La subunidad alfa del factor de transcripción nuclear Y es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen NFYA . [5] [6]
NFYA | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | NFYA , CBF-A, CBF-B, HAP2, NF-YA, factor de transcripción nuclear Y subunidad alfa | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 189903 MGI : 97316 HomoloGene : 32114 GeneCards : NFYA | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 6: 41,07 - 41,1 Mb | Crónicas 17: 48,39 - 48,41 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
La proteína codificada por este gen es una subunidad de un complejo trimérico NF-Y, que forma un factor de transcripción altamente conservado que se une a motivos CCAAT en las regiones promotoras en una variedad de genes. [7] La subunidad NFYA se asocia con un dímero compacto compuesto por las subunidades NFYB y NFYC, lo que da como resultado un trímero que se une al ADN con alta especificidad y afinidad. Las interacciones específicas de secuencia del complejo son realizadas por la subunidad NFYA, lo que sugiere un papel como subunidad reguladora. Además, existe evidencia de regulación postranscripcional en este producto génico, ya sea por degradación de proteínas o control de la traducción. La regulación adicional está representada por un empalme alternativo en el dominio de activación rico en glutamina, con claras preferencias específicas de tejido para las dos isoformas. [8]
El complejo NF-Y sirve como factor pionero al promover la accesibilidad a la cromatina para facilitar otros factores de transcripción específicos del tipo de células de co-localización. [9]
NF-Y también se ha implicado como un actor central en la selección del sitio de inicio de la transcripción (TSS) en animales . [10] Protege la integridad de la región empobrecida del nucleosoma y la localización del PIC en los promotores de genes que codifican proteínas .
Interacciones
Se ha demostrado que NFYA interactúa con el factor de respuesta sérico [11] y ZHX1 . [11] [12] NFYA, NFYB y NFYC forman el complejo NFY y se ha demostrado que el complejo NFY sirve como un factor pionero al promover la accesibilidad a la cromatina para facilitar otros factores de transcripción específicos del tipo de células de co-localización. [7]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000001167 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000023994 - Ensembl , mayo de 2017
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- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
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- ^ a b Oldfield AJ, Yang P, Conway AE, Cinghu S, Freudenberg JM, Yellaboina S, Jothi R (septiembre de 2014). "La proteína de dominio de pliegues de histonas NF-Y promueve la accesibilidad de la cromatina para factores de transcripción maestros específicos del tipo de célula" . Célula molecular . 55 (5): 708-22. doi : 10.1016 / j.molcel.2014.07.005 . PMC 4157648 . PMID 25132174 .
- ^ "Entrez Gene: factor de transcripción nuclear NFYA Y, alfa" .
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- ^ Oldfield AJ, Henriques T, Burkholder AB, Paulet D, Cinghu S, Yang P, Scruggs BS, Lavender CA, Kumar D, Bennett B, Rivals E (11 de julio de 2019). "NF-Y controla la fidelidad de la iniciación de la transcripción en los promotores de genes mediante el mantenimiento de la región empobrecida en nucleosomas" . Comunicaciones de la naturaleza . 10 (1): 3072. Bibcode : 2019NatCo..10.3072O . doi : 10.1038 / s41467-019-10905-7 . PMC 6624317 . PMID 31296853 .
- ^ a b Yamada K, Osawa H, Granner DK (octubre de 1999). "Identificación de proteínas que interactúan con NF-YA" . Cartas FEBS . 460 (1): 41–5. doi : 10.1016 / S0014-5793 (99) 01311-3 . PMID 10571058 . S2CID 28576187 .
- ^ Yamada K, Printz RL, Osawa H, Granner DK (agosto de 1999). "ZHX1 humano: clonación, ubicación cromosómica e interacción con el factor de transcripción NF-Y". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 261 (3): 614-21. doi : 10.1006 / bbrc.1999.1087 . PMID 10441475 .
Otras lecturas
- Mantovani R (octubre de 1999). "La biología molecular del factor de unión a CCAAT NF-Y". Gene . 239 (1): 15-27. doi : 10.1016 / S0378-1119 (99) 00368-6 . PMID 10571030 .
- Li XY, Mantovani R, Hooft van Huijsduijnen R, Andre I, Benoist C, Mathis D (marzo de 1992). "Variación evolutiva del factor de transcripción NF-Y de unión a CCAAT" . Investigación de ácidos nucleicos . 20 (5): 1087–91. doi : 10.1093 / nar / 20.5.1087 . PMC 312095 . PMID 1549471 .
- Li XY, Hooft van Huijsduijnen R, Mantovani R, Benoist C, Mathis D (mayo de 1992). "Organización intrón-exón de los genes NF-Y. El empalme específico de tejido modifica un dominio de activación" . La Revista de Química Biológica . 267 (13): 8984–90. doi : 10.1016 / S0021-9258 (19) 50377-5 . PMID 1577736 .
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enlaces externos
- NFYA + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- FactorBook NF-YA
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .