El coronavirus humano HKU1 ( HCoV-HKU1 ) es una especie de coronavirus en humanos. Provoca una enfermedad de las vías respiratorias superiores con síntomas del resfriado común , pero puede avanzar a neumonía y bronquiolitis . [1] Fue descubierto por primera vez en enero de 2004 por un hombre en Hong Kong . [2] Investigaciones posteriores revelaron que tiene una distribución global y una génesis anterior.
Coronavirus humano HKU1 | |
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Formación de HcoV-HKU1. | |
Clasificación de virus | |
(no clasificado): | Virus |
Reino : | Riboviria |
Reino: | Orthornavirae |
Filo: | Pisuviricota |
Clase: | Pisoniviricetes |
Pedido: | Nidovirales |
Familia: | Coronaviridae |
Género: | Betacoronavirus |
Subgénero: | Embecovirus |
Especies: | Coronavirus humano HKU1 |
El virus es un envuelto , de sentido positivo , de una sola hebra virus RNA que entra en su célula huésped mediante la unión a la N-acetil-9-O-acetilneuramínico receptor de ácido . [3] Tiene el gen de la hemaglutinina esterasa (HE), que lo distingue como miembro del género Betacoronavirus y del subgénero Embecovirus . [4]
Historia
El VHC-HKU1 se detectó por primera vez en enero de 2004, en un hombre de 71 años que fue hospitalizado por síndrome de dificultad respiratoria aguda y neumonía bilateral confirmada radiográficamente. El hombre había regresado recientemente a Hong Kong desde Shenzhen, China . [2] [5]
Virología
Woo y sus compañeros de trabajo no tuvieron éxito en sus intentos de cultivar un aislado de HCoV-HKU1, pero pudieron obtener la secuencia genómica completa. El análisis filogenético mostró que HKU1 está más estrechamente relacionado con el virus de la hepatitis del ratón (MHV) y, en ese sentido, es distinto de otros betacoronavirus humanos conocidos , como el HCoV-OC43 . [2]
Cuando se analizaron los genes de la ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp), pico (S) y nucleocápside (N), se descubrieron relaciones filogenéticas incompatibles. La secuenciación completa del genoma de 22 cepas de HCoV-HKU1 confirmó que esto se debía a la recombinación natural. [2] El HCoV-HKU1 probablemente se originó en roedores . [6]
HCoV-HKU1 es uno de los siete coronavirus conocidos que infectan a los seres humanos. Los otros seis son: [7]
- Coronavirus humano 229E (HCoV-229E)
- Coronavirus humano NL63 (HCoV-NL63)
- Coronavirus humano OC43 (HCoV-OC43)
- Coronavirus relacionado con el síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV)
- Coronavirus causante del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-1)
- Síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
Cryo-EM resolvió las estructuras de las proteínas HCoV-HKU1 spike (S) y HE en 2016 y 2020, respectivamente. La proteína S ( PDB : 5I08 ) se ha destacado por su gran tamaño. [8] La proteína HE ( PDB : 6Y3Y ) se diferencia de las convencionales (como la de OC43) por tener un dominio de lectina vestigial mucho más pequeño. Este dominio está protegido del reconocimiento por parte del sistema inmunológico a través de cambios de tamaño y glicosilación. [9]
Epidemiología
Un análisis de rastreo de aspirados nasofaríngeos negativos para el SARS de pacientes con enfermedades respiratorias durante el período del SARS en 2003, identificó la presencia de ARN CoV-HKU1 en la muestra de una mujer de 35 años con neumonía. [5]
Tras los informes iniciales del descubrimiento de HCoV-HKU1, el virus se identificó ese mismo año en 10 pacientes en el norte de Australia . Se recolectaron muestras respiratorias entre mayo y agosto (invierno en Australia). Los investigadores encontraron que la mayoría de las muestras positivas para HCoV-HKU1 procedían de niños en los últimos meses de invierno. [10]
Los primeros casos conocidos en el hemisferio occidental se descubrieron en 2005 después de analizar muestras más antiguas por virólogos clínicos del Hospital Yale-New Haven en New Haven, Connecticut, quienes tenían curiosidad por saber si el HCoV-HKU1 estaba en su área. Llevaron a cabo un estudio de muestras recolectadas en un período de 7 semanas (diciembre de 2001 a febrero de 2002) en 851 bebés y niños. Las muestras de nueve niños tenían el coronavirus humano HKU1. Estos niños tenían infecciones del tracto respiratorio en el momento se recogieron las muestras (en una chica tan grave que era necesaria la ventilación mecánica), mientras que las pruebas negativas para otras causas como el virus sincitial respiratorio humano (RSV), virus parainfluenza (tipos 1-3) , virus de la influenza A y B y adenovirus por ensayo de inmunofluorescencia directa, así como metaneumovirus humano y HCoV-NH por reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR). Los investigadores informaron que las cepas identificadas en New Haven eran similares a la cepa encontrada en Hong Kong y sugirieron una distribución mundial. [11] Estas cepas encontradas en New Haven no deben confundirse con HCoV-NH (coronavirus de New Haven), que es una cepa del coronavirus humano NL63 .
En julio de 2005, se notificaron seis casos en Francia. En estos casos, los investigadores franceses utilizaron técnicas mejoradas para recuperar el virus de aspirados nasofaríngeos y de muestras de heces. [12]
Ver también
- Tylonycteris murciélago coronavirus HKU4
- Coronavirus del murciélago rousettus HKU9
Referencias
- ^ Lim, Yvonne Xinyi; Ng, Yan Ling; Tam, James P .; Liu, Ding Xiang (25 de julio de 2016). "Coronavirus humanos: una revisión de las interacciones virus-anfitrión" . Enfermedades . 4 (3): 26. doi : 10.3390 / disease4030026 . ISSN 2079-9721 . PMC 5456285 . PMID 28933406 .
Ver tabla 1.
- ^ a b c d Woo, PCY; Lau, SKP; Chu, C.-m .; Chan, K.-h .; Tsoi, H.-w .; Huang, Y .; Wong, BHL; Poon, RWS; Cai, JJ; Luk, W.-k .; Poon, LLM; Wong, SSY; Guan, Y .; Peiris, JSM; Yuen, K.-y. (2004). "Caracterización y secuencia completa del genoma de un nuevo coronavirus, Coronavirus HKU1, de pacientes con neumonía" . Revista de Virología . 79 (2): 884–95. doi : 10.1128 / JVI.79.2.884-895.2005 . PMC 538593 . PMID 15613317 .
- ^ Lim, Yvonne Xinyi; Ng, Yan Ling; Tam, James P .; Liu, Ding Xiang (25 de julio de 2016). "Coronavirus humanos: una revisión de las interacciones virus-anfitrión" . Enfermedades . 4 (3): 26. doi : 10.3390 / disease4030026 . ISSN 2079-9721 . PMC 5456285 . PMID 28933406 .
Ver tabla 1.
- ^ Woo, Patrick CY; Huang, Yi; Lau, Susanna KP; Yuen, Kwok-Yung (24 de agosto de 2010). "Análisis de Genómica y Bioinformática de Coronavirus" . Virus . 2 (8): 1804–1820. doi : 10.3390 / v2081803 . ISSN 1999-4915 . PMC 3185738 . PMID 21994708 .
En todos los miembros del subgrupo A de Betacoronavirus, un gen de hemaglutinina esterasa (HE), que codifica una glicoproteína con actividad neuraminada O-acetil-esterasa y el sitio activo FGDS, está presente aguas abajo de ORF1ab y aguas arriba del gen S (Figura 1).
- ^ a b Lau, SKP; Woo, PCY; Yip, CCY; Tse, H .; Tsoi, H.-w .; Cheng, VCC; Lee, P .; Tang, BSF; Cheung, CHY; Lee, RA; Entonces, L.-y .; Lau, Y.-l .; Chan, K.-h .; Yuen, K.-y. (2006). "Coronavirus HKU1 y otras infecciones por coronavirus en Hong Kong" . Revista de microbiología clínica . 44 (6): 2063–71. doi : 10.1128 / JCM.02614-05 . PMC 1489438 . PMID 16757599 .
- ^ Fung, para cantar; Liu, Ding Xiang (2019). "Coronavirus humano: interacción huésped-patógeno" . Revisión anual de microbiología . 73 : 529–557. doi : 10.1146 / annurev-micro-020518-115759 . PMID 31226023 .
- ^ Kirchdoerfer, Robert N .; Cottrell, Christopher A .; Wang, Nianshuang; Pallesen, Jesper; Yassine, Hadi M .; Turner, Hannah L .; Corbett, Kizzmekia S .; Graham, Barney S .; McLellan, Jason S .; Ward, Andrew B. (marzo de 2016). "Estructura previa a la fusión de una proteína de pico de coronavirus humano" . Naturaleza . 531 (7592): 118-121. doi : 10.1038 / nature17200 .
- ^ Hurdiss DL, Drulyte I, Lang Y, Shamorkina TM, Pronker MF, van Kuppeveld FJ, Snijder J, de Groot RJ (16 de noviembre de 2020). "La estructura de Cryo-EM de esterasa de hemaglutinina coronavirus-HKU1 revela cambios arquitectónicos que surgen de la circulación prolongada en humanos" . Comunicaciones de la naturaleza . doi : 10.1038 / s41467-020-18440-6 .
- ^ Sloots, T; McErlean, P; Speicher, D; Arden, K; Nissen, M; MacKay, yo (2006). "Evidencia de coronavirus humano HKU1 y bocavirus humano en niños australianos" . Revista de Virología Clínica . 35 (1): 99–102. doi : 10.1016 / j.jcv.2005.09.008 . PMID 16257260 .
- ^ Esper, Frank; Weibel, Carla; Ferguson, David; Landry, Marie L .; Kahn, Jeffrey S. (2006). "Infección por coronavirus HKU1 en los Estados Unidos" . Enfermedades infecciosas emergentes . 12 (5): 775–9. doi : 10.3201 / eid1205.051316 . PMC 3374449 . PMID 16704837 .
- ^ Vabret, A .; Dina, J .; Gouarin, S .; Petitjean, J .; Corbet, S .; Freymuth, F. (2006). "Detección del nuevo coronavirus humano HKU1: un informe de 6 casos" . Enfermedades Clínicas Infecciosas . 42 (5): 634–9. doi : 10.1086 / 500136 . PMID 16447108 .
enlaces externos
- Datos relacionados con el coronavirus humano HKU1 en Wikispecies