La proteína de unión a horquilla de ARN de histona o proteína de unión a bucle de tallo (SLBP) es una proteína que en humanos está codificada por el gen SLBP . [5] [6] [7]
SLBP ha sido clonado de humanos, C. elegans , D. melanogaster , X. laevis y erizos de mar . La proteína humana de longitud completa tiene 270 aminoácidos (31 kDa) con un dominio de unión al ARN (RBD) ubicado en el centro. El RBD de 75 aminoácidos está bien conservado entre especies, sin embargo, el resto de SLBP es muy divergente en la mayoría de los organismos y no es homólogo a ninguna otra proteína en los genomas eucarióticos.
Este gen codifica una proteína que se une a la estructura de bucle de tallo 3' UTR de la histona en los ARNm de histona dependientes de la replicación . Los ARNm de histonas no contienen intrones ni señales de poliadenilación , y se procesan mediante un único evento de escisión endonucleolítica aguas abajo del bucle de tallo. La estructura de bucle de tallo es esencial para el procesamiento eficiente del pre-ARNm de histonas, pero esta estructura también controla el transporte, la traducción y la estabilidad de los ARNm de histonas. La expresión de SLBP se regula durante la fase S del ciclo celular , aumentando más de 10 veces durante la última parte del ciclo celular. G1 .
Todas las proteínas SLBP son capaces de formar un complejo altamente estable con el ARN de bucle de histona. La formación de complejos con el bucle de tallo de ARNm de histona se logra mediante un nuevo pliegue de haz de tres hélices. Las proteínas SLBP también reconocen la estructura de tetrabucle de la horquilla de histonas, la base del tallo y la región flanqueante 5'. La estructura cristalina de SLBP humana en complejo con el ARN de bucle de tallo, así como la exonucleasa Eri1 , revela que el residuo Arg181 de SLBP interactúa específicamente con la segunda base de guanina en el tallo de ARN. [8] El resto de la proteína está intrínsecamente desordenada tanto en las moscas de la fruta como en los humanos. Una característica única del SLBP RBD es que está fosforiladoen su dominio de unión al ARN en el residuo Thr171. El SLBP RBD también sufre isomerización de prolina alrededor de esta secuencia y es un sustrato para la prolil isomerasa Pin1. El dominio N-terminal de la SLBP humana es necesario para la activación de la traducción de los ARNm de histonas a través de su interacción con SLIP1. SLBP también interactúa con la proteína CTIF asociada a CBP80 para facilitar la degradación rápida de los ARNm de histonas. SLBP es una fosfoproteína y, además de T171, también se fosforila en Ser7, Ser20, Ser23, Thr60, Thr61 en células de mamífero. La fosforilación en Thr60 está mediada por CK2 y Thr61 por Cyclin A / Cdk1 . [7]