En taxonomía , Methanopyrus es un género de Methanopyraceae . [1]
Methanopyrus | |
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Género: | Methanopyrus |
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Methanopyrus Kurr y col. 1992 | |
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Methanopyrus es un género de metanógeno , con una sola especie descrita, M. kandleri . Es un hipertermófilo , descubierto en la pared de un fumador negro del Golfo de California a una profundidad de 2000 m, a temperaturas de 84-110 ° C. La cepa 116 se descubrió en el líquido ahumador negro del campo hidrotermal de Kairei; puede sobrevivir y reproducirse a 122 ° C. [2] Vive en un ambiente rico en hidrógeno y dióxido de carbono y, al igual que otros metanógenos, reduce este último a metano . Se coloca entre los Euryarchaeota , en su propia clase.
Estructura celular
Methanopyrus kandleri es un metanógeno en forma de varilla que produce metano al reducir el dióxido de carbono . [3] [4]
Methanopyrus kandleri es diferente de otras arqueas porque todavía tiene una de las versiones más simples de lípidos de membrana. [3] La membrana de M. kandleri está formada por lípidos terpenoides, que es un grupo de lípidos que contienen colesterol , hopanoides , carotenoides , fitano y bisfitano. [5] Aunque los terpenoides son el componente principal de la membrana en M. kandleri , son más una estructura de soporte en eucariotas y bacterias . [5]
Methanopyrus kandleri tiene una alta concentración de 2,3-difosfoglicerato cíclico. [3] Este compuesto se encuentra a menudo en hipertermófilos , lo que ayuda a prevenir la desnaturalización de las proteínas a altas temperaturas. [6] La mayor concentración de 2,3-difosfoglicerato cíclico protege el metanógeno, ayudándolo a sobrevivir en un entorno que muchos otros organismos no podrían. Más allá de este compuesto para ayudar a proteger las proteínas, M. kandleri también tiene una alta concentración de sal dentro de su membrana. [3] Esta mayor concentración de sal ayuda a la estabilidad de las enzimas y promueve la actividad de las enzimas a temperaturas más altas. [7]
Genómica
El genoma completo de Methanopyrus kandleri fue secuenciado por investigadores de Fidelity Systems. Se determinó que era un genoma rico en GC que contenía 1.694.969 nucleótidos de los cuales aproximadamente el 62,1% es guanina o citosina . [3] En general, el genoma de M. kandleri se considera "minimalista" porque se han transferido muy pocos genes de otros organismos a su propio genoma. Esto podría deberse al entorno extremo en el que vive y al bajo número de transferencias potenciales que podría tener debido a él. [3]
Investigar
Methanopyrus kandleri es también la única especie que se sabe que tiene topoisomerasa 5. La topoisomerasa 5 permite que M. kandleri sobreviva a temperaturas tan altas y ayuda a relajar el ADN superenrollado tanto positiva como negativamente . [8] Aunque la topoisomerasa 5 es útil en este caso, ha resultado difícil encontrar otros hipertermófilos que tengan topoisomerasa 5. Debido a esto, se están realizando más investigaciones para comprender completamente cómo M. kandleri obtuvo la topoisomerasa 5 y por qué ningún otro hipertermófilo la tiene.
Referencias
- ^ Consulte la página web del NCBI sobre Methanopyrus . Datos extraídos de los "recursos taxonómicos del NCBI" . Centro Nacional de Información Biotecnológica . Consultado el 19 de marzo de 2007 .
- ^ Takai K, Nakamura K, Toki T, Tsunogai U, Miyazaki M, Miyazaki J, et al. (Agosto de 2008). "Proliferación celular a 122 grados C y producción de CH4 isotópicamente pesada por un metanógeno hipertermófilo bajo cultivo a alta presión" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 105 (31): 10949–54. Código bibliográfico : 2008PNAS..10510949T . doi : 10.1073 / pnas.0712334105 . PMC 2490668 . PMID 18664583 .
- ^ a b c d e f Slesarev AI, Mezhevaya KV, Makarova KS, Polushin NN, Shcherbinina OV, Shakhova VV, et al. (Abril de 2002). "El genoma completo de hipertermófilo Methanopyrus kandleri AV19 y monofilia de metanógenos arqueales" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 99 (7): 4644–9. doi : 10.1073 / pnas.032671499 . PMID 11930014 .
- ^ "Euryarchaeota | Microbiología ilimitada" . cursos.lumenlearning.com . Consultado el 23 de abril de 2021 .
- ^ a b Nakatani Y, Ribeiro N, Streiff S, Gotoh M, Pozzi G, Désaubry L, Milon A (septiembre de 2014). "Búsqueda de las membranas más 'primitivas' y sus reforzadores: una revisión de la teoría de los fosfatos de poliprenilo" . Orígenes de la vida y evolución de la biosfera . 44 (3): 197–208. doi : 10.1007 / s11084-014-9365-6 . PMC 4669544 . PMID 25351682 .
- ^ "InterPro" . www.ebi.ac.uk . Consultado el 23 de abril de 2021 .
- ^ Breitung J, Börner G, Scholz S, Linder D, Stetter KO, Thauer RK (diciembre de 1992). "Dependencia de la sal, propiedades cinéticas y mecanismo catalítico de N-formilmetanofurano: tetrahidrometanopterina formiltransferasa del termófilo extremo Methanopyrus kandleri" . Revista europea de bioquímica . 210 (3): 971–81. doi : 10.1111 / j.1432-1033.1992.tb17502.x . PMID 1483480 .
- ^ Forterre P (junio de 2006). "ADN topoisomerasa V: un nuevo pliegue de origen misterioso". Tendencias en biotecnología . 24 (6): 245–7. doi : 10.1016 / j.tibtech.2006.04.006 . PMID 16650908 .
Otras lecturas
- Schacherl M, Waltersperger S, Baumann U (diciembre de 2013). "Caracterización estructural de la quinasa MK0840 de la superfamilia ASKHA de tipo ribonucleasa H de Methanopyrus kandleri". Acta Crystallographica. Sección D, Cristalografía biológica . 69 (Parte 12): 2440–50. doi : 10.1107 / S0907444913022683 . PMID 24311585 .
- Su AA, Tripp V, Randau L (julio de 2013). "Los análisis de RNA-Seq revelan el orden de los eventos de procesamiento del tRNA y la maduración de la caja C / D y los RNA CRISPR en el hipertermófilo Methanopyrus kandleri" . Investigación de ácidos nucleicos . Prensa de la Universidad de Oxford . 41 (12): 6250–8. doi : 10.1093 / nar / gkt317 . PMC 3695527 . PMID 23620296 .
- Kurr M, Huber R, König H, Jannasch HW, Fricke H, Trincone A, Kristjansson JK, Stetter KO (septiembre de 1991). "Methanopyrus kandleri, gen. Y sp. Nov. Representa un grupo novedoso de metanógenos hipertermófilos, que crece a 110 ° C". Archivos de Microbiología . 156 (4): 239–247. doi : 10.1007 / BF00262992 .
- Huber R; Stetter KO (2001). "Familia I. Methanopyralceae fam. Nov.". En DR Boone; RW Castenholz (eds.). Manual de Bergey de Bacteriología Sistemática Volumen 1: Las arqueas y las bacterias fototróficas y de ramificación profunda (2ª ed.). Nueva York: Springer Verlag . pag. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2.
Bases de datos científicas
- Referencias de PubMed para Methanopyrus
- Referencias de PubMed Central para Methanopyrus
- Referencias de Google Scholar para Methanopyrus
enlaces externos
- Página de taxonomía del NCBI para Methanopyrus
- Busque en las páginas de taxonomía del Árbol de la Vida Methanopyrus
- Búsqueda de la página Species2000 para Methanopyrus
- Página de MicrobeWiki para Methanopyrus
- Página LPSN para Methanopyrus
- Tipo de cepa de Methanopyrus kandleri en Bac Dive - the Bacterial Diversity Metadatabase