Tétrada de guanina
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Ver también: G-quadruplex
G-quadruplex.svg
Izquierda: una tétrada de guanina con un catión central
Derecha: tres tétradas de guanina que contribuyen a la estructura de un G-quadruplex

En biología molecular, una tétrada de guanina (también conocida como tétrada G o cuarteto G ) es una estructura compuesta por cuatro bases de guanina en una matriz plana cuadrada . [1] [2] Contribuyen de manera más prominente a la estructura de los G-quadruplex , donde su enlace de hidrógeno estabiliza la estructura. [3] [4] Por lo general, hay al menos dos tétradas de guanina en un G-quadruplex, y a menudo presentan enlaces de hidrógeno al estilo de Hoogsteen . [1]

Las tétradas de guanina están formadas por secuencias ricas en guanina, como GGGGC. [5] También pueden desempeñar un papel en la dimerización de ARN no endógenos para facilitar la replicación de algunos virus. [5] Las tétradas de guanina se dimerizan a través de sus extremos 5 'ya que son energéticamente más favorables . [6]

Pueden estabilizarse mediante cationes centrales , como litio, sodio, potasio, rubidio o cesio . [7] [8] Sin embargo, todavía forman una variedad de estructuras diferentes. [1] Las tétradas de guanina no siempre son estables, pero la estructura de azúcar-fosfato del ADN puede ayudar a la estabilidad de las propias tétradas de guanina. [1] Las tétradas de guanina son más estables cuando se apilan, ya que las fuerzas intermoleculares entre cada capa ayudan a estabilizarlas. [9]

Las tétradas de guanina también pueden influir en la recombinación , replicación y transcripción. [1] [2] Por ejemplo, las tétradas de guanina se encuentran en la región promotora de la familia de oncogenes Myc . [10] También funcionan en el cambio de clases de inmunoglobulinas y pueden desempeñar un papel en el genoma del VIH . [11] Las tétradas de guanina aparecen con frecuencia en las regiones teloméricas del ADN. [3]

Ver también

  • G-quadruplex
  • Par de bases Hoogsteen
  • Heterocromatina
  • Regulación de la expresión génica
  • Guanina
  • Telómero

Referencias

  1. ^ a b c d e Kogut, Mateusz; Kleist, Cipriano; Czub, Jacek (20 de abril de 2016). "Las simulaciones de dinámica molecular revelan el equilibrio de fuerzas que gobiernan la formación de una tétrada de guanina, una unidad estructural común del ADN G-quadruplex" . Investigación de ácidos nucleicos . 44 (7): 3020–3030. doi : 10.1093 / nar / gkw160 . ISSN  1362-4962 . PMC  4838382 . PMID  26980278 .
  2. ^ a b Walsh, K .; Gualberto, A. (5 de julio de 1992). "MyoD se une a la estructura del ácido nucleico de la tétrada de guanina". La revista de química biológica . 267 (19): 13714-13718. ISSN 0021-9258 . PMID 1320026 .  
  3. ^ a b Sundquist, Wesley; Klug, Aaron (1989). "El ADN telomérico se dimeriza mediante la formación de tétradas de guanina entre bucles de horquilla". Naturaleza . 342 (6251): 825–829. Código Bibliográfico : 1989Natur.342..825S . doi : 10.1038 / 342825a0 . PMID 2601741 . S2CID 4357161 .  
  4. ^ Meyer, Michael; Brandl, Maria; Sühnel, Jürgen (1 de septiembre de 2001). "¿Se estabilizan las tetradas de guanina por enlaces de hidrógeno bifurcados?". El Journal of Physical Chemistry A . 105 (35): 8223–8225. Código Bibliográfico : 2001JPCA..105.8223M . doi : 10.1021 / jp011179i . ISSN 1089-5639 . 
  5. ^ a b Yu, H .; Iluminado.; Qiao, W .; Chen, Q .; Geng, Y. (2007). "La tétrada de guanina y la secuencia palindrómica juegan un papel crítico en la dimerización del ARN del virus espumoso bovino". Archivos de Virología . 152 (12): 2159–2167. doi : 10.1007 / s00705-007-1047-5 . ISSN 0304-8608 . PMID 17712597 . S2CID 19794444 .   
  6. ^ Kogut, Mateusz; Kleist, Cipriano; Czub, Jacek (20 de septiembre de 2019). "¿Por qué los G-quadruplex se dimerizan a través de los extremos 5 '? Fuerzas impulsoras para la dimerización del ADN G4 examinadas en detalle atómico" . PLOS Biología Computacional . 15 (9): e1007383. doi : 10.1371 / journal.pcbi.1007383 . ISSN 1553-734X . PMC 6774569 . PMID 31539370 .   
  7. ^ Azargun, Mohammad; Fridgen, Travis D. (30 de septiembre de 2015). "Tétradas de guanina: una espectroscopia IRMPD, SORI-CID de energía resuelta y estudio computacional de M (9-etilguanina) 4+ (M = Li, Na, K, Rb, Cs) en fase gaseosa". Física Química Física Química . 17 (39): 25778-25785. Código Bibliográfico : 2015PCCP ... 1725778A . doi : 10.1039 / C5CP00580A . ISSN 1463-9084 . PMID 25845669 .  
  8. ^ Fancui, Meng; Weiren, Xu; Chengbu, Liu (mayo de 2004). "Estudio teórico de la incorporación de 6-tioguanina en una tétrada de guanina y su influencia en el ión metálico de la tétrada de guanina". Letras de física química . 389 (4): 421–426. Código Bibliográfico : 2004CPL ... 389..421M . doi : 10.1016 / j.cplett.2004.03.128 .
  9. ^ Cj, Lech; B, Heddi; En, Phan (1 de febrero de 2013). "Apilamiento de base de guanina en ácidos nucleicos G-quadruplex" . Investigación de ácidos nucleicos . 41 (3): 2034–46. doi : 10.1093 / nar / gks1110 . PMC 3561957 . PMID 23268444 .  
  10. ^ Phan, Anh Tuân; Kuryavyi, Vitaly; Gaw, Hai Yan; Patel, Dinshaw J. (agosto de 2005). "Interacción de molécula pequeña con una estructura G-quadruplex de cinco tractos de guanina del promotor MYC humano" . Biología química de la naturaleza . 1 (3): 167-173. doi : 10.1038 / nchembio723 . ISSN 1552-4469 . PMC 4690526 . PMID 16408022 .   
  11. ^ Laughlan, Gerard; Murchie, Alastair; Norman, David (22 de julio de 1994). "La estructura cristalina de alta resolución de un tetraplejo de guanina de hebras paralelas" (PDF) . Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia . 265 (5171): 520–524. Bibcode : 1994Sci ... 265..520L . doi : 10.1126 / science.8036494 . JSTOR 2884414 . PMID 8036494 .   

enlaces externos

  • Mapeador QGRS
  • QuadBase2
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