El sitio de entrada del ribosoma interno del virus de la hepatitis C , o IRES del VHC , es una estructura de ARN dentro de la 5'UTR del genoma del VHC que media el inicio de la traducción independiente del casquete.
Sitio de entrada del ribosoma interno del virus de la hepatitis C | |
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Identificadores | |
Símbolo | IRES_HCV |
Alt. Simbolos | HCV_IRES |
Rfam | RF00061 |
Otros datos | |
Tipo de ARN | Cis-reg ; IRES |
Dominio (s) | Virus |
IR | IR: 0043022 |
ENTONCES | Entonces: 0000243 |
Estructuras PDB | PDBe |
La traducción de proteínas de la mayoría de los ARNm eucariotas se produce por un mecanismo dependiente de la tapa y requiere la asociación de Met- tRNA i Met , varios factores de iniciación eucariotas y GTP con la subunidad ribosómica 40S , reclutamiento en la tapa 5 ' y exploración a lo largo de la UTR 5' para llegar al codón de inicio. Por el contrario, la traducción del ARNm del virus de la hepatitis C (VHC) se inicia mediante un mecanismo diferente del modelo habitual de unión del casquete 5 '. [1] Este mecanismo alternativo se basa en la unión directa de la subunidad ribosómica 40S por el sitio de entrada interno del ribosoma.(IRES) en el 5 'UTR del ARN del VHC. El IRES del VHC adopta una estructura compleja y puede diferir significativamente de los elementos del IRES identificados en los picornavirus . Se ha demostrado que una pequeña cantidad de ARNm eucariotas se traduce por la entrada interna del ribosoma. [2] [3]
Estructura IRES
Se cree que los nucleótidos 1 a 40 del ARNm del VHC no contribuyen a la traducción y son necesarios para la replicación del ARN genómico . El resto del VHC 5'-UTR consta de tres dominios, a saber, los dominios II-IV (el dominio I se encuentra en el extremo 5 'del ARNm).
Mecanismo de acción
HCV IRES se une de forma independiente a dos componentes de la maquinaria de iniciación de la traducción eucariota, el factor de iniciación multiproteína eIF3 y la subunidad ribosómica pequeña 40S . Además, se une a 40S de tal manera que el codón iniciador AUG se coloca en el sitio P ribosómico, por lo que no se requiere exploración ribosómica. En consecuencia, los factores de escaneo eIF1 y eIF1A son prescindibles para la traducción del VHC, al igual que los componentes del complejo eIF4F ( eIF4A , eIF4E y eIF4G ) y eIF4B , que generalmente son necesarios para la unión y desenrollamiento del ARNm de 5'UTR . El ARNt iniciador es administrado por eIF2 o, en condiciones de estrés cuando eIF2 está inactivado, por eIF2A , eIF2D o posiblemente eIF5B , un homólogo de la proteína procariota IF2 .
Ver también
- Traducción eucariota
- Factor de iniciación eucariota
Referencias
- ^ Lytle JR, Wu L, Robertson HD (agosto de 2002). "Dominios en el sitio de entrada del ribosoma interno del virus de la hepatitis C para la unión de la subunidad 40s" . ARN . 8 (8): 1045-1055. doi : 10.1017 / S1355838202029965 . PMC 1370315 . PMID 12212848 .
- ^ Beales LP, Rowlands DJ, Holzenburg A (mayo de 2001). "El sitio de entrada del ribosoma interno (IRES) del virus de la hepatitis C visualizado por microscopía electrónica" . ARN . 7 (5): 661–670. doi : 10.1017 / S1355838201001406 . PMC 1370118 . PMID 11350030 .
- ^ Gallego J, Varani G (abril de 2002). "El sitio de entrada del ribosoma interno del virus de la hepatitis C: un nuevo objetivo para la investigación antiviral". Transacciones de la sociedad bioquímica . 30 (2): 140-145. doi : 10.1042 / BST0300140 . PMID 12023841 .
Otras lecturas
- Malygin AA, Kossinova OA, Shatsky IN, Karpova GG (octubre de 2013). "HCV IRES interactúa con el ARNr 18S para activar el ribosoma 40S para los pasos posteriores de inicio de la traducción" . Investigación de ácidos nucleicos . 41 (18): 8706–8714. doi : 10.1093 / nar / gkt632 . PMC 3794592 . PMID 23873958 .
enlaces externos
- Página para el sitio de entrada del ribosoma interno del virus de la hepatitis C en Rfam