El dominio NACHT es un dominio proteico conservado evolutivamente . Este dominio NTPasa se encuentra en proteínas de apoptosis , así como en aquellas involucradas en la transcripción de MHC . [1] Su nombre refleja algunas de las proteínas que lo contienen: NAIP ( proteína inhibidora de la apoptosis de la familia NLP ), CIITA (es decir, activador de la transcripción C2TA o MHC clase II ), HET-E (proteína del locus de incompatibilidad de Podospora anserina ) y TEP1 (es decir, TP1 o proteína asociada a telomerasa).
El dominio NACHT contiene de 300 a 400 aminoácidos . Es un dominio de nucleósido-trifosfatasa (NTPasa) predicho, que se encuentra en proteínas animales , fúngicas y bacterianas . Se encuentra en asociación con otros dominios, como el dominio CARD ( InterPro : IPR001315 ), el dominio pyrin ( InterPro : IPR004020 ), el dominio de repetición HEAT ( InterPro : IPR004155 ), la repetición WD40 ( InterPro : IPR001680 ), elrepetición rica en leucina (LRR) o la repetición BIR ( InterPro : IPR001370 ). [1]
El dominio NACHT consta de siete motivos conservados distintos, incluido el bucle P específico de ATP / GTPasa, el sitio de unión de Mg 2+ ( motivos Walker A y B , respectivamente) y cinco motivos más específicos. Las características únicas del dominio NACHT incluyen la prevalencia de residuos 'minúsculos' (glicina, alanina o serina) directamente C-terminal del aspartato coordinante de Mg 2+ en el motivo Walker B, en lugar de un segundo residuo ácido prevalente en otros NTPasas. Un segundo residuo ácido se encuentra típicamente en las proteínas que contienen NACHT dos posiciones aguas abajo. Además, el motivo VII distal contiene un patrón conservado de residuos polares, aromáticos e hidrófobos que no se ve en ninguna otra familia de NTPasa. [1]