El factor 2N asociado a la proteína de unión a TATA es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen TAF15 . [5] [6] [7]
TAF15 | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | TAF15 , Npl3, RBP56, TAF2N, TAFII68, factor 15 asociado a la proteína de unión a la caja TATA | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 601574 MGI : 1917689 HomoloGene : 131088 GeneCards : TAF15 | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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RefSeq (ARNm) |
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RefSeq (proteína) |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 17: 35,71 - 35,86 Mb | Crónicas 11: 83,47 - 83,51 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
El inicio de la transcripción por la ARN polimerasa II requiere las actividades de más de 70 polipéptidos. La proteína que coordina estas actividades es el factor de transcripción IID (TFIID), que se une al promotor central para posicionar la polimerasa correctamente, sirve como andamio para el ensamblaje del resto del complejo de transcripción y actúa como un canal para las señales reguladoras. TFIID está compuesto por la proteína de unión a TATA (TBP) y un grupo de proteínas conservadas evolutivamente conocidas como factores asociados a TBP o TAF. Los TAF pueden participar en la transcripción basal, servir como coactivadores, funcionar en el reconocimiento de promotores o modificar los factores de transcripción generales (GTF) para facilitar el ensamblaje complejo y el inicio de la transcripción. Este gen codifica una subunidad de TFIID presente en un subconjunto de complejos de TFIID. Las translocaciones que involucran el cromosoma 17 y el cromosoma 9, donde se encuentra el gen del receptor nuclear CSMF, dan como resultado un producto de fusión génica que es una proteína de unión a ARN asociada con un subconjunto de condrosarcomas mixoides extraesqueléticos. Se han identificado dos transcripciones que codifican diferentes isoformas. [7]
Interacciones
Se ha demostrado que TAF15 interactúa con:
- POLR2C , [8]
- POLR2E , [8]
- POLR2G , [8]
- SAFB , [9]
- TAF11 , [8]
- TAF13 , [8]
- TAF5 , [8]
- TAF7 , [8] y
- Proteína de unión a TATA [10]
Referencias
- ^ a b c ENSG00000276833 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000270647, ENSG00000276833 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020680 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Morohoshi F, Arai K, Takahashi EI, Tanigami A, Ohki M (15 de noviembre de 1996). "Clonación y mapeo de un gen humano RBP56 que codifica una supuesta proteína de unión a ARN similar a las proteínas FUS / TLS y EWS". Genómica . 38 (1): 51–7. doi : 10.1006 / geno.1996.0591 . PMID 8954779 .
- ^ Morohoshi F, Ootsuka Y, Arai K, Ichikawa H, Mitani S, Munakata N, Ohki M (diciembre de 1998). "Estructura genómica de los genes humanos RBP56 / hTAFII68 y FUS / TLS". Gene . 221 (2): 191–8. doi : 10.1016 / S0378-1119 (98) 00463-6 . PMID 9795213 .
- ^ a b "Entrez Gene: TAF15 TAF15 RNA polimerasa II, factor asociado a la proteína de unión a la caja TATA (TBP), 68kDa" .
- ^ a b c d e f g Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (marzo de 1998). "EWS, pero no EWS-FLI-1, está asociado con TFIID y ARN polimerasa II: interacciones entre dos miembros de la familia TET, EWS y hTAFII68, y subunidades de complejos TFIID y ARN polimerasa II" . Mol. Célula. Biol . 18 (3): 1489–97. doi : 10.1128 / mcb.18.3.1489 . PMC 108863 . PMID 9488465 .
- ^ Townson SM, Kang K, Lee AV, Oesterreich S (junio de 2004). "Análisis de estructura-función del factor de unión B1 del andamio del correpresor alfa del receptor de estrógeno: identificación de un potente dominio de represión transcripcional" . J. Biol. Chem . 279 (25): 26074–81. doi : 10.1074 / jbc.M313726200 . PMID 15066997 .
- ^ Hoffmann A, Roeder RG (julio de 1996). "Clonación y caracterización de TAF20 / 15 humano. Múltiples interacciones sugieren un papel central en la formación del complejo TFIID" . J. Biol. Chem . 271 (30): 18194–202. doi : 10.1074 / jbc.271.30.18194 . PMID 8663456 .
Otras lecturas
- Zhou Q, Sharp PA (1995). "Nuevo mecanismo y factor de regulación por VIH-1 Tat" . EMBO J . 14 (2): 321–8. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086 . PMID 7835343 .
- Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). "Una nueva restricción mediada por LBP-1 de la transcripción del VIH-1 en el nivel de elongación in vitro" . J. Biol. Chem . 270 (5): 2274–83. doi : 10.1074 / jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 .
- Ou SH, García-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). "Papel de los motivos flanqueantes de la caja E en la función del elemento TATA de tipo 1 del virus de inmunodeficiencia humana" . J. Virol . 68 (11): 7188–99. doi : 10.1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158 . PMID 7933101 .
- Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (1994). "Interacción directa de TFIID humano con el tat transactivador de VIH-1". Naturaleza . 367 (6460): 295–9. doi : 10.1038 / 367295a0 . PMID 8121496 . S2CID 4362048 .
- Hoffmann A, Roeder RG (1996). "Clonación y caracterización de TAF20 / 15 humano. Múltiples interacciones sugieren un papel central en la formación del complejo TFIID" . J. Biol. Chem . 271 (30): 18194–202. doi : 10.1074 / jbc.271.30.18194 . PMID 8663456 .
- Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (1996). "Los mutantes de tipo salvaje y defectuosos de transactivación de la proteína Tat del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 se unen a la proteína de unión a TATA humana in vitro". J. Adquirir. Inmunodeficiencia. Syndr. Tararear. Retrovirol . 12 (2): 128–38. doi : 10.1097 / 00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 .
- Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). "Las mutaciones en el dominio carboxi-terminal de TBP afectan la síntesis de transcripciones cortas y completas del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 de manera similar" . J. Virol . 70 (8): 5025–34. doi : 10.1128 / JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456 . PMID 8764009 .
- Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (1996). "La interacción de Tat del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 con un sitio único de TFIID inhibe el cofactor negativo Dr1 y estabiliza el complejo TFIID-TFIIA" . J. Virol . 70 (8): 5503–10. doi : 10.1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .
- Zhou Q, Sharp PA (1996). "Tat-SF1: cofactor para la estimulación del alargamiento transcripcional por Tat del VIH-1". Ciencia . 274 (5287): 605–10. doi : 10.1126 / science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 .
- Bertolotti A, Lutz Y, Heard DJ, Chambon P, Tora L (1996). "hTAF (II) 68, una nueva proteína de unión a ARN / ssDNA con homología con las pro-oncoproteínas TLS / FUS y EWS está asociada tanto con TFIID como con ARN polimerasa II" . EMBO J . 15 (18): 5022–31. doi : 10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00882.x . PMC 452240 . PMID 8890175 .
- García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). "Asociación de Tat con complejos purificados de preiniciación de la transcripción de VIH-1 y VIH-2" . J. Biol. Chem . 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074 / jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 .
- Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (1998). "EWS, pero no EWS-FLI-1, está asociado con TFIID y ARN polimerasa II: interacciones entre dos miembros de la familia TET, EWS y hTAFII68, y subunidades de complejos TFIID y ARN polimerasa II" . Mol. Célula. Biol . 18 (3): 1489–97. doi : 10.1128 / mcb.18.3.1489 . PMC 108863 . PMID 9488465 .
- Zhang D, Paley AJ, Childs G (1998). "El represor transcripcional ZFM1 interactúa y modula la capacidad de EWS para activar la transcripción" . J. Biol. Chem . 273 (29): 18086–91. doi : 10.1074 / jbc.273.29.18086 . PMID 9660765 .
- Martini A, La Starza R, Janssen H, Bilhou-Nabera C, Corveleyn A, Somers R, Aventin A, Foà R, Hagemeijer A, Mecucci C, Marynen P (2002). "Reordenamiento recurrente del gen del sarcoma de Ewing, EWSR1, o su homólogo, TAF15, con el factor de transcripción CIZ / NMP4 en leucemia aguda". Cancer Res . 62 (19): 5408–12. PMID 12359745 .
- Townson SM, Kang K, Lee AV, Oesterreich S (2004). "Análisis de estructura-función del factor de unión B1 del andamio del correpresor alfa del receptor de estrógeno: identificación de un potente dominio de represión transcripcional" . J. Biol. Chem . 279 (25): 26074–81. doi : 10.1074 / jbc.M313726200 . PMID 15066997 .
- Lee HJ, Kim S, Pelletier J, Kim J (2004). "Estimulación de transactivación mediada por hTAFII68 (NTD) por v-Src" . FEBS Lett . 564 (1–2): 188–98. doi : 10.1016 / S0014-5793 (04) 00314-X . PMID 15094065 . S2CID 1526475 .
- Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (2004). "Análisis proteómico, funcional y basado en dominios de proteínas de unión 14-3-3 in vivo implicadas en la regulación citoesquelética y la organización celular". Curr. Biol . 14 (16): 1436–50. doi : 10.1016 / j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660 . S2CID 2371325 .
enlaces externos
- Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q92804 (factor 2N asociado a la proteína de unión a TATA) en PDBe-KB .