El ARN espliceosómico menor U12 se forma a partir del ARNn nuclear pequeño U12 ( snRNA ), junto con los snRNA U4atac / U6atac , U5 y U11 y las proteínas asociadas, forma un espliceosoma que escinde una clase divergente de intrones de pre- ARNm de baja abundancia . Aunque la secuencia de U12 es muy divergente de la de U2 , las dos son funcionalmente análogas. [1]
ARN espliceosomal menor U12 | |
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Identificadores | |
Símbolo | U12 |
Rfam | RF00007 |
Otros datos | |
Tipo de ARN | Gene ; snRNA ; empalme |
Dominio (s) | Eucariota |
IR | IR: 0000371 IR: 0045131 IR: 0005693 |
ENTONCES | Entonces: 0000399 |
Estructuras PDB | PDBe |
Estructura
Se publica la estructura secundaria predicha del ARN U12, [2] . Sin embargo, la horquilla alternativa única en el extremo 3 'que se muestra aquí parece coincidir mejor con la alineación de las secuencias divergentes de Drosophila melanogaster y Arabidopsis thaliana . [3] Las secuencias de intrones U12 que se empalman se recopilan en una base de datos biológica llamada base de datos de intrones U12 .
Referencias
- ^ Tarn WY, Steitz JA (abril de 1997). "Empalme de pre-ARNm: el descubrimiento de un nuevo espliceosoma duplica el desafío". Tendencias en Ciencias Bioquímicas . 22 (4): 132–7. doi : 10.1016 / S0968-0004 (97) 01018-9 . PMID 9149533 .
- ^ Shukla GC, Padgett RA (abril de 1999). "Conservación de características funcionales de snRNAs U6atac y U12 entre vertebrados y plantas superiores" . ARN . 5 (4): 525–38. doi : 10.1017 / S1355838299982213 . PMC 1369779 . PMID 10199569 .
- ^ Otake LR, Scamborova P, Hashimoto C, Steitz JA (febrero de 2002). "El espliceosoma divergente de tipo U12 es necesario para el empalme de pre-ARNm y es esencial para el desarrollo en Drosophila" . Célula molecular . 9 (2): 439–46. doi : 10.1016 / S1097-2765 (02) 00441-0 . PMID 11864616 .
enlaces externos
- Página para ARN espliceosomal menor U12 en Rfam