SYBR Green I ( SG ) es un colorante de cianina asimétrico [1] utilizado como colorante de ácido nucleico en biología molecular . La familia de tintes SYBR es producida por Molecular Probes Inc. , ahora propiedad de Thermo Fisher Scientific . SYBR Green I se une al ADN . El complejo de ADN-colorante resultante absorbe mejor la luz azul de 497 nanómetros (λ max = 497 nm) y emite luz verde (λ max = 520 nm). La tinción se une preferentemente al ADN bicatenario, pero teñirá el ADN monocatenario (ss) con menor rendimiento. SYBR Green también puede teñir ARN con un rendimiento menor que el ssDNA.
Nombres | |
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Nombre IUPAC N ', N' -dimetil- N - [4 - [(E) - (3-metil- 1,3-benzotiazol -2-iliden) metil] -1-fenilquinolin-1-io-2-il] -N -propilpropano-1,3-diamina | |
Identificadores | |
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Modelo 3D ( JSmol ) | |
CHEMBL | |
PubChem CID | |
Tablero CompTox ( EPA ) | |
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Propiedades | |
C 32 H 37 N 4 S + | |
Masa molar | 509,73 g / mol |
Solubilidad | Suministrado normalmente solvatado en dimetilsulfóxido |
Salvo que se indique lo contrario, los datos se proporcionan para materiales en su estado estándar (a 25 ° C [77 ° F], 100 kPa). | |
verificar ( ¿qué es ?) | |
Referencias de Infobox | |
Usos
SYBR Green se utiliza en varias áreas de la bioquímica y la biología molecular . Se utiliza como colorante para la cuantificación de ADN bicatenario en algunos métodos de PCR cuantitativa . [2] También se utiliza para visualizar ADN en electroforesis en gel . Se pueden usar concentraciones más altas de SYBR Green para teñir geles de agarosa con el fin de visualizar el ADN presente. Además de marcar los ácidos nucleicos puros, SYBR Green también se puede utilizar para marcar el ADN dentro de las células para la citometría de flujo y la microscopía de fluorescencia . En estos casos , puede ser necesario un tratamiento con ARNasa para reducir el fondo de ARN en las células.
Seguridad
SYBR Green I se comercializa como un reemplazo del bromuro de etidio , un mutágeno humano potencial , ya que es más seguro para trabajar y está libre de los complejos problemas de eliminación de desechos del etidio. Sin embargo, cualquier molécula pequeña capaz de unirse al ADN con alta afinidad es un posible carcinógeno , incluido SYBR Green.
En un estudio que utilizó la prueba de Ames , que mide la capacidad de las sustancias químicas para causar mutaciones, cuando se analizó a la misma concentración, no hubo un patrón claro en las mutagenicidades relativas del bromuro de etidio y el verde SYBR I. [3] El bromuro de etidio fue más mutagénico en concentraciones más altas.
Colorantes de cianina similares
- PicoGreen (PG)
- SYBR seguro
- SYBR Gold
- Naranja tiazol (TO)
- Amarillo oxazol (YO)
- Safe-Green
- Chai Green
Ver también
- GelGreen
notas y referencias
- ^ Cremallera H; Brunner H; Bernhagen J; Vitzthum F (2004). "Investigaciones sobre intercalación de ADN y unión superficial por SYBR Green I, determinación de su estructura e implicaciones metodológicas" . Investigación de ácidos nucleicos . 32 (12): e103. doi : 10.1093 / nar / gnh101 . PMC 484200 . PMID 15249599 .
- ^ Mackay IM; Arden KE; Nitsche A (marzo de 2002). "PCR en tiempo real en virología" . Ácidos nucleicos Res . 30 (6): 1292–305. doi : 10.1093 / nar / 30.6.1292 . PMC 101343 . PMID 11884626 .
- ^ Singer VL; Lawlor TE; Yue S (febrero de 1999). "Comparación de mutagenicidad de tinción de gel de ácido nucleico SYBR Green I y mutagenicidad de bromuro de etidio en el ensayo de mutación inversa de microsoma de Salmonella / mamífero (prueba de Ames)". Investigación de mutaciones . 439 (1): 37–47. doi : 10.1016 / s1383-5718 (98) 00172-7 . PMID 10029672 .