Las proteínas de caja F son proteínas que contienen al menos un dominio de caja F. La primera proteína de caja F identificada es uno de los tres componentes del complejo SCF , que media en la ubiquitinación de proteínas dirigidas a la degradación por el proteasoma 26S .
Dominio del enlazador F-box | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
Símbolo | Caja F | |||||||
Pfam | PF00646 | |||||||
Clan pfam | CL0271 | |||||||
InterPro | IPR001810 | |||||||
INTELIGENTE | SM00256 | |||||||
PROSITE | PS50181 | |||||||
SCOP2 | 1fs2 / SCOPe / SUPFAM | |||||||
Membranome | 630 | |||||||
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Componentes principales
El dominio de caja F es un motivo estructural de proteína de aproximadamente 50 aminoácidos que media las interacciones proteína-proteína . Tiene secuencia de consenso y varía en pocas posiciones. Se identificó por primera vez en la ciclina F . [2] El motivo F-box de Skp2, que consta de tres hélices alfa, interactúa directamente con la proteína SCF Skp1 . [3] Los dominios de caja F comúnmente existen en proteínas junto con otros motivos de interacción proteína-proteína, como las repeticiones ricas en leucina (ilustradas en la Figura) y las repeticiones WD , que se cree que median las interacciones con los sustratos de SCF. [4]
Función
Las proteínas F-box también se han asociado con funciones celulares como la transducción de señales y la regulación del ciclo celular . [5] En las plantas, muchas proteínas F-box están representadas en redes de genes ampliamente reguladas por el silenciamiento de genes mediado por microARN a través de la interferencia de ARN . [6] Las proteínas F-box están involucradas en el crecimiento y desarrollo vegetativo y reproductivo de muchas plantas. Por ejemplo, la proteína F-box-FOA1 participa en la señalización del ácido abscísico (ABA) para afectar la germinación de la semilla. [7] ACRE189 / ACIF1 puede regular la muerte celular y la defensa cuando el patógeno es reconocido en la planta de tabaco y tomate. [8]
En las células humanas, en condiciones de alto contenido de hierro, dos átomos de hierro estabilizan la F-Box FBXL5 y luego el complejo media la ubiquitinación de IRP2 . [9]
Regulación
Los niveles de proteína de la caja F pueden regularse mediante diferentes mecanismos. La regulación puede ocurrir a través del proceso de degradación de proteínas y asociación con el complejo SCF. Por ejemplo, en la levadura, la proteína Met30 de la caja F puede ubiquitinizarse de una manera dependiente de culina. [10] [11]
Referencias
- ^ Schulman BA, Carrano AC, Jeffrey PD, et al. (Noviembre de 2000). "Información sobre las ligasas de ubiquitina SCF de la estructura del complejo Skp1-Skp2". Naturaleza . 408 (6810): 381–6. Código Bibliográfico : 2000Natur.408..381S . doi : 10.1038 / 35042620 . PMID 11099048 . S2CID 4300503 .
- ^ Bai C, Sen P, Hofmann K, Ma L, Goebl M, Harper JW, Elledge SJ. "SKP1 conecta reguladores del ciclo celular a la maquinaria de proteólisis de ubiquitina a través de un motivo novedoso, la caja F". Celda 86 263-74 1996 .
- ^ Bai C, Sen P, Hofmann K, Ma L, Goebl M, Harper JW, Elledge SJ (julio de 1996). "SKP1 conecta reguladores del ciclo celular a la maquinaria de proteólisis de ubiquitina a través de un motivo novedoso, la caja F". Celular . 86 (2): 263–74. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80098-7 . PMID 8706131 .
- ^ Kipreos ET, Pagano M (2000). "La familia de proteínas F-box" . Genome Biol . 1 (5): OPINIONES3002. doi : 10.1186 / gb-2000-1-5-reviews3002 . PMC 138887 . PMID 11178263 .
- ^ Craig KL, Tyers M (1999). "La caja F: un nuevo motivo para la proteólisis dependiente de ubiquitina en la regulación del ciclo celular y la transducción de señales" . Prog. Biophys. Mol. Biol . 72 (3): 299–328. doi : 10.1016 / S0079-6107 (99) 00010-3 . PMID 10581972 .
- ^ Jones-Rhoades MW, Bartel DP, Bartel B (2006). "MicroRNAS y sus roles regulatorios en plantas". Annu Rev Plant Biol . 57 : 19–53. doi : 10.1146 / annurev.arplant.57.032905.105218 . PMID 16669754 .
- ^ Peng, Juan; Yu, Dashi; Wang, Liqun; Xie, Minmin; Yuan, Congying; Wang, Yu; Tang, Dongying; Zhao, Xiaoying; Liu, Xuanming (junio de 2012). "Gen FOA1 de Arabidopsis F-box implicado en la señalización de ABA". Science China. Ciencias de la vida . 55 (6): 497–506. doi : 10.1007 / s11427-012-4332-9 . ISSN 1869-1889. PMID 22744179.
- ^ Ja, Van Den Burg; Tsitsigiannis, DI; Rowland, O; Lo, J; Rallapalli, G; Maclean, D; Takken, FL; Jones, JD (2008). "La proteína F-box ACRE189 / ACIF1 regula la muerte celular y las respuestas de defensa activadas durante el reconocimiento de patógenos en tabaco y tomate". Célula vegetal . 20 (3): 697.
- ^ Moroishi, T; Nishiyama, M; Takeda, Y; Iwai, K; Nakayama, KI (2011). "El eje FBXL5-IRP2 es integral para el control del metabolismo del hierro in vivo". Metabolismo celular . 14 (3): 339.
- ^ Kaiser, Peter; Su, Ning-Yuan; Yen, James L .; Ouni, Ikram; Flick, Karin (8 de agosto de 2006). "La ligasa de ubiquitina de levadura SCFMet30: conectando las condiciones ambientales e intracelulares a la división celular". División celular . 1 : 16. doi : 10.1186 / 1747-1028-1-16 . ISSN 1747-1028 .
Otras lecturas
- Ho M, Tsai P, Chien C (2006). "Proteínas F-box: la clave para la degradación de proteínas" . J Biomed Sci . 13 (2): 181–91. doi : 10.1007 / s11373-005-9058-2 . PMID 16463014 .
enlaces externos
- F-Box + Proteins en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- F-box + motivos en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .