La peptidilprolil isomerasa E (ciclofilina E) , también conocida como PPIE , es una enzima que en los seres humanos está codificada por el gen PPIE en el cromosoma 1. Como miembro de la familia de la peptidil-prolil cis-trans isomerasa (PPIasa), esta proteína cataliza la Isomerización cis-trans de enlaces peptídicos imídicos de prolina , lo que le permite facilitar el plegamiento o reparación de proteínas. [5] Además, PPIE participa en muchos procesos biológicos, incluido el metabolismo mitocondrial , la apoptosis y la inflamación , así como enfermedades y afecciones relacionadas, como la lesión por reperfusión isquémica. , SIDA , influenza y cáncer . [6] [7] [8]
PPIE |
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Estructuras disponibles |
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PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
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Lista de códigos de identificación de PDB |
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1ZMF , 2CQB , 2KU7 , 2KYX , 2R99 , 3LPY , 3MDF , 3UCH |
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Identificadores |
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Alias | PPIE , CYP-33, CYP33, peptidilprolil isomerasa E |
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Identificaciones externas | OMIM : 602435 MGI : 1917118 HomoloGene : 38142 GeneCards : PPIE |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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| Chr. | Cromosoma 1 (humano) [1] |
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| Banda | 1p34.2 | Comienzo | 39.692.182 pb [1] |
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Final | 39,763,914 pb [1] |
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Ubicación de genes ( ratón ) |
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| Chr. | Cromosoma 4 (ratón) [2] |
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| Banda | 4 | 4 D2.2 | Comienzo | 123,127,115 pb [2] |
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Final | 123.139.951 pb [2] |
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Patrón de expresión de ARN |
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| Más datos de expresión de referencia |
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Ontología de genes |
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Función molecular | • actividad isomerasa • cis-trans peptidil-prolil isomerasa actividad • GO: proteína de unión 0001948 • unión de ácidos nucleicos • ciclosporina A de unión • ARN de unión • mRNA de unión • poli (A) de unión • unión proteína desplegada
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Componente celular | • paso catalítico 2 spliceosome • nucleoplasma • spliceosomal complejo • núcleo • región extracelular • citosol • mota nuclear • secretora gránulo lumen • ficolina-1-rico lumen granulares • de tipo U2 paso catalítico 2 spliceosome
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Proceso biológico | • Regulación de la transcripción, plantilla de ADN • Procesamiento de ARNm • Isomerización de peptidil-prolilo de proteínas • Plegamiento de proteínas • Empalme de ARN • Regulación positiva de la replicación del genoma viral • Reparación por escisión de nucleótidos acoplada a la transcripción • Empalme de ARNm, vía spliceosoma • Desgranulación de neutrófilos • Plegado de proteínas
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Fuentes: Amigo / QuickGO |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | |
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NM_001195007 NM_006112 NM_203456 NM_203457 NM_001319293 |
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RefSeq (proteína) | |
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NP_001181936 NP_001306222 NP_006103 NP_982281 |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 1: 39,69 - 39,76 Mb | Crónicas 4: 123,13 - 123,14 Mb |
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Búsqueda en PubMed | [3] | [4] |
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Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
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Como otras ciclofilinas, PPIE forma una estructura de barril β con un núcleo hidrófobo. Este barril β está compuesto por ocho hebras β antiparalelas y está rematado por dos hélices α en la parte superior e inferior. Además, los giros β y los bucles en las hebras contribuyen a la flexibilidad del cañón. En particular, PPIE contiene dos dominios de unión a ARN en el N-terminal y un dominio PPIasa de 165 bases de largo en el C-terminal. El dominio PPIasa es homólogo a PPIA y puede unirse e inhibirse por CsA. [8]
La proteína codificada por este gen es miembro de la familia de la peptidil-prolil cis-trans isomerasa ( PPIasa ). Las PPIasas catalizan la isomerización cis-trans de enlaces peptídicos imídicos de prolina en oligopéptidos y aceleran el plegamiento de proteínas. [5] Generalmente, las PPIasas se encuentran en todas las eubacterias y eucariotas, así como en unas pocas arqueobacterias, y por lo tanto están altamente conservadas. [6] [9] La familia PPIasa se divide en tres subfamilias estructuralmente distintas: ciclofilina (CyP), proteína de unión a FK506 ( FKBP ) y parvulina (Pvn). [6] [8] Como ciclofilina, el PPI se une a la ciclosporina A (CsA) y puede encontrarse dentro de la célula o ser secretada por la célula. [7] En eucariotas, las ciclofilinas se localizan de forma ubicua en muchos tipos de células y tejidos. [7] [8] Además de la PPIasa y las actividades de chaperona proteica, las ciclofilinas funcionan en el metabolismo mitocondrial, la apoptosis, la respuesta inmunológica, la inflamación y el crecimiento y proliferación celular. [6] [7] [8] PPIE en particular también exhibe actividad de unión al ARN. [5]
Debido a la estrecha homología en el dominio PPIasa entre PPIE y PPIA , PPIE también puede estar involucrado en el proceso de replicación del VIH . [8] Por otra parte, PPIE ayuda a prevenir las infecciones por el virus de la gripe A . [10] Como ciclofilina, PPIE también se une al fármaco inmunosupresor CsA para formar un complejo CsA-ciclofilina, que luego se dirige a la calcineurina para inhibir la vía de señalización para la activación de las células T. [7]
En las células miogénicas cardíacas, se ha observado que las ciclofilinas se activan por choque térmico e hipoxia-reoxigenación, así como complejas con proteínas de choque térmico. Por tanto, las ciclofilinas pueden funcionar en la cardioprotección durante la lesión por isquemia-reperfusión.
Actualmente, la expresión de ciclofilina está altamente correlacionada con la patogénesis del cáncer, pero los mecanismos específicos quedan por dilucidar. [7]
Se ha demostrado que PPIE (gen) interactúa con CsA y MLL . [7] [11]