Región de control de locus


Una región de control de locus (LCR) es un elemento regulador cis de largo alcance que mejora la expresión de genes vinculados en sitios de cromatina distal . Funciona de manera dependiente del número de copias y es específico de tejido, como se observa en la expresión selectiva de genes de globina β en células eritroides . [1] Los niveles de expresión de los genes pueden ser modificados por el LCR y los elementos próximos al gen, como promotores , potenciadores y silenciadores . El LCR funciona reclutando complejos modificadores de cromatina , coactivadores y de transcripción .[2] Su secuencia se conserva en muchos vertebrados, y la conservación de sitios específicos puede sugerir una función importante. [2] Se ha comparado con un superpotenciador, ya que ambos realizan una regulación cis de largo alcance através del reclutamiento del complejo de transcripción. [3]

El LCR de β-globina se identificó hace más de 20 años en estudios de ratones transgénicos . Estos estudios determinaron que se requería el LCR para la regulación normal de la expresión génica de beta-globina. [4] La evidencia de la presencia de este elemento regulador adicional provino de un grupo de pacientes que carecían de una región de 20 kb aguas arriba del grupo de globina β que era vital para la expresión de cualquiera de los genes de globina β. Aunque todos los genes en sí mismos y los otros elementos reguladores estaban intactos, sin este dominio, ninguno de los genes en el grupo de globina β se expresó. [5]

Aunque el nombre implica que el LCR está limitado a una sola región, esta implicación solo se aplica al LCR de β-globina ( HBB-LCR ). Otros estudios han encontrado que un solo LCR puede distribuirse en múltiples áreas alrededor y dentro de los genes que controla. El LCR de β-globina en ratones y humanos se encuentra entre 6 y 22 kb aguas arriba del primer gen de globina ( épsilon ). Controla los siguientes genes: [1] [2]

Hay un LCR de opsina ( OPSIN-LCR ) que controla la expresión de OPN1LW y las primeras copias de OPN1MW en el cromosoma X humano, aguas arriba de estos genes. [6] Un LCR disfuncional puede causar la pérdida de expresión de ambas opsinas, lo que lleva a la monocromía del cono azul . [7] Este LCR también se conserva en peces teleósteos , incluido el pez cebra . [8]

A partir de 2002, hay 21 áreas LCR conocidas en humanos. [1] A partir de 2019, se registran 11 LCR humanos en la base de datos del NCBI. [9]

Aunque se han realizado estudios para intentar identificar un modelo de cómo funciona el LCR, la evidencia de los siguientes modelos no está fuertemente respaldada ni descartada. [1]