Factor de alargamiento negativo
En biología molecular , el NELF (factor de elongación negativo) es un complejo proteico de cuatro subunidades (NELF-A, NELF-B, NELF-C / NELF-D y NELF-E) que impacta negativamente en la transcripción de la ARN polimerasa II (Pol II) pausando aproximadamente 20-60 nucleótidos corriente abajo del sitio de inicio de la transcripción (TSS). [1] [2]
El NELF tiene cuatro subunidades dentro de su complejo que son las siguientes: NELF-A, NELF-B, NELF-C / NELF-D y NELF-E. [2] La subunidad NELF-A está codificada por el gen WHSC2 (candidato 2 al síndrome de Wolf-Hirschhorn). [3] El análisis de microsecuenciación demostró que NELF-B era la proteína previamente identificada como codificada por el gen COBRA1 . Se desconoce si NELF-C y NELF-D son péptidos resultantes del mismo ARNm con diferentes sitios de iniciación de la traducción ; posiblemente difiriendo solo en 9 aminoácidos adicionales para NELF-C en el extremo N, o péptidos de diferentes ARNm por completo. Un solo complejo NELF consta de NELF-C o NELF-D, pero no de ambos. NELF-E también se conoce como RDBP . [1] [4]
NELF se encuentra en el núcleo . NELF se une en un complejo estable con DSIF (factor inductor de sensibilidad al 5,6-dicloro-1-β-d-ribofuranosilbencimidazol (DRB)) y la ARN polimerasa II juntos, pero no solo. Debido a su papel en la transcripción, NELF también es un actor clave en la función negativa de DSIF. [5] NELF también trabaja con DSIF para inhibir la velocidad de Pol II durante la fase de elongación en la transcripción. [5] En D. melanogaster , el gen HSP70 se ve afectado por NELF y DSIF a través de la inducción de una pausa proximal del promotor. [5] Se cree que NELF surgió para ayudar a DSIF amplificando sus efectos negativos con el fin de aumentar el control de la expresión génica. [5] P-TEFb (factor b de elongación de transcripción positiva) inhibe el efecto de NELF y DSIF sobre el alargamiento de Pol II, a través de su fosforilación de la serina -2 del dominio C-terminal de Pol II y la subunidad SPT5 de DSIF, lo que provoca la disociación de NELF . [1] Sin embargo, muchos mecanismos por los que operan NELF y DSIF siguen sin estar claros. [5] Los homólogos de NELF existen en algunos metazoos (por ejemplo, insectos y vertebrados) pero no se han encontrado en plantas, levaduras o nematodos (gusanos). [1] [5]
El complejo NELF también es posiblemente un jugador en la incorporación del gen PCF11 al Pol II detenido en la latencia del VIH-1 . [7] NELF-A puede desempeñar un papel en el fenotipo del síndrome de Wolf-Hirschhorn (WHS), ya que se asigna al área crítica de deleción en el brazo corto del cromosoma 4 . [3] [10] La pausa de Pol II controlada por NELF es una fuente clave de agregación del bucle R en las células epiteliales mamarias que son deficientes en BRCA1, lo que en última instancia podría conducir a la tumorigénesis . [11]
