Ostreococcus tauri es una especie unicelular de alga verde marina de aproximadamente 0,8 micrómetros (μm) de diámetro, el eucariota de vida libre más pequeño (no simbiótico )descrito hasta ahora. Tiene una ultraestructura muy simpley un genoma compacto.
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Como miembro común de las poblaciones de picoplancton oceánico global , este organismo tiene un papel importante en el ciclo del carbono en muchas áreas. Recientemente, O. tauri ha sido objeto de estudios utilizando genómica comparativa y genómica funcional , [1] [2] [3] [4] ya que es de interés para los investigadores debido a su genoma compacto y linaje verde.
Historia
Ostreococcus tauri fue descubierto en 1994 en la laguna Thau , Francia , en un estudio de un año de la población de picoplancton de la laguna utilizando citometría de flujo . Se descubrió que O. tauri era el componente principal de la población de picoplancton en la laguna, y las imágenes de células producidas por microscopía electrónica de transmisión revelaron las células eucariotas de vida libre más pequeñas descritas hasta ahora. [5] O. tauri se colocó inmediatamente en la clase Prasinophyceae basado en la presencia de características de clorofila pigmentos y Chlorophyceae Relacionados con carotenoides , [5] y esta clasificación se confirmó por el trabajo posterior. [6] [7]
Anatomía
Las células son aproximadamente esféricas ( cocoides ), con un promedio de aproximadamente 1 μm de largo por 0,7 μm de ancho. La ultraestructura de la célula es muy simple, carece de pared celular y consta de un núcleo , una sola mitocondria , un solo cloroplasto y un solo aparato de Golgi . [5] Las células también carecen de flagelos .
Inicialmente descrito como que contiene 14 cromosomas, [7] ahora se sabe que el núcleo contiene 20 cromosomas [ cita requerida ] , en total alrededor de 33 fg de ADN . [5]
Ecología
Ostreococcus tauri es la especie de alga dominante, por abundancia de células, en la laguna de Thau en el sur de Francia. Las condiciones que se cree que conducen a este dominio son, en primer lugar, que la laguna se utiliza para el cultivo intensivo de moluscos y, en segundo lugar, que los niveles de cobre en la laguna son altos. La primera consideración selecciona las células más pequeñas ( picoplancton ); Las especies eucariotas más grandes de algas y muchos depredadores de algas más pequeñas son consumidas preferentemente por los moluscos, que se alimentan por filtración . La segunda consideración selecciona contra las cianobacterias , ya que se cree que O. tauri hace frente mejor a las "condiciones adversas". Se cree que el exceso de cobre en la laguna proviene de productos químicos agrícolas utilizados por los viñedos circundantes . [8]
Utilizar como organismo modelo
Ya en 1998, O. tauri fue identificado como "un buen candidato para modelos biológicos como estudios de división celular y / o secuenciación del genoma". [7]
Genómica
En 2006, el genoma de O. tauri fue secuenciado por Derelle et al. . [1] El genoma de 12,56 Mb organizado en 20 cromosomas mostró una densidad genética extrema y pocos genes que contienen intrones . Se identificaron dos cromosomas con características periféricas (contenido de G + C, estructura intrónica ), a saber, el cromosoma 2 y el cromosoma 19. La secuenciación de otras especies del orden Mamiellales mostró la aparición de cromosomas periféricos similares en otras especies ( O. lucimarinus , [2] Micromonas pusilla [9] y B. prasinos [10] ).
Referencias
- ↑ a b Derelle, E., Ferraz, C., Rombauts, S., Rouzé, P., Worden, AZ, Robbens, S.,… Moreau, H. (2006). El análisis del genoma del eucariota Ostreococcus tauri más pequeño de vida libre revela muchas características únicas. Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América, 103 (31), 11647–52. http://doi.org/10.1073/pnas.0604795103
- ↑ a b Palenik, B., Grimwood, J., Aerts, A., Rouzé, P., Salamov, A., Putnam, N.,… Grigoriev, IV (2007). El diminuto eucariota Ostreococcus proporciona información genómica sobre la paradoja de la especiación del plancton. Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América, 104 (18), 7705–10. http://doi.org/10.1073/pnas.0611046104
- ^ Blanc-Mathieu, R., Verhelst, B., Derelle, E., Rombauts, S., Bouget, F.-Y., Carré, I.,… Piganeau, G. (2014). Un genoma mejorado del modelo de alga marina Ostreococcus tauri se despliega al evaluar los ensamblajes de Illumina de novo. BMC Genomics, 15 (1), 1103. http://doi.org/10.1186/1471-2164-15-1103
- ^ Krumholz, EW, Yang, H., Weisenhorn, P., Henry, CS y Libourel, IGL (2012). Reconstrucción de la red metabólica de todo el genoma de la picoalga Ostreococcus. Journal of Experimental Botany, 63 (6), 2353-2362. http://doi.org/10.1093/jxb/err407
- ^ a b c d Courties, C. et al. (1994). El organismo eucariota más pequeño. Naturaleza 370 : 255.
- ^ Courties, C. et al. (1995). Un nuevo picoeukaryote marino - Ostreococcus tauri Gen et Sp-NOV (Chlorophyta, Prasinophyceae). Phycologia 34 (4): 285-292
- ^ a b c Courties, C. et al. (1998). "Análisis filogenético y tamaño del genoma de Ostreococcus tauri (Chlorophyta, Prasinophyceae)" J. Phycol. 34 (5): 844-849.
- ^ Vaquer, A. et al. (1996). Stock permanente y dinámica del picofitoplancton en la laguna de Thau (costa noroeste del Mediterráneo). Limnología y Oceanografía 41 (8): 1821-1828
- ^ Worden, AZ, Lee, J.-H., Mock, T., Rouzé, P., Simmons, MP, Aerts, AL,… Grigoriev, IV (2009). Evolución verde y adaptaciones dinámicas reveladas por genomas de picoeukaryotes marinos Micromonas. Science, 324 (5924), 268–272. http://doi.org/10.1126/science.1167222
- ^ Moreau, H., Verhelst, B., Couloux, A., Derelle, E., Rombauts, S., Grimsley, N.,… Vandepoele, K. (2012). Las funcionalidades génicas y la estructura del genoma en Bathycoccus prasinos reflejan especializaciones celulares en la base del linaje verde. Biología del genoma, 13 (8), R74. http://doi.org/10.1186/gb-2012-13-8-r74
