacillus, G. stearothermophilus, G. jurassicus, G. toebii, G. thermodenitrificans y G. thermoglucosidans (nom. Corrig., Anteriormente 'thermoglucosidasius'); transferencia de Bacillus thermantarcticus al como G. thermantarcticus comb. nov .; propuesta de Caldibacillus debilis gen. nov., comb. nov .; transferencia de G. tepidamans a Anoxybacillus como A. tepidamans comb. nov .; y propuesta de Anoxybacillus caldiproteolyticus sp. nov " . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 62 (Pt 7): 1470–85. doi : 10.1099 / ijs.0.030346-0 . PMID 21856988 .
- ^ "Notificación de que han aparecido nuevos nombres y nuevas combinaciones en el volumen 50, parte 2, del IJSEM" (PDF) . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 51 (3): 795–6. 2001. doi : 10.1099 / 00207713-51-3-795 . PMID 11411700 . Archivado desde el original (PDF) el 26 de marzo de 2009 . Consultado el 7 de septiembre de 2007 .
- ^ DONK PJ: un organismo termófilo altamente resistente " Journal of Bacteriology 1920; 5, 373-374.
- ^ TN Nazina; TP Tourova; AB Poltaraus; EV Novikova; AA Grigoryan; AE Ivanova; AM Lysenko; VV Petrunyaka; GA Osipov; SS Belyaev y MV Ivanov (2001). "Estudio taxonómico de bacilos termofílicos aeróbicos: descripciones de Geobacillus subterraneus gen. Nov., Sp. Nov. Y Geobacillus uzenensis sp. Nov. De yacimientos de petróleo y transferencia de Bacillus stearothermophilus, Bacillus thermocatenulatus, Bacillus thermoleovocillificans como las nuevas combinaciones G. stearothermophilus, G. th " . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 51 (2): 433–446. doi : 10.1099 / 00207713-51-2-433 . PMID 11321089 .
- ^ Mori Y, Hirano T, Notomi T (2006). "Detección visual de secuencias específicas de reacciones LAMP mediante la adición de polímeros catiónicos" . BMC Biotechnol . 6 : 3. doi : 10.1186 / 1472-6750-6-3 . PMC 1373654 . PMID 16401354 .
- ^ Mohr, S .; Ghanem, E .; Smith, W .; Sheeter, D .; Qin, Y .; King, O .; Polioudakis, D .; Iyer, VR; Hunicke-Smith, S .; Swamy, S .; Kuersten, S. (1 de julio de 2013). "Proteínas de fusión de transcriptasa inversa de intrón termoestable del grupo II y su uso en la síntesis de ADNc y secuenciación de ARN de próxima generación" . ARN . 19 (7): 958–970. doi : 10.1261 / rna.039743.113 . ISSN 1355-8382 . PMC 3683930 . PMID 23697550 .
- ^ Zubradt, Meghan; Gupta, Paromita; Persad, Sitara; Lambowitz, Alan M; Weissman, Jonathan S; Rouskin, Silvi (7 de noviembre de 2016). "DMS-MaPseq para el sondeo de la estructura del ARN dirigido o de todo el genoma in vivo" . Métodos de la naturaleza . 14 (1): 75–82. doi : 10.1038 / nmeth.4057 . ISSN 1548-7091 . PMC 5508988 . PMID 27819661 .
enlaces externos
- Tipo de cepa de Geobacillus stearothermophilus en Bac Dive - la base de metadatos de diversidad bacteriana