La desoxirribonucleasa I (normalmente denominada DNasa I ) es una endonucleasa de la familia de las DNasa codificada por el gen humano DNASE1 . [5] La ADNasa I es una nucleasa que escinde el ADN preferentemente en enlaces fosfodiéster adyacentes a un nucleótido de pirimidina , produciendo polinucleótidos terminados en 5'-fosfato con un grupo hidroxilo libre en la posición 3 ', produciendo en promedio tetranucleótidos. Actúa sobre el ADN monocatenario, el ADN bicatenario y la cromatina . Además de su función como endonucleasa de gestión de residuos , se ha sugerido que es una de las desoxirribonucleasasresponsable de la fragmentación del ADN durante la apoptosis . [6]
DNASE1 | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | DNASE1 , DNL1, DRNI, desoxirribonucleasa I, desoxirribonucleasa 1 | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 125505 MGI : 103157 HomoloGene : 3826 GeneCards : DNASE1 | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 16: 3,61 - 3,68 Mb | Crónicas 16: 4.04 - 4.04 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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La ADNasa I se une a la proteína citoesquelética actina . Se une a los monómeros de actina con afinidad muy alta (sub-nanomolar) y a los polímeros de actina con menor afinidad. La función de esta interacción no está clara. Sin embargo, dado que la DNasa I unida a actina es enzimáticamente inactiva, el complejo DNasa- actina podría ser una forma de almacenamiento de DNasa I que previene el daño de la información genética. Esta proteína se almacena en los gránulos de zimógeno de la envoltura nuclear y funciona escindiendo el ADN de manera endonucleolítica.
Se han caracterizado al menos seis alelos codominantes autosómicos del gen DNASE 1, DNASE1 * 1 a DNASE1 * 6, y la secuencia de DNASE1 * 2 representada en este registro. Las mutaciones en este gen, así como el factor que inactiva su producto enzimático, se han asociado con el lupus eritematoso sistémico (LES) , una enfermedad autoinmune . [7] [8] Una forma recombinante de esta proteína se usa para tratar uno de los síntomas de la fibrosis quística al hidrolizar el ADN extracelular en el esputo y reducir su viscosidad. [9] Se han observado variantes de corte y empalme transcripcionales alternativas de este gen, pero no se han caracterizado completamente. [5]
En genómica
En genómica, se cree que los sitios hipersensibles a la ADNasa I se caracterizan por una cromatina abierta y accesible; por lo tanto, un ensayo de sensibilidad a la DNasa I es una metodología ampliamente utilizada en genómica para identificar qué regiones del genoma es probable que contengan genes activos [10].
Especificidad de la secuencia de ADNasa I
Recientemente se ha informado de que la DNasa I muestra algunos niveles de especificidad de secuencia que pueden depender de las condiciones experimentales. [11] A diferencia de otras enzimas que tienen una alta especificidad de sustrato, la DNasa I ciertamente no se escinde con una especificidad de secuencia absoluta. Sin embargo, la escisión en sitios que contienen C o G en su extremo 3 'es menos eficaz.
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000213918 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000005980 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ a b "Entrez Gene: DNASE1 desoxirribonucleasa I" .
- ^ Samejima, K. y Earnshaw, WC (2005). "Destrozando el genoma: el papel de las nucleasas durante la apoptosis". Nat Rev Mol Cell Biol . 6 (9): 677–88. doi : 10.1038 / nrm1715 . PMID 16103871 . S2CID 13948545 .
- ^ Hakkim A, Fürnrohr BG, Amann K, Laube B, Abed UA, Brinkmann V, Herrmann M, Voll RE, Zychlinsky A (2010). "El deterioro de la degradación de la trampa extracelular de neutrófilos está asociado con la nefritis lúpica" . Proc Natl Acad Sci USA . 107 (21): 9813–8. doi : 10.1073 / pnas.0909927107 . PMC 2906830 . PMID 20439745 .
- ^ Yasutomo K, Horiuchi T, Kagami S y col. (2001). "Mutación de DNASE1 en personas con lupus eritematoso sistémico". Nat. Genet . 28 (4): 313–4. doi : 10.1038 / 91070 . PMID 11479590 . S2CID 21277651 .
- ^ Shak S, Capon DJ, Hellmiss R, et al. (1991). "La ADNasa I humana recombinante reduce la viscosidad del esputo de fibrosis quística" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (23): 9188–92. doi : 10.1073 / pnas.87.23.9188 . PMC 55129 . PMID 2251263 .
- ^ Boyle AP, Davis S, Shulha HP, Meltzer P, Margulies EH, Weng Z, Furey TS, Crawford GE (2008). "Mapeo de alta resolución y caracterización de cromatina abierta en todo el genoma" . Celular . 132 (2): 311–322. doi : 10.1016 / j.cell.2007.12.014 . PMC 2669738 . PMID 18243105 .
- ^ Koohy, Hashem; Abajo, Thomas A .; Hubbard, Tim J .; Mariño-Ramírez, Leonardo (26 de julio de 2013). "Los conjuntos de datos de accesibilidad a la cromatina muestran sesgo debido a la especificidad de la secuencia de la enzima DNasa I" . PLOS ONE . 8 (7): e69853. doi : 10.1371 / journal.pone.0069853 . PMC 3724795 . PMID 23922824 .
Otras lecturas
- Lachmann PJ (2003). "Lupus y desoxirribonucleasa". Lupus . 12 (3): 202–6. doi : 10.1191 / 0961203303lu357xx . PMID 12708782 . S2CID 43058677 .
- Yasuda T, Awazu S, Sato W y col. (1991). "Desoxirribonucleasa polimórfica humana: purificación, caracterización y multiplicidad de desoxirribonucleasa I urinaria". J. Biochem . 108 (3): 393–8. doi : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a123212 . PMID 2277032 .
- Kishi K, Yasuda T, Ikehara Y, et al. (1990). "Polimorfismo de desoxirribonucleasa I (DNasa I) de suero humano: similitudes de patrón entre isoenzimas de suero, orina, riñón, hígado y páncreas" . Soy. J. Hum. Genet . 47 (1): 121–6. PMC 1683738 . PMID 2349940 .
- Kabsch W, Mannherz HG, Suck D y col. (1990). "Estructura atómica de la actina: complejo DNasa I". Naturaleza . 347 (6288): 37–44. doi : 10.1038 / 347037a0 . PMID 2395459 . S2CID 925337 .
- Kishi K, Yasuda T, Awazu S, Mizuta K (1989). "Polimorfismo genético de la desoxirribonucleasa I de la orina humana". Tararear. Genet . 81 (3): 295–7. doi : 10.1007 / BF00279009 . PMID 2921043 . S2CID 20420713 .
- Rosenstreich DL, Tu JH, Kinkade PR, et al. (1988). "Un inhibidor de la interleucina 1 derivada de la orina humana. Homología con desoxirribonucleasa I" . J. Exp. Med . 168 (5): 1767–79. doi : 10.1084 / jem.168.5.1767 . PMC 2189114 . PMID 3263467 .
- Yasuda T, Nadano D, Takeshita H, et al. (1995). "Análisis molecular del tercer alelo del polimorfismo de desoxirribonucleasa I humana". Ana. Tararear. Genet . 59 (Parte 2): 139–47. doi : 10.1111 / j.1469-1809.1995.tb00737.x . PMID 7625762 . S2CID 43729378 .
- Yasuda T, Kishi K, Yanagawa Y, Yoshida A (1995). "Estructura del gen de la desoxirribonucleasa I (DNasa I) humana: identificación de la sustitución de nucleótidos que genera su polimorfismo genético clásico". Ana. Tararear. Genet . 59 (Parte 1): 1-15. doi : 10.1111 / j.1469-1809.1995.tb01601.x . PMID 7762978 . S2CID 23914004 .
- Yasuda T, Nadano D, Iida R, et al. (1995). "Asignación cromosómica del gen de la desoxirribonucleasa I humana, DNASE 1 (DNL1), a la banda 16p13.3 mediante la reacción en cadena de la polimerasa". Cytogenet. Cell Genet . 70 (3–4): 221–3. doi : 10.1159 / 000134038 . PMID 7789176 .
- Yasuda T, Nadano D, Takeshita H, et al. (1995). "La base molecular del polimorfismo genético de la desoxirribonucleasa I humana: identificación de la sustitución de nucleótidos que genera el cuarto alelo". FEBS Lett . 359 (2–3): 211–4. doi : 10.1016 / 0014-5793 (95) 00037-A . PMID 7867802 . S2CID 21461181 .
- Yasuda T, Nadano D, Tenjo E, et al. (1996). "Genotipado del polimorfismo de desoxirribonucleasa I humana por la reacción en cadena de la polimerasa". Electroforesis . 16 (10): 1889–93. doi : 10.1002 / elps.11501601310 . PMID 8586059 . S2CID 35528773 .
- Iida R, Yasuda T, Takeshita H, et al. (1996). "Identificación de la sustitución de nucleótidos que genera el cuarto sitio polimórfico en desoxirribonucleasa I humana (DNasa I)". Tararear. Genet . 98 (4): 415–8. doi : 10.1007 / s004390050231 . PMID 8792814 . S2CID 6393565 .
- Iida R, Yasuda T, Aoyama M, et al. (1998). "El quinto alelo del polimorfismo de la desoxirribonucleasa I (DNasa I) humana". Electroforesis . 18 (11): 1936–9. doi : 10.1002 / elps.1150181108 . PMID 9420147 . S2CID 8969865 .
- Yasuda T, Takeshita H, Iida R, et al. (1999). "Un nuevo alelo, DNASE1 * 6, del polimorfismo de la desoxirribonucleasa I humana codifica una sustitución de Arg a Cys responsable de su inestabilidad". Biochem. Biophys. Res. Comun . 260 (1): 280–3. doi : 10.1006 / bbrc.1999.0900 . PMID 10381379 .
- Oliveri M, Daga A, Cantoni C, et al. (2001). "DNasa I media la degradación del ADN internucleosomal en células humanas que sufren apoptosis inducida por fármacos". EUR. J. Immunol . 31 (3): 743–51. doi : 10.1002 / 1521-4141 (200103) 31: 3 <743 :: AID-IMMU743> 3.0.CO; 2-9 . PMID 11241278 .
- Otterbein LR, Graceffa P, Dominguez R (2001). "La estructura cristalina de actina sin complejos en el estado ADP". Ciencia . 293 (5530): 708-11. doi : 10.1126 / science.1059700 . PMID 11474115 . S2CID 12030018 .
- Yasutomo K, Horiuchi T, Kagami S y col. (2001). "Mutación de DNASE1 en personas con lupus eritematoso sistémico". Nat. Genet . 28 (4): 313–4. doi : 10.1038 / 91070 . PMID 11479590 . S2CID 21277651 .
- Ballweber E, Galla M, Aktories K y col. (2001). "Interacción de actina ADP-ribosilada con proteínas de unión a actina". FEBS Lett . 508 (1): 131–5. doi : 10.1016 / S0014-5793 (01) 03040-X . PMID 11707283 . S2CID 7241702 .
- Tsutsumi S, Kaneko Y, Asao T y col. (2002). "La ADNasa I está presente en las principales células de los estómagos de humanos y ratas". Histochem. J . 33 (9-10): 531-5. doi : 10.1023 / A: 1014999624430 . PMID 12005024 . S2CID 10324827 .
enlaces externos
- desoxirribonucleasa + I en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .