Myoviridae es una familia de bacteriófagos del orden Caudovirales . Las bacterias y las arqueas sirven como huéspedes naturales. Hay 625 especies en esta familia, asignadas a ocho subfamilias y 217 géneros. [1] [2]
Myoviridae | |
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Imagen TEM de un virión Synechococcus Phage S-PM2 | |
Clasificación de virus | |
(no clasificado): | Virus |
Reino : | Duplodnaviria |
Reino: | Heunggongvirae |
Filo: | Uroviricota |
Clase: | Caudoviricetes |
Pedido: | Caudovirales |
Familia: | Myoviridae |
Subfamilias y géneros | |
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Subdivisiones
La subfamilia Tevenvirinae (sinónimo: Tequatrovirinae ) lleva el nombre de su especie tipo Enterobacteria fago T4 . Los miembros de esta subfamilia son morfológicamente indistinguibles y tienen cabezas moderadamente alargadas de aproximadamente 110 nanómetros (nm) de longitud, colas de 114 nm de largo con un collar, placas base con picos cortos y seis fibras de cola largas y retorcidas. Los géneros dentro de esta subfamilia se dividen sobre la base de la morfología de la cabeza, teniendo el género Tequatrovirus (Nombre provisional: T4virus ) una longitud de la cabeza de 137 nm y los del género Schizot4virus de 111 nm de longitud. Dentro de los géneros sobre la base de la homología de proteínas, las especies se han dividido en varios grupos.
La subfamilia Peduovirinae tiene viriones con cabezas de 60 nm de diámetro y colas de 135 × 18 nm. Estos fagos se identifican fácilmente porque las vainas contraídas tienden a deslizarse fuera del núcleo de la cola. El fago P "es la especie tipo.
La subfamilia Spounavirinae son todos fagos virulentos de amplio rango de huéspedes que infectan a miembros de Firmicutes . Poseen cabezas isométricas de 87-94 nm de diámetro y capsómeros conspicuos , colas estriadas de 140-219 nm de largo y una placa base doble. En la punta de la cola hay estructuras globulares que ahora se sabe que son las puntas de la placa base y fibras cortas de la cola retorcidas con simetría de seis veces. Los miembros de este grupo suelen poseer genomas no permutados grandes (127 a 142 kb) con redundancias terminales de 3,1 a 20 kb. El nombre de esta subfamilia se deriva de SPO más una (en latín uno).
Los halovirus HF1 y HF2 pertenecen al mismo género, pero dado que infectan arqueas en lugar de bacterias, es probable que se coloquen en un género separado una vez que se haya establecido su clasificación. [3]
Se ha propuesto un grupo enano por razones morfológicas y genómicas. Este grupo incluye los fagos Aeromonas salmonicida fago 56, Vibrio cholerae fagos 138 y CP-T1, Bdellovibrio fago φ1422 y Pectobacterium carotovorum fago ZF40. [4] Sus características compartidas incluyen una morfología de virión idéntica, caracterizada por colas contráctiles generalmente cortas y todos tienen tamaños de genoma de aproximadamente 45 kilobases. El orden de los genes en la unidad estructural del genoma es el siguiente: terminaasa, portal, cabeza, cola, placa base, fibras de la cola.
Virología
Los virus en Myoviridae no están envueltos, con geometrías cabeza-cola (con cuello). Los genomas son ADN lineales de doble hebra, de alrededor de 33-244 kb de longitud. El genoma codifica de 40 a 415 proteínas. [1] Tiene secuencias terminalmente redundantes. El contenido de GC es ~ 35%. El genoma codifica 200-300 proteínas que se transcriben en operones. La 5-hidroximetilcitosina puede estar presente en el genoma (en lugar de timidina ).
La cola tubular tiene simetría helicoidal y tiene un diámetro de 16-20 nm. Consiste en un tubo central, una vaina contráctil, un collar, una placa base, seis pines de cola y seis fibras largas. Es similar a Tectiviridae , pero difiere en el hecho de que la cola de un myovirus es permanente.
Las contracciones de la cola requieren ATP . Al contraerse la vaina, las subunidades de la vaina se deslizan una sobre la otra y la cola se acorta a 10-15 nm de longitud.
Ciclo vital
Al adherirse a una célula huésped, el virus usa su vaina contráctil como una jeringa, perforando la pared celular con su tubo central e inyectando el material genético en el huésped. El ADN inyectado se hace cargo de los mecanismos de transcripción y traducción de la célula huésped y comienza a fabricar nuevos virus. La replicación sigue el modelo de transposición replicativa. La transcripción con plantilla de ADN es el método de transcripción. La traducción se realiza mediante un desplazamiento del marco ribosómico -1 . El virus sale de la célula huésped por lisis y proteínas holina / endolisina / spanina . Las bacterias y las arqueas sirven como hospedadores naturales. La ruta de transmisión es la difusión pasiva . [1]
Aunque los miovirus son en general líticos y carecen de los genes necesarios para volverse lisogénicos , se conocen varias especies de zonas templadas .
Aplicaciones
Debido a que la mayoría de los Myoviridae son fagos líticos, en lugar de templados, algunos investigadores han investigado su uso como terapia para enfermedades bacterianas en humanos y otros animales. [6]
Taxonomía
Se reconocen las siguientes ocho subfamilias: [2]
- Emmerichvirinae
- Eucampyvirinae
- Gorgonvirinae
- Ounavirinae
- Peduovirinae
- Tevenvirinae
- Twarogvirinae
- Vequintavirinae
Además, los siguientes géneros no están asignados a una subfamilia: [2]
- Abouovirus
- Acionnavirus
- Agricanvirus
- Ahtivirus
- Alcyoneusvirus
- Alexandravirus
- Anamdongvirus
- Anaposvirus
- Aokuangvirus
- Asteriusvirus
- Atlauavirus
- Aurunvirus
- Ayohtrevirus
- Baikalvirus
- Bakolyvirus
- Barbavirus
- Bcepfunavirus
- Bcepmuvirus
- Becedseptimavirus
- Bellamyvirus
- Bendigovirus
- Biquartavirus
- Bixzunavirus
- Borockvirus
- Brigitvirus
- Brizovirus
- Brunovirus
- Busanvirus
- Carpasinavirus
- Chakrabartyvirus
- Caribdisvirus
- Chiangmaivirus
- Colneyvirus
- Cymopoleiavirus
- Derbicusvirus
- Dibbivirus
- Donellivirus
- Elmenteitavirus
- Elvirus
- Emdodecavirus
- Eneladusvirus
- Eponavirus
- Erskinevirus
- Eurybiavirus
- Ficleduovirus
- Flaumdravirus
- Fukuivirus
- Gofduovirus
- Goslarvirus
- Haloferacalesvirus
- Hapunavirus
- El virus de Heilongjiang
- Japetovirus
- Yodovirus
- Ionavirus
- Jedunavirus
- Jilinvirus
- Jimmervirus
- Kanagawavirus
- Kanaloavirus
- Klausavirus
- Kleczkowskavirus
- Kungbxnavirus
- Kylevirus
- Lagaffevirus
- Leucotheavirus
- Libanvirus
- Lietduovirus
- Lirvirus
- Virus de Loughborough
- Lubbockvirus
- Machinavirus
- Marfavirus
- Marthavirus
- Mazuvirus
- Menderavirus
- Metrivirus
- Mieseafarmvirus
- Mimasvirus
- Moabitavirus
- Moturavirus
- Muldoonvirus
- Mushuvirus
- Muvirus
- Mioalterovirus
- Miohalovirus
- Myosmarvirus
- Naesvirus
- Namakavirus
- Nankokuvirus
- Virus de neptuno
- Nereovirus
- Nerrivikvirus
- Nodensvirus
- Noxifervirus
- Nylescharonvirus
- Obolenskvirus
- Otagovirus
- Pakpunavirus
- Palemonvirus
- Pbunavirus
- Turbavirus
- Pemunavirus
- Petsuvirus
- Phabquatrovirus
- Fapecoctavirus
- Phikzvirus
- Pippivirus
- Plaisancevirus
- Plateaulakevirus
- Polibotosvirus
- Pontusvirus
- Popoffvirus
- Punavirus
- Qingdaovirus
- Rahariannevirus
- Radnorvirus
- Ripduovirus
- Risingsunvirus
- Ronodorvirus
- Virus de Rosemount
- Saclayvirus
- Saintgironsvirus
- Salacisavirus
- Salmondvirus
- Sarumanvirus
- Sasquatchvirus
- Schmittlotzvirus
- Seúlvirus
- Virus de Shandong
- Sherbrookevirus
- Shirahamavirus
- Shalavirus
- Svunavirus
- Tabernariusvirus
- Takahashivirus
- Tamkungvirus
- Taranisvirus
- Tefnutvirus
- Tegunavirus
- Thaumasvirus
- Thetisvirus
- Thornevirus
- Tijeunavirus
- Toutatisvirus
- Tulanevirus
- Vellamovirus
- Vhmlvirus
- Vibakivirus
- Wellingtonvirus
- Wifcevirus
- Winklervirus
- Yokohamavirus
- Yoloswagvirus
- Yongloolinvirus
Referencias
- ^ a b c "Zona viral" . EXPASY . Consultado el 1 de julio de 2015 .
- ^ a b c "Taxonomía de virus: versión 2020" . Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV). Marzo de 2021 . Consultado el 11 de mayo de 2021 .
- ^ Tang, SL; Nuttall, S; Dyall-Smith, M (2004). "Halovirus HF1 y HF2: evidencia de un evento de recombinación reciente y grande" . J Bacteriol . 186 (9): 2810–7. doi : 10.1128 / JB.186.9.2810-2817.2004 . PMC 387818 . PMID 15090523 .
- ^ Comeau, AM; Tremblay, D; Moineau, S; Rattei, T; Kushkina, AI; Tovkach, FI; Krisch, HM; Ackermann, HW (2012). "La morfología del fago recapitula la filogenia: la genómica comparativa de un nuevo grupo de miovirus" . PLOS ONE . 7 (7): e40102. doi : 10.1371 / journal.pone.0040102 . PMC 3391216 . PMID 22792219 .
- ^ J. Bernard Heymann, Bing Wang, William W.Newcomb, Weimin Wu, Dennis C.Winkler, Naiqian Cheng, Erin R. Reilly, Ru-Ching Hsia, Julie A. Thomas, Alasdair C. Steven: La cápside moteada de la Salmonella Giant Phage SPN3US, un intermedio de maduración probable con una nueva capa interna. En: Virus 2020, 12 (9). Número especial de fagos gigantes o gigantes , 910. doi: 10.3390 / v12090910 .
- ^ Capparelli, Rosanna; et al. (Agosto de 2007). "Terapia de fagos experimental contra Staphylococcus aureus en ratones" . Agentes antimicrobianos y quimioterapia . 51 (8): 2765–73. doi : 10.1128 / AAC.01513-06 . PMC 1932491 . PMID 17517843 .
enlaces externos
- Zona viral : Myoviridae
- ICTV
- Genomas completos de Myoviridae