La N -formilmetionina (fMet, [1] HCO-Met, [2] For-Met [2] ) es un derivado del aminoácido metionina en el quese ha añadido un grupo formilo al grupo amino . Se utiliza específicamente para el inicio de la síntesis de proteínas a partir de genes bacterianos y orgánulos , y se puede eliminar después de la traducción .
fMet juega un papel crucial en la síntesis de proteínas de bacterias, mitocondrias y cloroplastos . No se utiliza en la síntesis de proteínas citosólicas de eucariotas , donde se traducen genes nucleares eucariotas . Tampoco es utilizado por Archaea . En el cuerpo humano, el sistema inmunológico reconoce el fMet como material extraño, o como una señal de alarma emitida por las células dañadas, y estimula al cuerpo a luchar contra una posible infección.
El fMet es un residuo inicial en la síntesis de proteínas en bacterias y, en consecuencia, se encuentra en el extremo N del polipéptido en crecimiento . El fMet se administra al complejo ribosoma (30S) - ARNm mediante un ARNt especializado (ARNt fMet ) que tiene un anticodón 3'-UAC-5 ' que es capaz de unirse con el codón de inicio 5'-AUG-3' ubicado en el ARNm . Por tanto, fMet está codificado por el mismo codón que la metionina; sin embargo, AUG también es la traduccióncodón de iniciación. Cuando se usa el codón para la iniciación, se usa fMet en lugar de metionina, formando así el primer aminoácido a medida que se sintetiza la cadena peptídica . Cuando el mismo codón aparece más tarde en el ARNm, se usa metionina normal. Muchos organismos utilizan variaciones de este mecanismo básico.
La adición del grupo formilo a la metionina es catalizada por la enzima metionil-tRNA formiltransferasa . Esta modificación se realiza después de que la aminoacil-tRNA sintetasa haya cargado metionina en tRNA fMet .
La propia metionina se puede cargar en tRNA fMet o tRNA Met . Sin embargo, la transformilasa catalizará la adición del grupo formilo a la metionina solo si la metionina se ha cargado en tRNA fMet , no en tRNA Met .
El fMet N -terminal se elimina de la mayoría de las proteínas, tanto del huésped como recombinantes, mediante una secuencia de dos reacciones enzimáticas. Primero, el péptido deformilasa lo desformila, convirtiendo el residuo nuevamente en una metionina normal. Luego, la metionina aminopeptidasa (MAP) elimina el residuo de la cadena. [3]