Otoferlin es una proteína que en humanos está codificada por el gen OTOF . [5] [6] [7]
OTOF | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | OTOF , AUNB1, DFNB6, DFNB9, FER1L2, NSRD9, otoferlin | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 603681 MGI : 1891247 HomoloGene : 12892 GeneCards : OTOF | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 2: 26,46 - 26,56 Mb | Crónicas 5: 30,37 - 30,46 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
Las mutaciones en este gen son una causa de sordera recesiva no sindrómica neurosensorial , DFNB9. La forma corta de la proteína codificada tiene tres dominios C2, un solo dominio transmembrana carboxi-terminal que se encuentra también en el factor de espermatogénesis de C. elegans FER-1 y la disferlina humana , mientras que la forma larga tiene seis dominios C2. Las proteínas homólogas de otoferlina en humanos que se ha demostrado que están asociadas con enfermedades humanas son la disferlina y la mioferlina. Tanto la disferlina como la mioferlina tienen siete dominios C2. C2A en la forma más larga de otoferlin con seis dominios C2 es estructuralmente similar a la disferlina C2A. Sin embargo, el bucle 1 en el sitio de unión al calcio de la otoferlina C2A es significativamente más corto que el bucle homólogo en los dominios de disferlina y mioferlina C2A. Por lo tanto, es incapaz de unirse al calcio. Otoferlin C2A tampoco puede unirse a fosfolípidos y, por lo tanto, es estructural y funcionalmente diferente de otros dominios C2. [8] La homología sugiere que esta proteína puede estar involucrada en la fusión de la membrana vesicular . De manera similar a la disferlina y la mioferlina, la otoferlina tiene un dominio FerA y se ha demostrado que su dominio FerA interactúa con lípidos de ion híbrido de una manera dependiente del calcio y con lípidos cargados negativamente de forma independiente del calcio. [9] La carga estimada del dominio FerA entre las proteínas ferlin varía significativamente. A pH 7, la carga estimada de disferlina es -8,4 mientras que la otoferlina FerA es +8,5. [9] Se han encontrado varias variantes de transcripción que codifican múltiples isoformas para este gen. [7]
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000115155 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000062372 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Yasunaga S, Grati M, Cohen-Salmon M, El-Amraoui A, Mustapha M, Salem N, El-Zir E, Loiselet J, Petit C (abril de 1999). "Una mutación en OTOF, que codifica otoferlin, una proteína similar a FER-1, causa DFNB9, una forma no sindrómica de sordera". Genética de la naturaleza . 21 (4): 363–9. doi : 10.1038 / 7693 . PMID 10192385 . S2CID 19269361 .
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- ^ a b "Entrez Gene: OTOF otoferlin" .
- ^ Helfmann S, Neumann P, Tittmann K, Moser T, Ficner R, Reisinger E (febrero de 2011). "La estructura cristalina del dominio C₂A de otoferlin revela una región de bucle superior no convencional". Revista de Biología Molecular . 406 (3): 479–90. doi : 10.1016 / j.jmb.2010.12.031 . PMID 21216247 .
- ^ a b Harsini FM, Chebrolu S, Fuson KL, White MA, Rice AM, Sutton RB (julio de 2018). "FerA es un dominio de paquete de cuatro hélices de asociación de membrana en la familia Ferlin de proteínas de fusión de membrana" . Informes científicos . 8 (1): 10949. doi : 10.1038 / s41598-018-29184-1 . PMC 6053371 . PMID 30026467 .
enlaces externos
- Entrada de GeneReviews / NCBI / NIH / UW sobre la sordera relacionada con OTOF
Otras lecturas
- Fukushima K, Ramesh A, Srisailapathy CR, Ni L, Wayne S, O'Neill ME, Van Camp G, Coucke P, Jain P, Wilcox ER, Smith SD, Kenyon JB, Zbar RI, Smith RJ (octubre de 1995). "Una forma autosómica recesiva no sindrómica de mapas de pérdida auditiva neurosensorial a 3p-DFNB6" . Investigación del genoma . 5 (3): 305–8. doi : 10.1101 / gr.5.3.305 . PMID 8593615 .
- Yasunaga S, Petit C (mayo de 2000). "Mapa físico de la región que rodea el locus OTOFERLIN en el cromosoma 2p22-p23". Genómica . 66 (1): 110–2. doi : 10.1006 / geno.2000.6185 . PMID 10843812 .
- Adato A, Raskin L, Petit C, Bonne-Tamir B (junio de 2000). "Heterogeneidad de la sordera en un aislado druso de Oriente Medio: mutaciones novedosas de OTOF y PDS, baja prevalencia de la mutación GJB2 35delG e indicación de un nuevo locus DFNB" . Revista europea de genética humana . 8 (6): 437–42. doi : 10.1038 / sj.ejhg.5200489 . PMID 10878664 .
- Yasunaga S, Grati M, Chardenoux S, Smith TN, Friedman TB, Lalwani AK, Wilcox ER, Petit C (septiembre de 2000). "OTOF codifica múltiples isoformas largas y cortas: evidencia genética de que las largas subyacen a la sordera recesiva DFNB9" . Revista Estadounidense de Genética Humana . 67 (3): 591–600. doi : 10.1086 / 303049 . PMC 1287519 . PMID 10903124 .
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- Varga R, Avenarius MR, Kelley PM, Keats BJ, Berlin CI, Hood LJ, Morlet TG, Brashears SM, Starr A, Cohn ES, Smith RJ, Kimberling WJ (julio de 2006). "Mutaciones OTOF reveladas por análisis genético de familias con pérdida auditiva, incluido un posible alelo de neuropatía auditiva sensible a la temperatura" . Revista de Genética Médica . 43 (7): 576–81. doi : 10.1136 / jmg.2005.038612 . PMC 2593030 . PMID 16371502 .
- Roux I, Safieddine S, Nouvian R, Grati M, Simmler MC, Bahloul A, Perfettini I, Le Gall M, Rostaing P, Hamard G, Triller A, Avan P, Moser T, Petit C (octubre de 2006). "Otoferlin, defectuoso en forma de sordera humana, es esencial para la exocitosis en la sinapsis de la cinta auditiva". Celular . 127 (2): 277–89. doi : 10.1016 / j.cell.2006.08.040 . PMID 17055430 . S2CID 15233556 .