Proteína de unión a ARN


Las proteínas de unión al ARN (a menudo abreviadas como RBP ) son proteínas que se unen al ARN de cadena doble o simple [1] en las células y participan en la formación de complejos de ribonucleoproteínas . Los RBP contienen varios motivos estructurales , como el motivo de reconocimiento de ARN (RRM), el dominio de unión de dsRNA , el dedo de zinc y otros. [2] Son proteínas citoplasmáticas y nucleares . Sin embargo, dado que la mayor parte del ARN maduro se exporta desde el núcleo con relativa rapidez, la mayoría de las prácticas comerciales restrictivas en el núcleo existen como complejos de proteína y pre-ARNm.denominadas partículas heterogéneas de ribonucleoproteína (hnRNP). Las prácticas comerciales restrictivas tienen papeles cruciales en varios procesos celulares, tales como: función celular, transporte y localización. En especial, juegan un papel importante en el control postranscripcional de los ARN, tales como: empalme , poliadenilación , estabilización de ARNm, localización y traducción de ARNm . Las células eucariotas expresan diversas prácticas comerciales restrictivas con actividad única de unión a ARN e interacción proteína-proteína . Según la base de datos de RBP eucariotas (EuRBPDB), hay 2961 genes que codifican RBP en humanos . Durante la evolución, la diversidad de prácticas comerciales restrictivas aumentó considerablemente con el aumento del número de intrones . La diversidad permitió que las células eucariotas utilizaran exones de ARN en varios arreglos, dando lugar a un RNP (ribonucleoproteína) único para cada ARN. Aunque las prácticas comerciales restrictivas tienen un papel crucial en la regulación postranscripcional de la expresión génica, relativamente pocas prácticas comerciales restrictivas se han estudiado sistemáticamente. [3] [4]

Muchas prácticas comerciales restrictivas tienen estructuras modulares y se componen de múltiples repeticiones de unos pocos dominios básicos específicos que a menudo tienen secuencias limitadas. Luego, estas secuencias se organizan en combinaciones variables para satisfacer la necesidad de diversidad. El reconocimiento de una proteína específica de un ARN específico ha evolucionado a través del reordenamiento de estos pocos dominios básicos. Cada dominio básico reconoce el ARN, pero muchas de estas proteínas requieren múltiples copias de uno de los muchos dominios comunes para funcionar. [2]

A medida que el ARN nuclear emerge de la ARN polimerasa , los transcritos de ARN se cubren inmediatamente con proteínas de unión al ARN que regulan todos los aspectos del metabolismo y la función del ARN, incluida la biogénesis, la maduración, el transporte, la localización celular y la estabilidad del ARN. Todas las prácticas comerciales restrictivas se unen al ARN, sin embargo, lo hacen con diferentes especificidades y afinidades de secuencia de ARN, lo que permite que las prácticas comerciales restrictivas sean tan diversas como sus objetivos y funciones. [4] Estos objetivos incluyen ARNm , que codifica proteínas, así como una serie de ARN no codificantes funcionales . Los NcRNA casi siempre funcionan como complejos de ribonucleoproteínas y no como ARN desnudos. Estos ARN no codificantes incluyen microARN ,pequeños ARN de interferencia (siRNA), así como pequeños ARN nucleares empalmados (snRNA). [5]


Proteína ADAR.
ADAR  : una proteína de unión al ARN involucrada en los eventos de edición del ARN.
Dedo de zinc.
" Dedo de zinc " : Representación de dibujos animados del motivo de dedo de zinc de las proteínas. El ion zinc (verde) está coordinado por dos residuos de aminoácidos de histidina y dos de cisteína.
Caenorhabditis elegans.
Gusano hermafrodita C. elegans rastrero
CIRBP.
" CIRBP ": Estructura de la proteína CIRBP.
Beta-actina.
" Beta-actina ": Estructura de la proteína ACTB.