Proteopedia es una wiki , enciclopedia en 3D de proteínas y otras moléculas . [1] [2] [3] [4] El sitio contiene una página para cada entrada en el Banco de datos de proteínas (> 130 000 páginas), así como páginas que son más descriptivas de las estructuras de las proteínas en general, como la acetilcolinesterasa , [5 ] hemoglobina , [6] y el fotosistema II [7] con una vista de Jmol que resalta los sitios funcionales y ligandos. Emplea una herramienta de creación de escenas para que los usuarios no tengan que aprender el lenguaje de escritura JSmol para crear escenas moleculares personalizadas. Las escenas personalizadas se adjuntan fácilmente a "enlaces verdes" en texto descriptivo que muestran esas escenas en JSmol. Un navegador web es todo lo que se necesita para acceder al sitio y la información 3D; no es necesario instalar visores.
Tipo de negocio | Sin ánimo de lucro |
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Tipo de sitio | Enciclopedia en línea |
Disponible en | inglés |
Creado por | Joel L. Sussman, Eran Hodis y Jaime Prilusky |
URL | proteopedia.org |
Comercial | No |
Lanzado | 2007 |
Estado actual | Trabajo en progreso perpetuo |
Proteopedia fue la ganadora del premio 2010 al mejor sitio web de la revista The Scientist . [8]
Aspectos legales
Términos de licencia
Todo el contenido agregado por el usuario es gratuito y está cubierto por la Licencia de documentación libre GNU . Proteopedia está alojada en el Centro de Proteómica Estructural de Israel [9] en el Instituto de Ciencia Weizmann .
Ver también
Referencias
- ^ Hodis E, Prilusky J, Martz E, Silman I, Moult J, Sussman JL (2008). "Proteopedia - una 'wiki' científica que cierra la brecha entre la estructura tridimensional y la función de las biomacromoléculas" . Genome Biol . 9 (8): R121. doi : 10.1186 / gb-2008-9-8-r121 . PMC 2575511 . PMID 18673581 .
- ^ Martz E (2009). "Proteopedia.Org: una" Wiki "científica que cierra la brecha entre la estructura 3D y la función de las biomacromoléculas" . Biopolímeros . 92 (1): 76–7. doi : 10.1002 / bip.21126 . PMID 19117028 .
- ^ Hodis E, Prilusky J, Sussman JL (2010). "Proteopedia: un recurso web colaborativo, virtual en 3D para la estructura y función de proteínas y biomoléculas" . Educación en Bioquímica y Biología Molecular . 38 (5): 341–2. doi : 10.1002 / bmb.20431 . PMID 21567857 .
- ^ Prilusky, J; Hodis, E .; Canner, D .; Decatur, WA; Oberholser, K .; Martz, E .; Berchanski, A .; Harel, M .; Sussman, JL (agosto de 2011). "Proteopedia: un informe de estado sobre la colaboración, enciclopedia web 3D de proteínas y otras biomoléculas". Revista de Biología Estructural . 175 (2): 244–252. doi : 10.1016 / j.jsb.2011.04.011 . PMID 21536137 .
- ^ "Acetilcolinesterasa" . Proteopedia.
- ^ "Hemoglobina" . Proteopedia.
- ^ "Fotosistema II" . Proteopedia.
- ^ Luiggi C (septiembre de 2010). "Web Gems Presentamos a los ganadores de los primeros Labbies anuales, nuestros premios a la mejor multimedia basada en web de labs: Website Winner: Proteopedia" . El científico . 24 (9): 47.
Muy absorbente. Me mantuvo mirando y jugando (y aprendiendo) con él durante mucho tiempo. Muy informativo y un buen recurso.
- ^ "El Centro de Proteómica Estructural de Israel" .
enlaces externos
- Sitio web de Proteopedia