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Genealogía genética
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Un haplotipo es un grupo de alelos de un organismo que se heredan juntos de un solo padre, [1] [2] y un haplogrupo ( haploide del griego : ἁπλοῦς , haploûs , "onefold, simple" y en inglés: Group ) es un grupo de haplotipos similares que comparten un ancestro común con una mutación de polimorfismo de un solo nucleótido . [3] [4] Más específicamente, un haplogrupo es una combinación de alelosen diferentes regiones cromosómicas que están estrechamente vinculadas y que tienden a heredarse juntas. Como un haplogrupo consta de haplotipos similares, generalmente es posible predecir un haplogrupo a partir de haplotipos. Los haplogrupos pertenecen a una sola línea de descendencia . Como tal, la pertenencia a un haplogrupo, por parte de cualquier individuo, depende de una proporción relativamente pequeña del material genético que posee ese individuo.

Cada haplogrupo se origina y sigue siendo parte de un único haplogrupo (o paragrupo ) anterior. Como tal, cualquier grupo relacionado de haplogrupos puede modelarse con precisión como una jerarquía anidada , en la que cada conjunto (haplogrupo) es también un subconjunto de un conjunto único más amplio (en contraposición, es decir, a los modelos biparentales, como los árboles genealógicos humanos) .

Los haplogrupos se identifican normalmente por una letra inicial del alfabeto, y los refinamientos consisten en combinaciones adicionales de números y letras, como (por ejemplo) A → A1 → A1a .

En genética humana , los haplogrupos más comúnmente estudiados son los haplogrupos del cromosoma Y (ADN-Y) y los haplogrupos del ADN mitocondrial (ADNmt) , cada uno de los cuales puede usarse para definir poblaciones genéticas . El ADN-Y se transmite únicamente a lo largo de la línea patrilineal , de padre a hijo, mientras que el ADNmt se transmite por la línea matrilineal , de la madre a la descendencia de ambos sexos. Ninguno de los dos se recombina y, por lo tanto, el ADN-Y y el ADNmt solo cambian por mutación al azar en cada generación sin mezcla entre el material genético de los padres.

Formación de haplogrupos

  Haplogrupo ancestral
  Haplogrupo A (Hg A)
  Haplogrupo B (Hg B)
Todas estas moléculas son parte del haplogrupo ancestral, pero en algún momento del pasado ocurrió una mutación en la molécula ancestral, la mutación A, que produjo un nuevo linaje; este es el haplogrupo A y se define por la mutación A. En algún momento más reciente del pasado, ocurrió una nueva mutación, la mutación B, en una persona portadora del haplogrupo A; la mutación B define el haplogrupo B. El haplogrupo B es un subgrupo o subclade del haplogrupo A; ambos haplogrupos A y B son subclades del haplogrupo ancestral.

Las mitocondrias son pequeños orgánulos que se encuentran en el citoplasma de las células eucariotas , como las de los humanos. Su función principal es proporcionar energía a la célula. Se cree que las mitocondrias son descendientes reducidos de bacterias simbióticas que alguna vez tuvieron vida libre. Una indicación de que las mitocondrias alguna vez tuvieron vida libre es que cada una contiene un ADN circular , llamado ADN mitocondrial (ADNmt), cuya estructura es más similar a las bacterias que a los organismos eucariotas (ver teoría endosimbiótica ). La inmensa mayoría del ADN humano está contenida en los cromosomas del núcleo.de la célula, pero el mtDNA es una excepción. Un individuo hereda su citoplasma y los orgánulos contenidos por ese citoplasma exclusivamente del óvulo materno (óvulo); los espermatozoides solo transmiten el ADN cromosómico, todas las mitocondrias paternas se digieren en el ovocito . Cuando surge una mutación en una molécula de mtDNA, la mutación pasa, por tanto, en una línea directa de descendencia femenina. Las mutaciones son errores de copia en la secuencia del ADN . Los errores únicos se denominan polimorfismos de un solo nucleótido (SNP). [ dudoso - discutir ]

Los cromosomas Y humanos son cromosomas sexuales específicos de los hombres ; casi todos los seres humanos que poseen un cromosoma Y serán morfológicamente masculinos. Aunque los cromosomas Y están situados en el núcleo celular y emparejados con los cromosomas X , solo se recombinan con el cromosoma X en los extremos del cromosoma Y ; el 95% restante del cromosoma Y no se recombina. Por lo tanto, el cromosoma Y y cualquier mutación que surja en él se transmiten de padres a hijos en una línea directa de ascendencia masculina. Esto significa que el cromosoma Y y el mtDNA comparten propiedades específicas.

Otros cromosomas, autosomas y cromosomas X en las mujeres comparten su material genético (llamado cruzamiento que conduce a la recombinación) durante la meiosis (un tipo especial de división celular que ocurre con el propósito de la reproducción sexual ). Efectivamente, esto significa que el material genético de estos cromosomas se mezcla en cada generación, por lo que cualquier nueva mutación se transmite aleatoriamente de padres a hijos.

La característica especial que muestran tanto los cromosomas Y como el ADNmt es que las mutaciones pueden acumularse a lo largo de un cierto segmento de ambas moléculas y estas mutaciones permanecen fijas en el ADN. Además, también se puede inferir la secuencia histórica de estas mutaciones. Por ejemplo, si un conjunto de diez cromosomas Y (derivados de diez hombres diferentes) contiene una mutación, A, pero solo cinco de estos cromosomas contienen una segunda mutación, B, entonces debe darse el caso de que la mutación B ocurrió después de la mutación A.

Además, los diez hombres que portan el cromosoma con la mutación A son descendientes directos de la línea masculina del mismo hombre que fue la primera persona en portar esta mutación. El primer hombre en portar la mutación B también era un descendiente directo de la línea masculina de este hombre, pero también es el ancestro directo de la línea masculina de todos los hombres portadores de la mutación B. Series de mutaciones como esta forman linajes moleculares. Además, cada mutación define un conjunto de cromosomas Y específicos llamados haplogrupo.

Todos los hombres portadores de la mutación A forman un solo haplogrupo, y todos los hombres portadores de la mutación B forman parte de este haplogrupo, pero la mutación B también define un haplogrupo más reciente (que es un subgrupo o subclade ) propio al que los hombres portadores solo de la mutación A lo hacen no pertenecer. Tanto el ADNmt como los cromosomas Y se agrupan en linajes y haplogrupos; estos se presentan a menudo como diagramas en forma de árbol.

Genética de poblaciones de haplogrupos

Por lo general, se asume que hay poca selección natural a favor o en contra de una mutación de haplotipo particular que ha sobrevivido hasta el día de hoy, [ cita requerida ] por lo que, aparte de las tasas de mutación (que pueden variar de un marcador a otro), el principal impulsor de la genética de poblaciones Lo que afecta las proporciones de haplotipos en una población es la deriva genética, fluctuación aleatoria causada por la aleatoriedad del muestreo de qué miembros de la población pasan su ADN a los miembros de la siguiente generación del sexo apropiado.

Esto hace que la prevalencia de un marcador particular en una población continúe fluctuando, hasta que llegue al 100% o se elimine por completo de la población. En una población grande con una mezcla eficiente, la tasa de deriva genética de los alelos comunes es muy baja; sin embargo, en una población de mestizaje muy pequeña, las proporciones pueden cambiar mucho más rápidamente. Las marcadas variaciones geográficas y concentraciones de haplotipos y grupos de haplotipos particulares, por lo tanto, atestiguan los efectos distintivos de los cuellos de botella repetidos de la población o los eventos fundadores seguidos de separaciones y aumentos de la población.

Los linajes que se pueden rastrear desde el presente no reflejarán la variación genética completa de la población de mayor edad: la deriva genética significa que algunas de las variantes habrán desaparecido. El costo de las pruebas completas de secuencia de ADN-Y y ADNmt ha limitado la disponibilidad de datos; sin embargo, su costo se ha reducido drásticamente en la última década. Los tiempos de coalescencia de los haplotipos y las prevalencias geográficas actuales conllevan incertidumbres de error considerables. Esto es especialmente problemático para los tiempos de coalescencia, porque la mayoría de los genetistas de poblaciones todavía continúan (aunque disminuyendo un poco) utilizando el "método Zhivotovski", que es muy criticado por los genealogistas del ADN por su falsedad. [ cita requerida ] La avispa eusocial Angiopolybia pallens se presenta con 8 haplogrupos dependiendo de su ubicación. Esto muestra la idea de deriva genética.

Haplogrupos de ADN del cromosoma Y humano

Los haplogrupos de ADN del cromosoma Y humano (ADN-Y) se nombran de la A a la T y se subdividen mediante números y letras minúsculas. Las designaciones de haplogrupo del cromosoma Y las establece el Y Chromosome Consortium. [5]

Árbol filogenético de haplogrupos de ADN del cromosoma Y humano [χ 1] [χ 2]
" Adán cromosómico Y "
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BConnecticut
DelawareCF
DmiCF
F1 F2 F3 GHIJK
GRAMOHIJK
IJKH
IJK
I  J    LT  [χ 5]      K2  [χ 6]
L    T   K2a  [χ 7]       K2b  [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313  [χ 10]    K2b1  [χ 11]P  [χ 12]
NO  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
norteOQR
ADN-Y por población Haplogrupos de ADN-Y de personas históricas Notas al pie  ^ Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). "Ver la madera para los árboles: una filogenia de referencia mínima para el cromosoma Y humano". Mutación humana . 35 (2): 187–91. doi : 10.1002 / humu.22468 . PMID  24166809 . ^ Sociedad Internacional de Genealogía Genética (ISOGG; 2015), Y-DNA Haplogroup Tree 2015 . (Fecha de acceso: 1 de febrero de 2015.) ^ El haplogrupo A0-T también se conoce como A-L1085 (y anteriormente como A0'1'2'3'4). ^ El haplogrupo A1 también se conoce como A1'2'3'4. ^ Haplogroup LT (L298 / P326) también se conoce como Haplogroup K1. ^ Entre 2002 y 2008, Haplogroup T-M184 se conocía como "Haplogroup K2". Desde entonces, ese nombre ha sido reasignado a K-M526 , el hermano de Haplogroup LT. ↑ Haplogroup K2a (M2308) y su subclade primario K-M2313 se separaron del Haplogroup NO (F549) en 2016. (Esto siguió a la publicación de: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL, et al. (2016). " Ráfagas puntuadas en demografía varón humano inferido a partir de secuencias del cromosoma Y 1244 en todo el mundo" . Nature Genetics . 48 (6): 593-9. doi : 10.1038 / ng.3559 . PMC 4.884.158 . PMID 27111036 .   En el pasado, otros haplogrupos, incluidos NO (M214) y K2e, también se habían identificado con el nombre "K2a". ^ Haplogroup K2b (M1221 / P331 / PF5911) también se conoce como Haplogroup MPS. ^ El haplogrupo K2e (K-M147) se conocía anteriormente como "Haplogrupo X" y "K2a" (pero es un subclade hermano del actual K2a). ^ K-M2313 *, que aún no tiene nombre filogenético, se ha documentado en dos individuos vivos, que tienen vínculos étnicos con la India y el sudeste asiático. Además, se ha encontrado K-Y28299, que parece ser una rama principal de K-M2313, en tres individuos vivos de la India. Ver: Poznik op. cit. ; YFull YTree v5.08 , 2017, "K-M2335" y; PhyloTree , 2017, "Detalles de los marcadores Y-SNP incluidos en el árbol Y mínimo" (Fecha de acceso a estas páginas: 9 de diciembre de 2017) ^ Haplogroup K2b1 (P397 / P399) también se conoce como Haplogroup MS, pero tiene una estructura interna más amplia y compleja. ^ El haplogrupo P (P295) también se conoce como K2b2. ^ Haplogroup S, a partir de 2017, también se conoce como K2b1a. (Anteriormente, el nombre Haplogroup S se asignaba a K2b1a4). ^ Haplogrupo M, a partir de 2017, también se conoce como K2b1b. (Anteriormente, el nombre Haplogroup M se asignaba a K2b1d).

Adán cromosómico Y es el nombre dado por los investigadores al macho que es el ancestro patrilineal común (linaje masculino) más reciente de todos los seres humanos vivos.

Los principales haplogrupos del cromosoma Y y sus regiones geográficas de aparición (antes de la reciente colonización europea) incluyen:

Grupos sin mutación M168

  • Haplogrupo A (M91) (África, especialmente Khoisan y Nilotes )
  • Haplogrupo B (M60) (África, especialmente los pigmeos y Hadzabe )

Grupos con mutación M168

(la mutación M168 ocurrió ~ 50.000 pb)

  • Haplogrupo C (M130) (Oceanía, Norte / Centro / Este de Asia, Norteamérica y una presencia menor en Sudamérica, Sudeste de Asia, Sur de Asia, Oeste de Asia y Europa)
  • YAP + haplogrupos
    • Haplogrupo DE (M1, M145, M203)
      • Haplogrupo D (CTS3946) (Tíbet, Japón, las islas Andamán, Asia central y presencia esporádica en Nigeria, Siria y Arabia Saudita)
      • Haplogrupo E (M96)
        • Haplogrupo E1b1a (V38) África occidental y regiones circundantes; anteriormente conocido como E3a
        • Haplogrupo E1b1b (M215) Asociado con la propagación de lenguas afroasiáticas; ahora concentrado en el norte de África y el Cuerno de África, así como en partes de Oriente Medio, el Mediterráneo y los Balcanes; anteriormente conocido como E3b

Grupos con mutación M89

(la mutación M89 ocurrió ~ 45.000 pb)

  • Haplogrupo F (M89) Oceanía, Europa, Asia, América del Norte y del Sur
    • Haplogrupo FT (P14, M213) (China, Vietnam, [6] Singapur [7] )
  • Haplogrupo G (M201) (presente entre muchos grupos étnicos en Eurasia, generalmente con baja frecuencia; más común en el Cáucaso, la meseta iraní y Anatolia; en Europa principalmente en Grecia, Italia, Iberia , Tirol, Bohemia; raro en el norte Europa)
  • Haplogrupo H (L901 / M2939)
    • H1'3 (Z4221 / M2826, Z13960)
      • H1 (L902 / M3061)
        • H1a (M69 / Page45) India, Sri Lanka, Nepal, Pakistán, Irán, Asia central
        • H1b (B108) Encontrado en un individuo birmano en Myanmar . [7]
      • H3 (Z5857) India, Sri Lanka, Pakistán, Baréin, Qatar
    • H2 (P96) Anteriormente conocido como haplogrupo F3. Se encuentra con baja frecuencia en Europa y Asia occidental.
  • Haplogrupo IJK (L15, L16)

Grupos con mutaciones L15 y L16

  • Haplogrupo IJK (L15, L16)
    • Haplogrupo IJ (S2, S22)
      • Haplogrupo I (M170, P19, M258) (generalizado en Europa, se encuentra con poca frecuencia en partes de Oriente Medio y prácticamente ausente en otros lugares [8] )
        • Haplogrupo I1 (M253, M307, P30, P40) (Norte de Europa, dominante en Escandinavia)
        • Haplogrupo I2 (S31) (Europa central y sudoriental, Cerdeña, Balcanes)
      • Haplogrupo J (M304) (Oriente Medio, Turquía, Cáucaso, Italia, Grecia, los Balcanes, África del Norte)
        • Haplogrupo J * (se encuentra principalmente en Socotra , con algunas observaciones en Pakistán , Omán , Grecia , la República Checa y entre los pueblos turcos )
        • Haplogrupo J1 (M267) (Principalmente asociado con pueblos semíticos en el Medio Oriente, pero también se encuentra en; Europa mediterránea, Etiopía, África del Norte, Irán, Pakistán, India y con los pueblos del noreste del Cáucaso en Daguestán ; J1 con DYS388 = 13 está asociado con el este. Anatolia)
        • Haplogrupo J2 (M172) (Se encuentra principalmente en Asia Occidental, Asia Central, Europa Meridional y África del Norte)
    • Haplogrupo K (M9, P128, P131, P132)

Grupos con mutación M9

(la mutación M9 ocurrió ~ 40.000 pb )

  • Haplogrupo K
    • Haplogrupo LT (L298 / P326)
      • Haplogrupo L (M11, M20, M22, M61, M185, M295) (Sur de Asia, Asia central, Sudoeste de Asia, el Mediterráneo)
      • Haplogrupo T (M70, M184 / USP9Y + 3178, M193, M272) (África del Norte, Cuerno de África, Sudoeste de Asia, Mediterráneo, Sur de Asia); anteriormente conocido como haplogrupo K2
    • Haplogrupo K (xLT) (rs2033003 / M526)
Grupos con mutación M526
    • Haplogrupo M (P256) (Nueva Guinea, Melanesia, este de Indonesia)
    • Haplogrupo NO (M214)
      • Haplogrupo N (M231) (más septentrional de Eurasia)
      • Haplogrupo O (M175) (Este de Asia, Sudeste de Asia, Pacífico Sur, Sur de Asia, Asia Central)
        • Haplogrupo O1 (F265)
          • Haplogrupo O1a (M119)
          • Haplogrupo O1b (P31, M268)
        • Haplogrupo O2 (M122)
    • Haplogrupo P-M45 (M45) (M45 ocurrió ~ 35.000 pb)
      • Haplogrupo Q-M242 (M242) (Ocurrió ~ 15.000 a 20.000 pb. Se encuentra en Asia y las Américas)
        • Haplogrupo Q-M3 (M3) (América del Norte, América Central y América del Sur)
      • Haplogrupo R (M207)
        • Haplogrupo R1 (M173)
          • Haplogrupo R1a (M17) (Asia central, Asia meridional y Europa central, septentrional y oriental)
          • Haplogrupo R1b (M343) (Europa, Cáucaso, Asia Central, Asia del Sur, África del Norte, África Central)
        • Haplogrupo R2 (M124) (Asia del Sur, Cáucaso, Asia Central)
    • Haplogrupo S (M230, P202, P204) (Nueva Guinea, Melanesia, este de Indonesia)

Haplogrupos de ADN mitocondrial humano

Migraciones humanas y haplogrupos mitocondriales

Los haplogrupos de ADNmt humano están rotulados con las siguientes letras: A , B , C , CZ , D , E , F , G , H , HV , I , J , pre JT , JT , K , L0 , L1 , L2 , L3 , L4 , L5 , L6 , M , N , P , Q , R , R0 , S , T , U , V , W , X , Y , y Z . Mannis van Oven mantiene la versión más actualizada del árbol de ADNmt en el sitio web PhyloTree. [9]

Árbol filogenético de haplogrupos de ADN mitocondrial humano (ADNmt)

 Eva mitocondrial ( L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
METROnorte 
CZDmiGRAMOQ OASR IWXY
CZBFR0 pre-JT PAG U
HVJTK
HVJT

Eva mitocondrial es el nombre dado por los investigadores a la mujer que es el antepasado matrilineal común más reciente (linaje femenino) de todos los seres humanos vivos.

Definición de poblaciones

Mapa de la migración de haplotipos humanos, de acuerdo con el ADN mitocondrial , con clave (coloreada) que indica períodos numerados miles de años antes del presente.

Los haplogrupos se pueden utilizar para definir poblaciones genéticas y, a menudo, están orientados geográficamente. Por ejemplo, las siguientes son divisiones comunes para los haplogrupos de ADNmt:

  • Africano: L0 , L1 , L2 , L3 , L4 , L5 , L6
  • Eurasia occidental: H , T , U , V , X , K , I , J , W (todos los haplogrupos de Eurasia occidental enumerados se derivan del macrohaplogrupo N ) [10]
  • Eurasiático oriental: A , B , C , D , E , F , G , Y , Z (nota: C, D, E, G y Z pertenecen al macrohaplogrupo M )
  • Nativo americano: A , B , C , D , X
  • Australo-melanesio : P , Q , S

Los haplogrupos mitocondriales se dividen en tres grupos principales, que se designan con las letras secuenciales L, M, N. La humanidad se divide primero dentro del grupo L entre L0 y L1-6. L1-6 dio lugar a otros grupos L, uno de los cuales, L3, se dividió en el grupo M y N.

El grupo M comprende la primera ola de migración humana que se cree que se desarrolló fuera de África, siguiendo una ruta hacia el este a lo largo de las zonas costeras del sur. Los linajes descendientes del haplogrupo M se encuentran ahora en Asia, las Américas y Melanesia, así como en partes del Cuerno de África y África del Norte; casi ninguno se ha encontrado en Europa. El haplogrupo N puede representar otro macrolinaje que evolucionó fuera de África, dirigiéndose hacia el norte en lugar de hacia el este. Poco después de la migración, el gran grupo R se separó del N.

El haplogrupo R consta de dos subgrupos definidos sobre la base de sus distribuciones geográficas, uno que se encuentra en el sureste de Asia y Oceanía y el otro que contiene casi todas las poblaciones europeas modernas. El haplogrupo N (xR), es decir, el ADNmt que pertenece al grupo N pero no a su subgrupo R, es típico de las poblaciones aborígenes australianas, aunque también está presente en bajas frecuencias entre muchas poblaciones de Eurasia y las Américas.

El tipo L se compone de casi todos los africanos.

El tipo M consta de:

M1 - Poblaciones de Etiopía, Somalia e India. Probablemente debido al gran flujo de genes entre el Cuerno de África y la Península Arábiga (Arabia Saudita, Yemen, Omán), separados solo por un estrecho estrecho entre el Mar Rojo y el Golfo de Adén.

CZ: muchos siberianos; rama C: algunos amerindios; rama Z: muchos saamis, algunos coreanos, algunos del norte de China y algunas poblaciones de Asia central.

D - Algunos amerindios, muchos siberianos y asiáticos del noreste

E - Malayo, Borneo, Filipinas, aborígenes taiwaneses , Papua Nueva Guinea

G: muchos siberianos del noreste, asiáticos del noreste y asiáticos centrales

Q - Poblaciones de Melanesia, Polinesia, Nueva Guinea

El tipo N consta de:

A - Se encuentra en muchos amerindios y algunos asiáticos orientales y siberianos.

I - 10% de frecuencia en el norte y este de Europa

S - Algunos aborígenes australianos

W: algunos europeos del este, del sur de Asia y del sudeste de Asia

X - Algunos amerindios, siberianos del sur, asiáticos del sudoeste y europeos del sur

Y - La mayoría de Nivkhs y gente de Nias ; muchos Ainus, Tungusic y Austronesians ; También se encuentra con baja frecuencia en algunas otras poblaciones de Siberia, Asia oriental y Asia central.

R : grupo grande que se encuentra dentro del tipo N. Las poblaciones que contiene se pueden dividir geográficamente en Eurasia occidental y Eurasia oriental. Casi todas las poblaciones europeas y un gran número de la población de Oriente Medio hoy en día se encuentran dentro de esta rama. Un porcentaje menor está contenido en otros grupos de tipo N (ver arriba). A continuación se muestran los subclades de R :

B - Algunos chinos, tibetanos, mongoles, asiáticos centrales, coreanos, amerindios, siberianos del sur, japoneses, austronesios

F - Se encuentra principalmente en el sureste de Asia, especialmente en Vietnam ; 8,3% en la isla de Hvar en Croacia. [11]

R0 - Encontrado en Arabia y entre etíopes y somalíes; rama HV (rama H; rama V) - Europa, Asia Occidental, África del Norte;

Pre-JT - Surgió en el Levante (área moderna del Líbano), que se encuentra con una frecuencia del 25% en las poblaciones beduinas; rama JT (rama J; rama T) - Norte, Europa del Este, Indo, Mediterráneo

U - Alta frecuencia en Eurasia occidental, subcontinente indio y Argelia, que se encuentra desde la India hasta el Mediterráneo y el resto de Europa; U5, en particular, muestra una alta frecuencia en Escandinavia y los países bálticos, con la mayor frecuencia en el pueblo Sami .

Asignación geográfica de haplogrupos del cromosoma Y y del ADNmt

Aquí hay una lista de asignación geográfica de haplogrupos del cromosoma Y y del ADNmt propuesta por Bekada et al. 2013. [12]

Cromosoma Y

Según SNPS, los haplogrupos que tienen la edad del primer evento de extinción tienden a rondar los 45-50 kya. Los haplogrupos del segundo evento de extinción parecían divergir 32-35 kya según Mal'ta. El evento de extinción de la zona cero parece ser Toba durante el cual el haplogrupo CDEF * pareció divergir en C, DE y F. C y F no tienen casi nada en común, mientras que D y E tienen mucho en común. El evento de extinción # 1 según las estimaciones actuales ocurrió después de Toba, aunque el ADN antiguo más antiguo podría empujar el evento de extinción de la zona cero mucho antes de Toba, y empujar el primer evento de extinción aquí de regreso a Toba. Los haplogrupos con notas de eventos de extinción tienen un origen dudoso y esto se debe a que los eventos de extinción conducen a cuellos de botella severos, por lo que todas las notas de estos grupos son solo conjeturas. Tenga en cuenta que el recuento de SNP del ADN antiguo puede ser muy variable, lo que significa que, aunque todos estos grupos divergieron al mismo tiempo, nadie sabe cuándo. [13] [14]

OrigenHaplogrupoMarcador
Europa (¿Segundo evento de extinción?)IM170, M253, P259, M227, M507
EuropaI1bP215, M438, P37.2, M359, P41.2
EuropaI1b2M26
EuropaI1cM223, M284, P78, P95
EuropaJ2a1M47
EuropaJ2a2M67, M166
EuropaJ2a2aM92
EuropaJ2bM12, M102, M280, M241
EuropaR1b1b1aM412, P310
EuropaR1b1b1a1L11
EuropaR1b1b1a1aU106
EuropaR1b1b1a1bU198, P312, S116
EuropaR1b1b1a1b1U152
EuropaR1b1b1a1b2M529
EuropaR1b1b1a1b3,4M65, M153
EuropaR1b1b1a1b5SRY2627
Asia meridional o MelanesiaC1 (anteriormente conocido como CxC3)Z1426
Asia del NorteC2 (anteriormente conocido como C3)M217 +
Indonesia o el sur de Asia (¿primer evento de extinción?)FM89, M282
Europa (Cáucaso) (¿Segundo evento de extinción?)GRAMOM201, M285, P15, P16, M406
Asia del SurHM69, M52, M82, M197, M370
Europa o Medio Oriente (¿Segundo evento de extinción?)J1M304, M267, P58, M365, M368, M369
Europa o Medio Oriente (¿Segundo evento de extinción?)J2M172, M410, M158, M319, DYS445 = 6, M339, M340
Al oeste de Birmania en Eurasia (¿primer evento de extinción?) [15]
Indonesia (¿primer evento de extinción?) [15]K2 (NOPS)M526
Asia del SurLM11, M20, M27, M76, M317, M274, M349, M357
Asia oriental, Asia sudorientalnorteM231, M214, LLY22g, Tat, M178
Este de Asia, Sudeste de Asia, Sur de Asia (¿Segundo evento de extinción?)OM175, M119
Indonesia, Filipinas (¿primer evento de extinción?)P (xQR)92R7, M207, M173, M45
Sur de Asia, Siberia (¿Segundo evento de extinción?)División R y Q (QR) [15]MEH2, M242, P36.2, M25, M346
Medio Oriente, Europa, Siberia, Sur de AsiaR1a1M420, M17, M198, M204, M458
Anatolia, sudeste de Europa?R1bM173, M343, P25, M73
EuropaR1b1bM269
EuropaR1b1b1L23
Pakistán, India (¿Segundo evento de extinción?)R2M479, M124
Oriente MedioTM70
África del NorteE1b1b1M35
África del NorteE1b1b1aM78
Asia occidentalE1b1b1a2V13
África del NorteE1b1b1a1V12
África del NorteE1b1b1a1bV32
África del NorteE1b1b1a3V22
África del NorteE1b1b1a4V65
África del NorteE1b1b1bM81
África del NorteE1b1b1cM123, M34
África occidental, África del norteAM91, M13
este de AfricaBM60, M181, SRY10831.1, M150, M109, M112
Asia, AfricaDelawareM1, YAP, M174, M40, M96, M75, M98
Este de Asia,DM174
África occidental (¿primer evento de extinción?)E1aM33
África oriental (el primer evento de extinción es la división entre E1b1 y E1a, el segundo evento de extinción es la división entre E1b1b y E1b1a)E1b1P2, M2, U175, M191
Oriente MedioR1b1aV88, M18

ADNmt

OrigenHaplogrupo
EuropaH1
EuropaH11a
EuropaH1a
EuropaH1b
EuropaH2a
EuropaH3
EuropaH5a
EuropaH6a
EuropaH7
EuropaHV0 / HV0a / V
EuropaI4
EuropaJ1c7
EuropaJ2b1
EuropaT2b *
EuropaT2b4
EuropaT2e
EuropaU4c1
EuropaU5 *
EuropaU5a
EuropaU5a1b1
EuropaU5b *
EuropaU5b1b *
EuropaU5b1c
EuropaU5b3
EuropaX2c'e
Oriente MedioI
Oriente MedioA
Oriente MedioB
Oriente MedioC / Z
Oriente MedioD / G / M9 / E
Oriente MedioF
Oriente MedioH *
Oriente MedioH13a1
Oriente MedioH14a
Oriente MedioH20
Oriente MedioH2a1
Oriente MedioH4
Oriente MedioH6b
Oriente MedioH8
Oriente MedioHV1
Oriente MedioI1
Oriente MedioJ / J1c / J2
Oriente MedioJ1a'b'e
Oriente MedioJ1b1a1
Oriente MedioJ1b2a
Oriente MedioJ1d / J2b
Oriente MedioJ1d1
Oriente MedioJ2a
Oriente MedioJ2a2a1
Oriente MedioK *
Oriente MedioK1a *
Oriente MedioK1b1 *
Oriente MedioN1a *
Oriente MedioN1b
Oriente MedioN1c
Oriente MedioN2
Oriente MedioN9
Oriente MedioR *
Oriente MedioR0a
Oriente MedioT
Oriente MedioT1 *
T1a
Oriente MedioT2
Oriente MedioT2c
Oriente MedioT2i
Oriente MedioU1 *
Oriente MedioU2 *
Oriente MedioU2e
EurasiaU3 *
Oriente MedioU4
Oriente MedioU4a *
Oriente MedioU7
Oriente MedioU8 *
Oriente MedioU9a
Oriente MedioX
Oriente MedioX1a
Oriente MedioX2b1
África del NorteL3e5
África del NorteM1
África del NorteM1a1
África del NorteU6a
África del NorteU6a1'2'3
África del NorteU6b'c'd
este de AfricaL0 *
este de AfricaL0a1
este de AfricaL0a1b
este de AfricaL0a2 *
este de AfricaL3c / L4 / M
este de AfricaL3d1a1
este de AfricaL3d1d
este de AfricaL3e1 *
este de AfricaL3f *
este de AfricaL3h1b *
este de AfricaL3i *
este de AfricaL3x *
este de AfricaL4a'b *
este de AfricaL5 *
este de AfricaL6
este de AfricaN * / M * / L3 *
África occidentalL1b *
África occidentalL1b3
África occidentalL1c *
África occidentalL1c2
África occidentalL2 *
África occidentalL2a
África occidentalL2a1 *
África occidentalL2a1a2'3'4
África occidentalL2a1b
África occidentalL2a1b'f
África occidentalL2a1c1'2
África occidentalL2a1 (16189)
África occidentalL2a2
África occidentalL2b *
África occidentalL2c1'2
África occidentalL2d
África occidentalL2e
África occidentalL3b
África occidentalL3b1a3
África occidentalL3b (16124!)
África occidentalL3b2a
África occidentalL3d *
África occidentalL3e2'3'4
África occidentalL3f1b *

Ver también

  • Proyecto Internacional HapMap
  • Evolución molecular
  • Filogenia molecular
  • Genética evolutiva humana
  • Raza (biología) / Raza (categorización humana)
  • Genealogía genética
  • Prueba de ADN genealógica
  • Lista de temas de genealogía genética
  • Lista de haplogrupos de personas notables

Referencias

  1. ^ Por C. Barry Cox, Peter D. Moore, Richard Cucharón. Wiley-Blackwell, 2016. ISBN 978-1-118-96858-1 p. 106. Biogeografía: un enfoque ecológico y evolutivo 
  2. ^ Consejo editorial, V&S Publishers, 2012, ISBN 9381588643 p. 137. Concise Dictionary of Science 
  3. ^ Arora, Devender; Singh, Ajeet; Sharma, Vikrant; Bhaduria, Harvendra Singh; Patel, Ram Bahadur (2015). "Hgs Db : base de datos de haplogrupos para comprender la migración y la evaluación del riesgo molecular" . Bioinformación . 11 (6): 272–75. doi : 10.6026 / 97320630011272 . PMC 4512000 . PMID 26229286 .  
  4. ^ Glosario de genética de la Sociedad Internacional de Genealogía Genética 2015
  5. ^ "Consorcio del cromosoma Y" . Archivado desde el original el 16 de enero de 2017 . Consultado el 27 de julio de 2005 .
  6. ^ Poznik, G. David; Xue, Yali; Méndez, Fernando L .; et al. (2016). "Ráfagas puntuadas en la demografía masculina humana inferida de 1.244 secuencias del cromosoma Y en todo el mundo" . Genética de la naturaleza . 48 (6): 593–599. doi : 10.1038 / ng.3559 . PMC 4884158 . PMID 27111036 .  
  7. ^ a b Karmin, Monika; Saag, Lauri; Vicente, Mário; et al. (2015). "Un cuello de botella reciente de la diversidad del cromosoma Y coincide con un cambio global en la cultura" . Investigación del genoma . 25 (4): 459–466. doi : 10.1101 / gr.186684.114 . PMC 4381518 . PMID 25770088 .  
  8. ^ Rootsi S, Magri C, Kivisild T, Benuzzi G, Help H, Bermisheva M, Kutuev I, Barać L, Pericić M, Balanovsky O, Pshenichnov A, Dion D, Grobei M, Zhivotovsky LA, Battaglia V, Achilli A, Al -Zahery N, Parik J, King R, Cinnioğlu C, Khusnutdinova E, Rudan P, Balanovska E, Scheffrahn W, Simonescu M, Brehm A, Goncalves R, Rosa A, Moisan JP, Chaventre A, Ferak V, Füredi S, Oefner PJ, Shen P, Beckman L, Mikerezi I, Terzić R, Primorac D, Cambon-Thomsen A, Krumina A, Torroni A, Underhill PA, Santachiara-Benerecetti AS, Villems R, Semino O (julio de 2004). "La filogeografía del haplogrupo I del cromosoma Y revela distintos dominios del flujo de genes prehistóricos en Europa" (PDF) . Revista Estadounidense de Genética Humana . 75 (1): 128–37. doi : 10.1086 / 422196 . PMC  1181996 . PMID  15162323 . Archivado desde el original (PDF) el 24 de junio de 2009 . Consultado el 8 de marzo de 2007 .
  9. ^ "PhyloTree.org" .
  10. ^ Loogväli EL, Roostalu U, Malyarchuk BA, Derenko MV, Kivisild T, Metspalu E, et al. (2004). "Uniformidad de desunión: un lienzo cladístico pied del haplogrupo H del mtDNA en Eurasia" . Mol. Biol. Evol . 21 (11): 2012–21. doi : 10.1093 / molbev / msh209 . PMID 15254257 . 
  11. ^ Tolk HV, Barac L, Pericic M, Klaric IM, Janicijevic B, Campbell H, Rudan I, Kivisild T, Villems R, Rudan P (septiembre de 2001). "La evidencia del haplogrupo F del mtDNA en una población europea y sus implicaciones etnohistóricas" . Revista europea de genética humana . 9 (9): 717–23. doi : 10.1038 / sj.ejhg.5200709 . PMID 11571562 . 
  12. ^ Bekada A, Fregel R, Cabrera VM, Larruga JM, Pestano J, Benhamamouch S, González AM (2013). "Introducción del ADN mitocondrial argelino y los perfiles del cromosoma Y en el paisaje del norte de África" . PLOS ONE . 8 (2): e56775. doi : 10.1371 / journal.pone.0056775 . PMC 3576335 . PMID 23431392 .  
  13. ^ "Los ancestros genéticos comunes vivieron durante aproximadamente el mismo período de tiempo" . 1 de agosto de 2013 . Consultado el 23 de enero de 2015 .
  14. ^ Raghavan M, Skoglund P, Graf KE, Metspalu M, Albrechtsen A, Moltke I, Rasmussen S, Stafford TW, Orlando L, Metspalu E, Karmin M, Tambets K, Rootsi S, Mägi R, Campos PF, Balanovska E, Balanovsky O, Khusnutdinova E, Litvinov S, Osipova LP, Fedorova SA, Voevoda MI, DeGiorgio M, Sicheritz-Ponten T, Brunak S, Demeshchenko S, Kivisild T, Villems R, Nielsen R, Jakobsson M, Willerslev E (enero de 2014). "El genoma siberiano del Paleolítico superior revela la ascendencia dual de los nativos americanos" . Naturaleza . 505 (7481): 87–91. doi : 10.1038 / nature12736 . PMC 4105016 . PMID 24256729 .  
  15. ^ a b c Karafet TM, Mendez FL, Sudoyo H, Lansing JS, Hammer MF (marzo de 2015). "Resolución filogenética mejorada y diversificación rápida del haplogrupo K-M526 del cromosoma Y en el sudeste asiático" . Revista europea de genética humana . 23 (3): 369–73. doi : 10.1038 / ejhg.2014.106 . PMC 4326703 . PMID 24896152 .  

Enlaces externos

General

  • El Proyecto Genográfico

todos los haplogrupos de ADN

Cromosoma Y

  • https://web.archive.org/web/20040728005528/http://www.scs.uiuc.edu/~mcdonald/WorldHaplogroupsMaps.pdf

Haplogrupos de ADN del cromosoma Y

  • Consorcio del cromosoma Y
  • Árbol de haplogrupos ISOGG Y-DNA
  • Árbol Y de PhyloTree Una filogenia de referencia mínima para el cromosoma Y humano
  • Predictor de haplogrupos
  • The Y Chromosome Consortium (2002), Un sistema de nomenclatura para el árbol de los haplogrupos binarios cromosómicos Y humanos , Genome Research, vol. 12 (2), 339–48, febrero de 2002. (El gráfico jerárquico detallado tiene conversiones de esquemas de nomenclatura anteriores).
  • Semino y col. (2000), The Genetic Legacy of Paleolithic Homo sapiens sapiens in Extant Europeans , Science, Vol 290 (artículo que introdujo los haplogrupos "Eu").
  • Atlas etnográfico y genográfico de Y-DNA y compilación de datos de código abierto

Haplogrupos de ADN mitocondrial

  • PhyloTree: el árbol filogenético de la variación global del ADN mitocondrial humano [1]
  • PhyloD3 - árbol filogenético basado en D3.js basado en PhyloTree
  • MitoTool: un servidor web para el análisis y la recuperación de variaciones de la secuencia del ADN mitocondrial humano
  • HaploGrep: clasificación automática de haplogrupos de ADN mitocondrial basada en PhyloTree Archivado el 12 de junio de 2016 en la Wayback Machine.
  • HaploFind: proceso rápido de asignación automática de haplogrupos para el ADN mitocondrial humano
  • esqueleto gráfico de haplogrupo de ADNmt
  • La creación del paisaje africano del ADNmt
  • ¿Los cuatro clados del haplogrupo L2 del ADNmt evolucionan a diferentes velocidades?

Software

  • Navegador de haplogrupos de ADN Y
  1. ^ "PhyloTree.org" .