La proteína A asociada a VAMP (o proteína A asociada a proteína de membrana asociada a vesícula ) es una proteína que en humanos está codificada por el gen VAPA . [5] [6] [7] Junto con VAPB y VAPC, forma la familia de proteínas VAP . Son proteínas integrales de la membrana del retículo endoplásmico del tipo II y son ubicuas entre los eucariotas. [8]
VAPA | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | VAPA , VAP-33, VAP-A, VAP33, hVAP-33, proteína A asociada a VAMP, VAMP-A | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 605703 MGI : 1353561 HomoloGene : 37824 GeneCards : VAPA | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 18: 9,91 - 9,96 Mb | Crónicas 17: 65,58 - 65,61 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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VAPA se expresa de manera ubicua en tejidos humanos [5] y se cree que está involucrado en el tráfico de membranas por interacción con SNARE . [9] en la regulación del transporte y metabolismo de lípidos, [8] y en la respuesta de proteína desplegada ( UPR ). [8]
Estructura proteica
La proteína se divide en tres dominios diferentes. [5] Primero, una hoja beta N-terminal con un pliegue similar a una inmunoglobulina que comparte homología con la proteína del esperma principal del nematodo ( MSP ). En segundo lugar, un dominio de bobina en espiral central . Luego, finalmente, un dominio transmembrana C-terminal (TMD) que generalmente está presente en proteínas de la superfamilia t-SNARE y se ha encontrado en otras proteínas asociadas con el transporte vesicular. [10] VAPA puede formar homo-dímeros y también heterodímeros con VAPB por interacciones a través de su (TMD). [5]
Localización intracelular
Debido a su expresión ubicua, [5] la localización intracelular y la función de VAPA pueden variar entre los tipos de células. Sin embargo, se encuentra principalmente en el RE, [11] aparato de Golgi y el compartimento tubular vesicular o el compartimento intermedio RE-Golgi , [9] un orgánulo de células eucariotas que consta de vesículas fusionadas derivadas del RE que transporta proteínas desde el RE al aparato de Golgi. aparato. [12]
Interacciones
Se ha documentado que VAPA interactúa con tres grupos diferentes de proteínas: proteínas asociadas con el tráfico y fusión de vesículas, proteínas que contienen el motivo FFAT y proteínas virales. [8]
Tráfico de vesículas y fusión
VAPA es capaz de unirse una gama de proteínas SNARE incluyendo Sintaxina1A , rbet1 y rsec22. También se une a proteínas asociadas con la maquinaria de fusión de membranas como alphaSNAP y NSF . Estas interacciones sugieren que VAPA podría tener un papel general en la regulación de la función de estas proteínas que están involucradas principalmente en la fusión de membranas [9].
Proteínas virales
Se ha descubierto que las proteínas VAP son factores esenciales del huésped para varios virus. [13] [14] [15]
Las proteínas VAP se unen con proteínas no estructurales de los virus de la hepatitis C NS5A y NS5B, lo que permite que la maquinaria de replicación del ARN del virus se establezca en la membrana de la balsa lipídica de la célula huésped. [dieciséis]
VAPA también se une a varias proteínas virales de la familia de los norovirus y es importante para la eficacia de la replicación del virus. [13] [14] Las proteínas no estructurales NS1 y NS2 pueden unirse a VAPA gracias a la imitación de la secuencia del motivo FFAT, lo que probablemente produce la misma ventaja para la replicación viral que para el virus de la hepatitis C. [14]
Motivo FFAT
La parte homóloga de MSP N-terminal de VAPA es capaz de unirse al motivo FFAT , un motivo de secuencia particular compartido por varias proteínas de unión a lípidos, incluida la proteína de unión a oxisterol ( OSBP ). [17] [18]
Función
Una de sus funciones propuestas es ralentizar el flujo de lípidos hacia el RE cuando se produce un plegado incorrecto de proteínas, con el fin de reducir la cantidad de estrés desencadenado por la UPR. El VAP regularía este proceso inhibiendo el contacto con la membrana. [19]
Enfermedades asociadas
El SNP P56S en el dominio MSP de VAPB está involucrado en la aparición de la enfermedad de Lou Gehrig, también llamada esclerosis lateral amiotrófica ( ELA ), donde el paciente pierde el control y la función muscular. La degenerescencia de las neuronas motoras observada en tal condición podría deberse a la incapacidad de VAPB para regular la función lipídica alrededor del RE y las consecuencias posteriores sobre la función celular. [19]
Referencias
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- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024091 - Ensembl , mayo de 2017
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Otras lecturas
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