La proteína del grupo de alta movilidad HMG-I / HMG-Y es una proteína que en humanos está codificada por el gen HMGA1 . [5] [6]
HMGA1 |
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![HMGA1.png](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7) |
Estructuras disponibles |
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PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
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Lista de códigos de identificación de PDB |
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2EZD , 2EZE , 2EZF , 2EZG |
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Identificadores |
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Alias | HMGA1 , HMG-R, HMGA1A, HMGIY, gancho AT 1 para grupos de alta movilidad |
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Identificaciones externas | OMIM : 600701 MGI : 96160 HomoloGene : 128226 GeneCards : HMGA1 |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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![Cromosoma 6 (humano)](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7) | Chr. | Cromosoma 6 (humano) [1] |
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| Banda | 6p21.31 | Comienzo | 34,236,873 pb [1] |
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Final | 34.246.231 pb [1] |
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Ubicación de genes ( ratón ) |
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![Cromosoma 17 (ratón)](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7) | Chr. | Cromosoma 17 (ratón) [2] |
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| Banda | 17 A3.3 | 17 14.5 cm | Comienzo | 27,556,497 pb [2] |
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Final | 27.563.674 pb [2] |
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Ontología de genes |
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Función molecular | • retinoide X unión al receptor • receptor de ácido retinoico de unión • enzima de unión • peroxisoma activado de unión al receptor proliferador • unión a ADN • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 actividad del activador de la transcripción de unión a ADN, ARN polimerasa II específica • actividad coactivadora del receptor nuclear • GO: 0001948 unión a proteínas • unión a cromatina • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 actividad del factor de transcripción de unión al ADN • 5'-desoxirribosa-5-fosfato liasa actividad • unión al factor de transcripción • ADN- (sitio apurínico o apirimidínico) actividad endonucleasa • GO: 0001158 unión al ADN específico de secuencia de la región reguladora cis • surco menor de unión al ADN rico en adenina-timina • GO: 0001200, GO: 0001133, GO : 0001201 actividad del factor de transcripción de unión al ADN, específico de la ARN polimerasa II • GO: 0001105 actividad coactivadora de la transcripción • constituyente estructural de la cromatina
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Componente celular | • núcleo • nucleoplasma • citosol • foco de heterocromatina asociado a la senescencia • cromosoma • adhesión focal • complejo regulador de la transcripción • cromatina • complejo regulador de la transcripción ARN polimerasa II
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Proceso biológico | • regulación negativa de la proliferación de la población de células • senescencia celular inducida por oncogenes • establecimiento de integrado proviral latencia • nucleosoma desmontaje • regulación de la transcripción, de plantilla de ADN • regulación positiva de la transcripción, de plantilla de ADN • regulación positiva de la transcripción por la ARN polimerasa II • positivo regulación de la senescencia celular • enfoque heterocromatina senescencia asociado-ensamblaje • regulación negativa de la transcripción, de plantilla de ADN • respuesta a virus • regulación negativa de silenciamiento de la cromatina • anulación de ADN implicada en la replicación de ADN • transcripción, de plantilla de ADN • la transcripción por la ARN polimerasa II • transporte nuclear • GO: 0022415 proceso viral • reparación de escisión de base • ensamblaje complejo que contiene proteínas
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Fuentes: Amigo / QuickGO |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | NM_002131 NM_145899 NM_145901 NM_145902 NM_145903
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NM_145904 NM_145905 NM_001319077 NM_001319078 NM_001319079 NM_001319080 NM_001319081 NM_001319082 |
| NM_001025427 NM_001039356 NM_001166535 NM_001166536 NM_001166537
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NM_001166539 NM_001166540 NM_001166541 NM_001166542 NM_001166543 NM_001166544 NM_001166545 NM_001166546 NM_016660 |
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RefSeq (proteína) | NP_001306006 NP_001306007 NP_001306008 NP_001306009 NP_001306010
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NP_001306011 NP_002122 NP_665906 NP_665908 NP_665909 NP_665910 NP_665912 |
| NP_001020598 NP_001034445 NP_001160007 NP_001160008 NP_001160009
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NP_001160011 NP_001160012 NP_001160013 NP_001160014 NP_001160015 NP_001160016 NP_001160017 NP_001160018 NP_057869 |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 6: 34,24 - 34,25 Mb | Crónicas 17: 27,56 - 27,56 Mb |
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Búsqueda en PubMed | [3] | [4] |
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Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
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Este gen codifica una proteína de cromatina no histona involucrada en muchos procesos celulares, incluida la regulación de la transcripción genética inducible, la replicación del ADN, la organización de la heterocromatina , la integración de retrovirus en los cromosomas y la progresión metastásica de las células cancerosas.
Proteínas HMGA1 son bastante pequeñas (~ 10-12 kDa) y moléculas básicas, y constan de tres AT-ganchos con el RGRP (Arg-Gly-Arg-Pro) núcleo motivo , una novela de reticulación dominio situado entre la segunda y tercera AT-hook y una cola ácida C-terminal característica de la familia HMG que comprende las proteínas HMGA, HMGB y HMGN.
Las proteínas de fusión HMGA1-GFP son altamente dinámicas in vivo (determinadas mediante análisis FRAP ), pero por el contrario también muestran afinidad nanomolar por el ADN rico en AT in vitro (determinado bioquímicamente), lo que podría explicarse debido a las extensas modificaciones postranscripcionales in vivo. . HMGA1 se une preferentemente al surco menor de las regiones ricas en AT en el ADN bicatenario utilizando sus ganchos AT. Tiene poca estructura secundaria en solución, pero asume distintas conformaciones cuando se une a sustratos como el ADN u otras proteínas. Las proteínas HMGA1 tienen altas cantidades de diversas modificaciones postraduccionales y se localizan principalmente en el núcleo, especialmente en la heterocromatina, pero también en las mitocondrias y el citoplasma.
Recientemente se ha demostrado que las proteínas HMGA1, HMGA1a y HMGA1b, pueden entrecruzar las fibras de ADN in vitro y pueden inducir la agrupación de cromatina in vivo, lo que sugiere un papel estructural de las proteínas HMGA1 en la organización de la heterocromatina. [7]
Se han encontrado al menos siete variantes de transcripción que codifican dos isoformas diferentes (HMGA1a, HMGA1b) para este gen. [8] La variante de empalme HMGA1c con solo dos ganchos AT y sin cola ácida está en discusión para ser un miembro real de la familia HMGA.
Los ratones que carecen de su variante de HMGA1 , es decir, ratones Hmga1 - / - , son diabéticos , muestran una hipertrofia cardíaca y expresan niveles bajos del receptor de insulina . [9]
Se ha demostrado que HMGA1 interactúa con CEBPB [10] y el factor de transcripción Sp1 . [10]
- HMGA1 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- Descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : P17096 (proteína del grupo de alta movilidad HMG-I / HMG-Y) en el PDBe-KB .
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .