Chlamydophila es un género bacteriano controvertido quepertenece a la familia Chlamydiaceae , [2] orden Chlamydiales , clase / phylum Chlamydiae .
Chlamydophila | |
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clasificación cientifica | |
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Género: | Chlamydophila |
Especies [1] | |
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Taxonomía
Todas las clamidias son bacterias anaeróbicas con un ciclo de vida de desarrollo bifásico que depende del crecimiento intracelular obligado en las células huésped eucariotas .
Chlamydophila fue reconocida por varios científicos en 1999, [3] con seis especies en Chlamydophila y tres en el género original, Chlamydia . Esto fue visto inmediatamente como controvertido. [4] En 2015, lasespecies de Chlamydophila fueron reclasificadas como Chlamydia . [4] El historial de la clasificación y reclasificación es el siguiente.
Los criterios anteriores para la diferenciación de especies de clamidias no siempre funcionaron bien. Por ejemplo, en ese momento el género C. psittaci se distinguía de C. trachomatis por la resistencia a la sulfadiazina , aunque no todas las cepas identificadas como C. psittaci en ese momento eran resistentes, y C. pneumoniae se clasificó por su apariencia bajo microscopía electrónica (ME) y su capacidad para infectar a los humanos, aunque la apariencia de EM puede diferir de un grupo de investigación a otro, y muchas de estas especies infectan a los humanos.
La taxonomía sistemática establecida para Chlamydiae en 1999 utilizó la reasociación de ADN-ADN , la similitud de genes de ARN ribosómico 16S y 23S , la agrupación de secuencias de similitud de genes codificantes de proteínas y el tamaño del genoma como criterios de clasificación. También se emplearon criterios de apoyo como la detección de antígenos , la tinción de glucógeno [5] , la asociación del huésped y la morfología de EM, según la aplicabilidad y disponibilidad.
Los análisis genómicos comparativos en 2006 identificaron una serie de proteínas distintivas que estaban presentes de forma única en especies de los géneros Chlamydia y Chlamydophila , lo que respaldaba la distinción de Chlamydophila . [6] Este punto de vista fue desafiado tres años más tarde por nuevas técnicas de análisis del genoma completo que llevaron a una propuesta para "reunir las Chlamydiaceae en un solo género, Chlamydia ". [7] Para la década de 2010, esta reclasificación "no fue totalmente aceptada o adoptada" [8] entre los microbiólogos, lo que "resultó en una reversión al único género original Chlamydia , que ahora abarca las 9 especies, incluida Chlamydia psittaci ". [8] En 2013, Chlamydophila todavía se mencionaba en algunas bases de datos, pero era controvertida. [9] La fusión del género Chlamydophila con el género Chlamydia ahora es generalmente aceptada. [10] [11] [12] [13]
Diferenciación de Chlamydophila
Según los autores del estudio de 1999, la diferencia media de reasociación ADN-ADN que distingue a Chlamydophila de Chlamydia es del 10,1%, un valor aceptado para la separación de género. Aunque las secuencias del gen de ARN ribosómico 16S de los dos son casi un 95% idénticas, a diferencia de los otros géneros previamente establecidos, los autores consideraron una similitud inferior al 95% solo como una guía para establecer nuevos géneros en familias de clamidia. En el estudio, los autores utilizaron la similitud de las ubicaciones de codificación de genes de ARN ribosómico y de proteínas en el genoma (grupos de genes) para ayudar a distinguir entre Chlamydophila y Chlamydia . Además, los genes de ARN ribosómico 23S de longitud completa de las especies de los dos géneros eran menos del 95% idénticos.
Género | Tamaño aproximado del genoma (millones de pares de bases de ADN) | Glucógeno detectable | Número de operones ribosomales |
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Chlamydophila | 1.2 | No | 1 |
Clamidia | 1.0 | sí | 2 |
Especies
Las distinciones como la morfología EM, la resistencia a los antibióticos y el plásmido extracromosómico son características típicamente específicas de la especie.
Las especies de Chlamydophila incluyeron:
- Chlamydophila pneumoniae
- Chlamydophila pecorum
- Chlamydophila felis
- Chlamydophila psittaci
- Chlamydophila abortus
- Chlamydophila caviae
Referencias
- ^ JP Euzéby. "Chlamydophila" . Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura . Consultado el 11 de junio de 2011 .
- ^ Chlamydophila en los encabezados de temas médicos de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.(MeSH)
- ^ Everett KD, Bush RM, Andersen AA (abril de 1999). "Descripción modificada del orden Chlamydiales, propuesta de Parachlamydiaceae fam. Nov. Y Simkaniaceae fam. Nov., Cada una con un género monotípico, taxonomía revisada de la familia Chlamydiaceae, que incluye un nuevo género y cinco nuevas especies, y normas para la identificación de organismos " . Revista Internacional de Bacteriología Sistemática . 49 Pt 2 (2): 415–40. doi : 10.1099 / 00207713-49-2-415 . PMID 10319462 .[ enlace muerto permanente ]
- ^ a b Parte, AC "Chlamydia" . LPSN .
- ^ Bush RM, Everett KD (enero de 2001). "Evolución molecular de las Chlamydiaceae" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 51 (Parte 1): 203-20. doi : 10.1099 / 00207713-51-1-203 . PMID 11211261 .[ enlace muerto permanente ]
- ^ Griffiths E, Ventresca MS, Gupta RS (enero de 2006). "Exploración BLAST de genomas de clamidia para identificar proteínas de firma que son únicas para los grupos de especies de Chlamydiales, Chlamydiaceae, Chlamydophila y Chlamydia" . BMC Genomics . 7 : 14. doi : 10.1186 / 1471-2164-7-14 . PMC 1403754 . PMID 16436211 .
- ^ Stephens RS, Myers G, Eppinger M, Bavoil PM (marzo de 2009). "Divergencia sin diferencia: filogenética y taxonomía de Chlamydia resuelto" . Inmunología FEMS y Microbiología Médica . 55 (2): 115–9. doi : 10.1111 / j.1574-695X.2008.00516.x . PMID 19281563 .
- ^ a b Balsamo G, Maxted AM, Midla JW, Murphy JM, Wohrle R, Edling TM, et al. (Septiembre de 2017). "Compendio de medidas para controlar la infección por Chlamydia psittaci entre humanos (psitacosis) y aves de compañía (clamidiosis aviar), 2017" (PDF) . Revista de Medicina y Cirugía Aviar . 31 (3): 262-282. doi : 10.1647 / 217-265 . PMID 28891690 .
- ^ "Grupo de Chlamydia / Chlamydophila" . Base de datos de taxonomía NCBI . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . Consultado el 26 de marzo de 2013 .
Dada la naturaleza polémica del problema, la base de datos de taxonomía del NCBI conserva los nombres de ambos géneros para que los utilicen los remitentes.
- ^ Bavoil P, Kaltenboeck B, Greub G (marzo de 2013). "En Chlamydia veritas" . Patógenos y enfermedades . 67 (2): 89–90. doi : 10.1111 / 2049-632X.12026 . PMID 23620152 .
- ^ Bachmann NL, Polkinghorne A, Timms P (agosto de 2014). "Genómica de la clamidia: proporcionar conocimientos novedosos sobre la biología de la clamidia". Tendencias en microbiología . 22 (8): 464–72. doi : 10.1016 / j.tim.2014.04.013 . PMID 24882432 .
- ^ Sachse K, Bavoil PM, Kaltenboeck B, Stephens RS, Kuo CC, Rosselló-Móra R, Horn M (marzo de 2015). "Enmienda de la familia Chlamydiaceae: propuesta de un solo género, Chlamydia, para incluir todas las especies actualmente reconocidas". Microbiología sistemática y aplicada . 38 (2): 99–103. doi : 10.1016 / j.syapm.2014.12.004 . hdl : 10261/123714 . PMID 25618261 .
- ^ Borel N, Polkinghorne A, Pospischil A (mayo de 2018). "Una revisión sobre las enfermedades por clamidia en los animales: ¿sigue siendo un desafío para los patólogos?" . Patología veterinaria . 55 (3): 374–390. doi : 10.1177 / 0300985817751218 . PMID 29310550 .
enlaces externos
- Genomas de Chlamydophila e información relacionada en PATRIC , un Centro de Recursos de Bioinformática financiado por NIAID
- Esquema taxonómico de los procariotas, Manual de bacteriología sistemática de Bergey, segunda edición, versión 1.0, c. De abril. [1]