La enzima peroxidasa de rábano picante ( HRP ), que se encuentra en las raíces del rábano picante , se usa ampliamente en aplicaciones bioquímicas . Es una metaloenzima con muchas isoformas, de las cuales el tipo más estudiado es C. Cataliza la oxidación de diversos sustratos orgánicos por el peróxido de hidrógeno.
Peroxidasa de rábano picante | ||||||
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Identificadores | ||||||
Organismo | ||||||
Símbolo | Peroxidasa C1A | |||||
Alt. simbolos | PRXC1A | |||||
PDB | 1W4W Más estructuras | |||||
UniProt | P00433 | |||||
Otros datos | ||||||
Número CE | 1.11.1.7 | |||||
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Estructura
La estructura de la enzima se resolvió por primera vez mediante cristalografía de rayos X en 1997 [2] y desde entonces se ha resuelto varias veces con varios sustratos. [3] Es una gran gilcoproteína alfa helicoidal que se une al hemo como cofactor redox .
Sustratos
Solamente, la enzima HRP, o sus conjugados, tiene poco valor; su presencia debe hacerse visible utilizando un sustrato que, al ser oxidado por HRP utilizando peróxido de hidrógeno como agente oxidante, produce un cambio de color característico que es detectable por métodos espectrofotométricos . [4] [5]
Se han descrito y comercializado numerosos sustratos para la peroxidasa de rábano picante para aprovechar las características deseables de la HRP. Estos sustratos se dividen en varias categorías distintas. HRP cataliza la conversión de sustratos cromogénicos (por ejemplo, TMB , DAB , ABTS ) en productos coloreados y produce luz cuando actúa sobre sustratos quimioluminiscentes (por ejemplo, quimioluminiscencia mejorada por luminol ).
Aplicaciones
La peroxidasa de rábano picante es una glicoproteína de 44.173,9 dalton con 6 residuos de lisina que se pueden conjugar con una molécula marcada. Produce un derivado coloreado, fluorimétrico [6] o luminiscente de la molécula marcada cuando se incuba con un sustrato adecuado, lo que permite su detección y cuantificación. El HRP se usa a menudo en conjugados (moléculas que se han unido genética o químicamente) para determinar la presencia de un objetivo molecular. Por ejemplo, se puede usar un anticuerpo conjugado con HRP para detectar una pequeña cantidad de una proteína específica en una transferencia de Western . Aquí, el anticuerpo proporciona la especificidad para localizar la proteína de interés y la enzima HRP, en presencia de un sustrato, produce una señal detectable. [7] La peroxidasa de rábano picante también se usa comúnmente en técnicas como ELISA e inmunohistoquímica debido a su naturaleza monomérica y la facilidad con la que produce productos coloreados. La peroxidasa, una oxidorreductasa que contiene hemo, es una enzima comercialmente importante que cataliza la escisión reductora del peróxido de hidrógeno por un donador de electrones.
La peroxidasa de rábano picante es ideal en muchos aspectos para estas aplicaciones porque es más pequeña, más estable y menos costosa que otras alternativas populares como la fosfatasa alcalina . También tiene una alta tasa de rotación que permite la generación de señales fuertes en un lapso de tiempo relativamente corto. [8] Las altas concentraciones de fosfato disminuyen severamente la estabilidad de la peroxidasa de rábano picante. Además de las aplicaciones biomédicas, la peroxidasa de rábano picante es una de las enzimas con importantes aplicaciones medioambientales. Esta enzima es adecuada para la eliminación de compuestos aromáticos hidroxilados (HAC) que se consideran contaminantes primarios en una amplia variedad de aguas residuales industriales. [9]
Además, "en los últimos años, la técnica de marcar neuronas con la enzima peroxidasa de rábano picante se ha convertido en una herramienta importante. En su breve historia, este método probablemente ha sido utilizado por más neurobiólogos que los que han utilizado la tinción de Golgi desde su descubrimiento en 1870". [10]
Quimioluminiscencia mejorada (ECL)
La peroxidasa de rábano picante cataliza la oxidación de luminol a 3-aminoftalato a través de varios intermedios. La reacción se acompaña de la emisión de luz de baja intensidad a 428 nm. Sin embargo, en presencia de ciertos productos químicos, la luz emitida se mejora hasta 1000 veces, lo que hace que la luz sea más fácil de detectar y aumenta la sensibilidad de la reacción. La mejora de la emisión de luz se llama quimioluminiscencia mejorada (ECL). Se pueden utilizar varios potenciadores, como los fenoles modificados comúnmente conocidos (principalmente yodo-fenol). Sin embargo, existen varios sustratos en el mercado que utilizan otros potenciadores que dan como resultado señales de luminiscencia hasta 13 veces mayores que los sustratos potenciados con fenol. [11] La intensidad de la luz es una medida del número de moléculas de enzima que reaccionan y, por tanto, de la cantidad de híbrido. ECL es fácil de configurar y es sensible, detecta aproximadamente 0,5 pg de ácido nucleico en transferencias Southern y transferencias Northern . La detección por sustratos quimioluminiscentes tiene varias ventajas sobre los sustratos cromogénicos. La sensibilidad es de 10 a 100 veces mayor y la cuantificación de la emisión de luz es posible en un amplio rango dinámico, mientras que la de los precipitados coloreados es mucho más limitada, aproximadamente un orden de magnitud menos. Los filtros decapantes son mucho más fáciles cuando se utilizan sustratos quimioluminiscentes.
Imitadores de HRP
Se han explorado muchos materiales para imitar el HRP natural. Por ejemplo, se han utilizado nanopartículas de óxido de hierro y complejos que contienen hemina para imitar la HRP. [12] Estas enzimas artificiales similares a HRP se han utilizado para muchas aplicaciones, que van desde la detección de biomarcadores y la inmunotinción de tumores hasta la antibiofouling.
Ver también
- Enzima artificial
Referencias
- ^ PDB : 1w4w ; Carlsson GH, Nicholls P, Svistunenko D, Berglund GI, Hajdu J (enero de 2005). "Complejos de peroxidasa de rábano picante con formiato, acetato y monóxido de carbono". Bioquímica . 44 (2): 635–42. doi : 10.1021 / bi0483211 . PMID 15641789 .
- ^ PDB : 1ATJ ; Gajhede M, Schuller DJ, Henriksen A, Smith AT, Poulos TL (diciembre de 1997). "Estructura cristalina de la peroxidasa de rábano picante C a una resolución de 2,15 A". Biología estructural de la naturaleza . 4 (12): 1032–8. doi : 10.1038 / nsb1297-1032 . PMID 9406554 .
- ^ "Secuencias de PDB relacionadas con peroxidasa C1A" . UniPDB . Instituto Europeo de Bioinformática.
- ^ Veitch NC (febrero de 2004). "Peroxidasa de rábano picante: una visión moderna de una enzima clásica". Fitoquímica . 65 (3): 249–59. doi : 10.1016 / j.phytochem.2003.10.022 . PMID 14751298 .
- ^ Akkara JA, Senecal KJ, Kaplan DL (octubre de 1991). "Síntesis y caracterización de polímeros producidos por peroxidasa de rábano picante en dioxano" . Revista de ciencia de polímeros . 29 (11): 1561–74. Código bibliográfico : 1991JPoSA..29.1561A . doi : 10.1002 / pola.1991.080291105 .
- ^ Acharya AP, Nafisi PM, Gardner A, MacKay JL, Kundu K, Kumar S, Murthy N (2013). "Una sonda de peroxidasa fluorescente aumenta la sensibilidad de los ELISA comerciales en dos órdenes de magnitud" . Chem Commun . 49 (88): 10379–10381. doi : 10.1039 / c3cc44783a . PMC 4011665 . PMID 24071916 .
- ^ Chau YP, Lu KS (1995). "Investigación de las propiedades de barrera de sangre-ganglio en ganglios simpáticos de rata mediante el uso de iones de lantano y peroxidasa de rábano picante como trazadores". Acta Anatomica . 153 (2): 135–44. doi : 10.1159 / 000313647 . PMID 8560966 .
- ^ Beyzavi K, Hampton S, Kwasowski P, Fickling S, Marks V, Clift R (marzo de 1987). "Comparación de peroxidasa de rábano picante y anticuerpos marcados con fosfatasa alcalina en inmunoensayos enzimáticos". Annals of Clinical Biochemistry . 24 (Parte 2) (2): 145–52. doi : 10.1177 / 000456328702400204 . PMID 3035992 .
- ^ Ghasempur S, Torabi SF, Ranaei-Siadat SO, Jalali-Heravi M, Ghaemi N, Khajeh K (octubre de 2007). "Optimización del proceso de acoplamiento oxidativo catalizado por peroxidasa para la eliminación de fenol de aguas residuales utilizando metodología de superficie de respuesta". Ciencia y tecnología ambientales . 41 (20): 7073–9. Código bibliográfico : 2007EnST ... 41.7073G . doi : 10.1021 / es070626q . PMID 17993150 .
- ^ Lichtman JW, Purves D (1985). "Marcado celular con peroxidasa de rábano picante" . Principios del desarrollo neuronal . Sunderland, Mass: Sinauer Associates. pag. 114 . ISBN 978-0-87893-744-8.
- ^ Sustrato de ELISA de quimioluminiscencia HRP de alta intensidad Archivado el 8 de abril de 2016 en la Wayback Machine . Haemoscan.com (11 de febrero de 2016). Consultado el 29 de marzo de 2016.
- ^ Wei H, Wang E (julio de 2013). "Nanomateriales con características enzimáticas (nanozimas): enzimas artificiales de próxima generación". Reseñas de la Sociedad Química . 42 (14): 6060–93. doi : 10.1039 / C3CS35486E . PMID 23740388 .
enlaces externos
- Peroxidasa de rábano picante en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .