Bifidobacteriales es un orden de bacterias , [1] en la subclase de Actinobacteridae .
Bifidobacteriales | |
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Bifidobacterium adolescentis | |
clasificación cientifica | |
Dominio: | Bacterias |
Filo: | Actinobacterias |
Clase: | Actinobacterias |
Pedido: | Bifidobacteriales Stackebrandt et al. 1997 enmienda. Zhi y col. 2009 |
Familia y géneros
- Bifidobacteriaceae
- Aeriscardovia
- Alloscardovia
- Bifidobacteria
- Bombiscardovia
- Galliscardovia
- Gardnerella
- Neoscardovia
- Parascardovia
- Pseudoscardovia
- Scardovia
- incertae sedis
- California. Ancillula
- California. Ancillula trichonymphae
- California. Ancillula
Genómica
En un árbol filogenético del orden Bifidobacteriales , basado en RpoB , RpoC y DNA Gyrase B , Gardnerella vaginalis se ramifica entre diferentes especies de Bifidobacterium , lo que hace que el género Bifidobacterium sea polyphyletic . El género podría hacerse monofilético si G. vaginalis se colocara dentro de Bifidobacterium . El análisis comparativo de secuencias de proteínas alineadas ha conducido al descubrimiento de dos indeles de firma conservados que son específicos del orden Bifidobacteriales . El primer indel , una deleción de 1 aminoácido en la proteína ribosomal L13 , se encuentra en todas las especies de Bifidobacteriales y no en otras Actinobacterias , lo que proporciona un marcador molecular potencial para todo el orden de Bifidobacteriales . El segundo indel que se ha identificado es una inserción de 1 aminoácido en la glucosa-6-fosfato deshidrogenasa que se encuentra en todas las especies de Bifidobacterium y G. vaginalis , pero no en ninguna otra Actinobacteria . Por tanto, este indel es característico del clado formado por especies de Bifidobacterium y G. vaginalis y puede utilizarse para distinguir estos géneros del resto del orden Bifidobacteriales . También se han identificado 16 proteínas de firma conservadas que son exclusivas del orden Bifidobacteriales y pueden usarse como marcadores moleculares para este orden. Además, se han identificado 6 proteínas de firma conservadas que son exclusivas de Bifidobacterium y Gardnerella , lo que proporciona más pruebas de que las especies de estos dos géneros están estrechamente relacionadas y proporcionan marcadores moleculares para el clado que consta de estos géneros. [2]
Referencias
- ^ Krogius-Kurikka L, Kassinen A, Paulin L, et al. (2009). "El análisis de secuencia de bibliotecas de fracción de porcentaje G + C de ADN bacteriano fecal humano revela un alto número de Actinobacterias" . BMC Microbiol . 9 : 68. doi : 10.1186 / 1471-2180-9-68 . PMC 2679024 . PMID 19351420 .
- ^ Gao, B .; Gupta, RS (2012). "Marco filogenético y firmas moleculares para los principales clados del Phylum Actinobacteria" . Revisiones de Microbiología y Biología Molecular . 76 (1): 66–112. doi : 10.1128 / MMBR.05011-11 . PMC 3294427 . PMID 22390973 .
enlaces externos
- Systema Naturae 2000 / Clasificación- Orden Bifidobacteriales