amplificación transcripcional
En genética , la amplificación transcripcional es el proceso en el que las cantidades totales de moléculas de ARN mensajero (ARNm) de los genes expresados aumentan durante la enfermedad, el desarrollo o en respuesta a estímulos.
En el subconjunto de genes expresados en una célula determinada, la actividad de transcripción de la ARN polimerasa II da como resultado la producción de ARNm. La amplificación transcripcional se define específicamente como el aumento en la abundancia por célula de este conjunto de ARNm expresados. La amplificación transcripcional es causada por cambios en la cantidad o actividad de las proteínas reguladoras de la transcripción.
La expresión génica está regulada por numerosos tipos de proteínas que influyen directa o indirectamente en la transcripción de la ARN polimerasa II. A diferencia de los activadores o represores transcripcionales que activan o reprimen selectivamente genes específicos, los amplificadores de la transcripción actúan globalmente sobre el conjunto de genes inicialmente expresados.
Se han caracterizado varios reguladores conocidos de la amplificación transcripcional, incluido el oncogén Myc ., [1] [2] la proteína del síndrome de Rett MECP2 , [3] y la proteína del bromodominio BET BRD4 . [4] En particular, la proteína Myc amplifica la transcripción al unirse a promotores y potenciadores de genes activos donde recluta directamente el factor de elongación de la transcripción P-TEFb . Además, la proteína BRD4 es un regulador de la actividad de Myc.
Los experimentos de expresión génica de uso común interrogan la expresión de uno ( qPCR ) o muchos genes ( microarray , RNA-Seq ). Estas técnicas generalmente miden los niveles relativos de ARNm y emplean métodos de normalización que asumen que solo una pequeña cantidad de genes muestran expresión alterada. [5] En su lugar, se requieren mediciones absolutas normalizadas de abundancia de ARNm de células individuales o recuento de células para revelar la amplificación transcripcional. [6] Además, las mediciones globales de mRNA o mRNA total por célula también pueden descubrir evidencia de amplificación transcripcional. [7] [8]
Las células en las que se ha amplificado la transcripción tienen características adicionales que sugieren que se ha producido la amplificación. Las células con niveles elevados de ARNm pueden ser más grandes, en consonancia con una mayor abundancia de productos génicos. Este aumento en la cantidad de producto génico puede resultar en una disminución del tiempo de duplicación.
