La AT-gancho es una unión a ADN con motivos presentes en muchas proteínas, incluyendo el grupo de alta movilidad (HMG) proteínas , [1] de unión a ADN proteínas de plantas [2] y las proteínas hBRG1, una ATPasa central de la humana de conmutación / sacarosa complejo remodelador no fermentador (SWI / SNF) . [3]
Gancho en AT | ||||||||
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![]() estructura en solución de un complejo del segundo dominio de unión a adn de hmg-i (y) humano unido al dodecámero de adn que contiene el sitio prdii del promotor de interferón-beta, estructuras nmr, 35 | ||||||||
Identificadores | ||||||||
Símbolo | AT_hook | |||||||
Pfam | PF02178 | |||||||
InterPro | IPR017956 | |||||||
INTELIGENTE | AT_hook | |||||||
SCOP2 | 2eze / SCOPe / SUPFAM | |||||||
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![](http://wikiimg.tojsiabtv.com/wikipedia/commons/thumb/0/0a/AT-hook.png/220px-AT-hook.png)
Este motivo consiste en una secuencia central palindrómica conservada de prolina - arginina - glicina - arginina - prolina , aunque algunos ganchos AT contienen sólo una única prolina en la secuencia central. Los ganchos AT también incluyen un número variable de residuos de lisina y arginina cargados positivamente a cada lado de la secuencia central. [4] El gancho AT se une al surco menor del ADN rico en adenina - timina (AT), de ahí el AT en el nombre. El resto del nombre deriva de un "gancho" de asparagina / aspartato predicho en los primeros ganchos AT reportados en 1990. [5] En 1997, estudios estructurales utilizando RMN determinaron que un gancho AT unido a ADN adoptó una forma de media luna o de gancho alrededor el surco menor de una hebra de ADN diana (en la imagen de la derecha). [6] Las proteínas HMGA contienen tres ganchos AT, aunque algunas proteínas contienen hasta 30. [5] Las secuencias de unión óptimas para las proteínas del gancho AT son repeticiones de la forma (ATAA) n o (TATT) n , aunque la óptima Las secuencias de unión para la secuencia central del gancho AT son AAAT y AATT. [7]
Referencias
- ^ Reeves R, Beckerbauer L (mayo de 2001). "Proteínas HMGI / Y: reguladores flexibles de la transcripción y estructura de la cromatina". Biochim. Biophys. Acta . 1519 (1–2): 13–29. doi : 10.1016 / S0167-4781 (01) 00215-9 . PMID 11406267 .
- ^ Meijer AH, van Dijk EL, Hoge JH (junio de 1996). "Los miembros novedosos de una familia de proteínas de unión al ADN que contienen el gancho AT del arroz se identifican a través de su interacción in vitro con los sitios objetivo de consenso de las proteínas homeodominio de plantas y animales". Plant Mol. Biol . 31 (3): 607-18. doi : 10.1007 / BF00042233 . PMID 8790293 . S2CID 24687309 .
- ^ Singh M, D'Silva L, Holak TA (2006). "Propiedades de unión al ADN de la región que contiene el gancho AT recombinante de alta movilidad similar a un grupo de la proteína BRG1 humana". Biol. Chem . 387 (10-11): 1469-78. doi : 10.1515 / BC.2006.184 . PMID 17081121 .
- ^ Reeves R (octubre de 2001). "Biología molecular de proteínas HMGA: ejes de función nuclear". Gene . 277 (1–2): 63–81. doi : 10.1016 / S0378-1119 (01) 00689-8 . PMID 11602345 .
- ^ a b Reeves R, Nissen MS (mayo de 1990). "El dominio de unión de AT-ADN de proteínas cromosómicas del grupo I de alta movilidad de mamíferos. Un nuevo motivo peptídico para reconocer la estructura del ADN" . J. Biol. Chem . 265 (15): 8573–82. PMID 1692833 . Archivado desde el original el 7 de junio de 2020 . Consultado el 14 de noviembre de 2009 .
- ^ Huth JR, Bewley CA, Nissen MS y col. (Agosto de 1997). "La estructura de la solución de un complejo HMG-I (Y) -DNA define un nuevo motivo de unión de surco menor arquitectónico". Nat. Struct. Biol . 4 (8): 657–65. doi : 10.1038 / nsb0897-657 . PMID 9253416 .
- ^ Reeves R (octubre de 2000). "Estructura y función de la familia HMGI (Y) de factores de transcripción arquitectónicos" . Reinar. Perspectiva de salud . 108 (Supl. 5): 803–9. doi : 10.2307 / 3454310 . JSTOR 3454310 . PMID 11035986 . Archivado desde el original el 9 de enero de 2009.