Las Epsilonproteobacteria son una clase de Proteobacteria . [1] Todas las especies de esta clase son, como todas las proteobacterias, gramnegativas .
Epsilonproteobacteria | |
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Campylobacter | |
clasificación cientifica | |
Dominio: | Bacterias |
Filo: | Proteobacterias |
Clase: | Epsilonproteobacteria |
Pedidos | |
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Las Epsilonproteobacteria consisten en pocos géneros conocidos, principalmente Wolinella spp., Helicobacter spp. Y Campylobacter spp. La mayoría de las especies conocidas habitan el tracto digestivo de los animales y actúan como simbiontes ( Wolinella spp. En el ganado ) o patógenos ( Helicobacter spp. En el estómago, Campylobacter spp. En el duodeno). Muchas Epsilonproteobacteria son móviles con flagelos. [2]
También se han recuperado numerosas secuencias ambientales y aislados de Epsilonproteobacteria de respiraderos hidrotermales y hábitats de filtraciones frías . Ejemplos de cepas incluyen Sulfurimonas autotrophica , [3] Sulfurimonas paralvinellae , [4] Sulfurovum lithotrophicum [5] y profundicola Nautilia . [6] Un miembro de la clase Epsilonproteobacteria aparece como endosimbionte en las grandes branquias del caracol de aguas profundas Alviniconcha hessleri . [7]
Las Epsilonproteobacteria que se encuentran en los respiraderos hidrotermales de aguas profundas exhiben característicamente quimiolitotrofia, satisfaciendo sus necesidades energéticas oxidando azufre reducido, formiato o hidrógeno acoplado a la reducción de nitrato u oxígeno. [8] Las Epsilonproteobacterias autótrofas utilizan el ciclo inverso de Krebs para fijar el dióxido de carbono en biomasa, una vía que originalmente se pensó que tenía poca importancia ambiental. La sensibilidad al oxígeno de esta vía es consistente con su nicho microaerofílico o anaeróbico en estos ambientes, y su probable evolución en los océanos mesoproterozoicos , [9] que se cree que han sido sulfídicos con bajos niveles de oxígeno disponible a partir de la fotosíntesis de cianobacterias. [10]
Filogenia
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN) [11] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) [12] y la filogenia se basa en la versión 106 de LTP basada en rRNA 16S de 'The Proyecto de árboles vivos para todas las especies [13]
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Notas:
- Procariotas donde no hay cultivos puros ( axénicos ) aislados o disponibles, es decir, no cultivados o no pueden mantenerse en cultivo durante más de unos pocos pases en serie.
Referencias
- ^ "www.ncbi.nlm.nih.gov" . Consultado el 19 de marzo de 2009 .
- ^ Beeby, M (diciembre de 2015). "Motilidad en las épsilon-proteobacteria". Opinión actual en microbiología . 28 : 115-21. doi : 10.1016 / j.mib.2015.09.005 . hdl : 10044/1/27763 . PMID 26590774 .
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- ^ Inagaki, Fumio; Ken Takai; Kenneth H. Nealson; Koki Horikoshi (1 de septiembre de 2004). "Sulfurovum lithotrophicum gen. Nov., Sp. Nov., Un quimiolitoautótrofo oxidante de azufre novedoso dentro de las ε-proteobacterias aisladas de sedimentos hidrotermales de Okinawa Trough" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 54 (5): 1477–1482. doi : 10.1099 / ijs.0.03042-0 . ISSN 1466-5026 . PMID 15388698 .
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- ^ Suzuki, Yohey; Sasaki, Takenori; Suzuki, Masae; Nogi, Yuichi; Miwa, Tetsuya; Takai, Ken; Nealson, Kenneth H .; Horikoshi, Koki (2005). "Novela endosimbiosis quimioautotrófica entre un miembro de la Epsilonproteobacteria y el gasterópodo de ventilación hidrotermal Alviniconcha aff. Hessleri ( Gastropoda : Provannidae ) del Océano Índico" . Microbiología aplicada y ambiental . 71 (9): 5440–5450. doi : 10.1128 / AEM.71.9.5440-5450.2005 . PMC 1214688 . PMID 16151136 .
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- ^ JP Euzéby. "Epsilonproteobacteria" . Lista de nombres procariotas con posición en nomenclatura (LPSN). Archivado desde el original el 7 de octubre de 2011 . Consultado el 17 de noviembre de 2011 .
- ^ Sayers; et al. "Epsilonproteobacteria" . Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 5 de junio de 2011 .
- ^ Proyecto 'El árbol vivo de todas las especies' . "Lanzamiento 106 de LTP basado en rRNA 16S (árbol completo)" (PDF) . Silva Base de datos completa de ARN ribosómico . Consultado el 17 de noviembre de 2011 .
enlaces externos
- Epsilonproteobacteria en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .