Los ARN específicos del cuerpo de Cajal pequeños ( scaRNA ) son una clase de ARN nucleolares pequeños (snoRNA) que se localizan específicamente en el cuerpo de Cajal , un orgánulo nuclear (suborganelo celular) involucrado en la biogénesis de ribonucleoproteínas nucleares pequeñas (snRNP o snurps). ScaRNAs guían la modificación ( metilación y pseudouridylation ) de la ARN polimerasa II transcribe spliceosomal ARN U1 , U2 , U4 , U5 y U12 .
ARN 1 específico del cuerpo de Cajal pequeño | |
---|---|
Identificadores | |
Símbolo | SCARNA1 |
Rfam | RF00553 |
Otros datos | |
Tipo de ARN | gen , snRNA , snoRNA , scaRNA; |
Dominio (s) | Vertebrados |
Estructuras PDB | PDBe |
El primer scaRNA identificado fue U85. [1] A diferencia de los snoRNA típicos, es un snoRNA compuesto de caja C / D y de caja H / ACA y puede guiar tanto la pseudouridilación como la 2′-O-metilación. No todos los scaRNA son snoRNA compuestos C / D y H / ACA box, y la mayoría de los scaRNA son estructural y funcionalmente indistinguibles de los snoRNA, que dirigen la modificación del RNA ribosómico (rRNA) en el nucleolo .
ScaRNA de Drosophila
Varios estudios identificaron scaRNAs en Drosophila . [1] [2] [3] [4] [5] Uno de los estudios mostró que varios scaRNA de Drosophila podrían funcionar igualmente bien en el nucleoplasma de moscas mutantes que carecen de cuerpos de Cajal. [4] Investigaciones posteriores mostraron que scaRNA pugU6-40 se dirige a U6 snRNA, cuya modificación ocurre en el nucleolo no CB y que pugU1-6 y pug U2-55 guían 2 RNAs: snRNA y 28s rRNA. [5]
ARN 1 específico del cuerpo de Cajal pequeño
En biología molecular , el ARN 1 específico del cuerpo de Small Cajal (también conocido como SCARNA1 o ACA35) es un ARN nucleolar pequeño que se encuentra en los cuerpos de Cajal y se cree que está involucrado en la pseudouridilación del ARN espliceosómico de U2 en el residuo U89.
scaRNA1 es un ARN no codificante , que son productos funcionales de genes que no se traducen en proteínas . Estas moléculas de ARN suelen contener una estructura secundaria importante o motivos de unión a ligandos y están implicadas en muchos procesos biológicos importantes en la célula. [6]
scaRNA1 pertenece a la clase de caja H / ACA de snoRNA, ya que tiene la estructura de horquilla-bisagra-horquilla-cola predicha, motivos de caja H / ACA conservados y se encuentra asociado con la proteína GAR1 . [7]
Referencias
- ↑ a b Jády BE, Kiss T (febrero de 2001). "Un pequeño ARN guía nucleolar funciona tanto en la metilación de 2′-O-ribosa como en la pseudouridilación del ARN espliceosomal U5" . El diario EMBO . 20 (3): 541–551. doi : 10.1093 / emboj / 20.3.541 . PMC 133463 . PMID 11157760 .
- ^ Tortoriello G, Accardo MC, Scialò F, Angrisani A, Turano M, Furia M (mayo de 2009). "Un nuevo scaRNA antisentido de Drosophila con una función de guía predicha". Gene . 436 (1–2): 56–65. doi : 10.1016 / j.gene.2009.02.005 . PMID 19230845 .
- ^ Tycowski KT, Shu MD, Kukoyi A, Steitz JA (abril de 2009). "Una proteína WD40 conservada se une a la señal de localización del cuerpo de Cajal de las partículas scaRNP" . Célula molecular . 34 (1): 47–57. doi : 10.1016 / j.molcel.2009.02.020 . PMC 2700737 . PMID 19285445 .
- ^ a b Deryusheva S, Gall JG (diciembre de 2009). "Los ARN específicos del cuerpo de Cajal pequeños de Drosophila funcionan en ausencia de cuerpos de Cajal" . Biología molecular de la célula . 20 (24): 5250–5259. doi : 10.1091 / mbc.E09-09-0777 . PMC 2793299 . PMID 19846657 .
- ^ a b Deryusheva S, Gall JG (diciembre de 2013). "Nuevos ARN específicos del cuerpo de Cajal pequeños identificados en Drosophila: función de ARN guía de sondeo" . ARN . 19 (12): 1802–1814. doi : 10.1261 / rna.042028.113 . PMC 3884663 . PMID 24149844 .
- ^ Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (junio de 2002). "RNA nucleares pequeños específicos del cuerpo de Cajal: una nueva clase de RNA de guía de 2′-O-metilación y pseudouridilación" . El diario EMBO . 21 (11): 2746–2756. doi : 10.1093 / emboj / 21.11.2746 . PMC 126017 . PMID 12032087 .
- ^ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (julio de 2004). "Caja humana H / ACA pseudouridylation guía maquinaria de ARN" . Biología Molecular y Celular . 24 (13): 5797–5807. doi : 10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004 . PMC 480876 . PMID 15199136 .
enlaces externos
- snoRNAbase: base de datos de snoRNA humana H / ACA y C / D box
- Página para el ARN específico del cuerpo de Small Cajal en Rfam