Phytobacter es un género de bacterias Gram-negativas bacterias que salen de la agrupación de los aislados previamente asignadas a varios géneros de la familia Enterobacteriaceae . Este género se estableció por primera vez sobre la base de aislamientos fijadores de nitrógeno de arroz silvestre en China, [1] pero también incluye una serie de aislamientos obtenidos durante un brote de sepsis en varios estados de 2013 en Brasil [2] [3] y, retrospectivamente, varios cepas clínicas aisladas en la década de 1970 en los Estados Unidos que todavía están disponibles en colecciones de cultivos, que originalmente se agruparon en el biotipo XII de Brenner. [4] [5] Los paneles de evaluación bioquímica estándar carecen de Phytobacterspp. de su base de datos, lo que a menudo conduce a identificaciones erróneas con otras especies de Enterobacterales , especialmente Pantoea agglomerans . [2] Los aislamientos clínicos de la especie han sido identificados como una fuente importante de genes de resistencia a la β-lactamasa y carbapenem de espectro extendido , que generalmente están mediados por elementos móviles genéticos. También se ha informado de una fuerte protección de las bacterias sensibles que infectan conjuntamente. [6] Las bacterias que pertenecen a este género no están pigmentadas, no son quimioorganotróficas y son capaces de fijar nitrógeno. Son fermentadores de lactosa , citocromo oxidasa negativos y catalasa positivos. La glucosa se fermenta con la producción de gas. Las colonias que crecen en agar MacConkey (MAC) son circulares, convexas y lisas con márgenes no completos y un centro generalmente elevado. Actualmente, tres especies están válidamente incluidas en el género Phytobacter, [2] [7] que todavía está incluido dentro del clado Kosakonia en la familia de Enterobacteriaceae recientemente revisada. [8] Recientemente se ha propuesto la incorporación de una cuarta especie, Phytobacter massiliensis , mediante la unificación de los géneros Metakosakonia y Phytobacter . [9]
Phytobacter | |
---|---|
clasificación cientifica | |
Reino: | |
Filo: | |
Clase: | |
Pedido: | |
Familia: | |
Género: | Phytobacter Zhang y col. 2008 |
Especie tipo | |
Phytobacter diazotrophicus | |
Especies | |
P. diazotrophicus |
Especies
- Phytobacter diazotrophicus es laespecie de Phytobacter más comúnrecuperada del medio ambiente y los seres humanos y es un patógeno oportunista asociado con catéteres contaminadoso el uso de nutrición parenteral total . [2] [4]
- Phytobacter ursingii se puede diferenciar bioquímicamente de Phytobacter diazotrophicus sobre la base de su capacidad para metabolizar la d-serina y la l-sorbosa . A pesar de que la presencia degenes de fijación de nitrógeno sugiere un origen ambiental, hasta ahora solo se han reportado aislamientos clínicos de la especie. [2]
- Phytobacter palmae es una especie con alta capacidad de fijación de nitrógeno que se identificó por primera vez en Singapur en los tejidos de las hojas de la palma de aceite ( Elaeis guineensis ). [7]
- Phytobacter massiliensis , cuyo tipo de cepa JC163 T se aisló de la flora fecal de un paciente senegalés sano. [9] [10]
Referencias
- ^ Zhang, Guo Xia; Peng, Gui Xiang; Wang, En Tao; Yan, Hui; Yuan, Qing Hua; Zhang, Wu; Lou, Xu; Wu, Hui; Tan, Zhi Yuan (mayo de 2008). "Diversas bacterias fijadoras de nitrógeno endofíticas aisladas de arroz salvaje Oryza rufipogon y descripción de Phytobacter diazotrophicus gen. Nov. Sp. Nov". Archivos de Microbiología . 189 (5): 431–439. doi : 10.1007 / s00203-007-0333-7 . PMID 18060384 . S2CID 27236264 .
- ^ a b c d e Pillonetto, Marcelo; Arend, Lavinia N .; Faoro, Helisson; D'Espindula, Helena RS; Blom, Jochen; Smits, Theo HM; Mira, Marcelo T .; Rezzonico, Fabio (10 de noviembre de 2017). "Descripción modificada del género Phytobacter, su especie tipo Phytobacter diazotrophicus (Zhang 2008) y descripción de Phytobacter ursingii sp. Nov" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . [Publicación electrónica antes de la impresión] (1): 176–184. doi : 10.1099 / ijsem.0.002477 . PMID 29125457 .
- ^ Pillonetto, Marcelo; Arend, Lavinia; Gomes, Suzie MT; Oliveira, Marluce AA; Timm, Loeci N .; Martins, Andreza F .; Barth, Afonso L .; Mazzetti, Alana; Hersemann, Lena; Smits, Theo HM; Mira, Marcelo T. (13 de agosto de 2018). "Investigación molecular de aislamientos de un brote polimicrobiano multiestatal asociado con nutrición parenteral total contaminada en Brasil" . Enfermedades Infecciosas de BMC . 18 (1): 397. doi : 10.1186 / s12879-018-3287-2 . ISSN 1471-2334 . PMC 6090600 . PMID 30103698 .
- ^ a b Rezzonico, Fabio; Smits, Theo HM; Montesinos, Emilio; Frey, Jürg E .; Duffy, Brion (1 de enero de 2009). "Comparación genotípica de cepas clínicas y de plantas de Pantoea agglomerans" . Microbiología BMC . 9 : 204. doi : 10.1186 / 1471-2180-9-204 . ISSN 1471-2180 . PMC 2764716 . PMID 19772624 .
- ^ Brenner, Don J .; Fanning, G. Richard; Leete Knutson, Jean K .; Steigerwalt, Arnold G .; Krichevsky, Micah I. (1984). "Intentos de clasificar cepas de Herbicola Group-Enterobacter agglomerans por hibridación de ácido desoxirribonucleico y pruebas fenotípicas" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 34 (1): 45–55. doi : 10.1099 / 00207713-34-1-45 . ISSN 1466-5026 .
- ^ Zhang, Zhao; Li, Daixi; Shi, Xing; Zhai, Yao; Guo, Yatao; Zheng, Yali; Zhao, Lili; Él, Yukun; Chen, Yusheng; Wang, Zhanwei; Su, Jianrong (15 de abril de 2020). "Caracterización genómica de una especie emergente de Enterobacteriaceae: el primer caso de coinfección con un patógeno típico en un paciente humano" . BMC Genomics . 21 (1): 297. doi : 10.1186 / s12864-020-6720-z . ISSN 1471-2164 . PMC 7156906 . PMID 32293254 .
- ^ a b Madhaiyan, Munusamy; Saravanan, Venkatakrishnan Sivaraj; Blom, Jochen; Smits, Theo HM; Rezzonico, Fabio; Kim, Soo-Jin; Weon, Hang-Yeon; Kwon, Soon-Wo; Whitman, William B .; Ji, Lianghui (1 de febrero de 2020). "Phytobacter palmae sp. Nov., Un novedoso endofítico, fijación de N2, promotor del crecimiento vegetal Gammaproteobacterium aislado de palma aceitera (Elaeis guineensis Jacq.)" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 70 (2): 841–848. doi : 10.1099 / ijsem.0.003834 . ISSN 1466-5026 . PMID 31829916 .
- ^ Alnajar, Seema; Gupta, Radhey S. (1 de octubre de 2017). "Los estudios filogenómicos y genómicos comparativos delinean seis clados principales dentro de la familia Enterobacteriaceae y apoyan la reclasificación de varios miembros polifiléticos de la familia". Infección, Genética y Evolución . 54 : 108-127. doi : 10.1016 / j.meegid.2017.06.024 . ISSN 1567-1348 . PMID 28658607 .
- ^ a b Ma, Yuanyuan; Yao, Rong; Li, Yuanyuan; Wu, Xiuqin; Li, Shuying; An, Qianli (30 de abril de 2020). "Propuesta de unificación del género Metakosakonia y el género Phytobacter a un solo género Phytobacter y reclasificación de Metakosakonia massiliensis como Phytobacter massiliensis comb. Nov". Microbiología actual . doi : 10.1007 / s00284-020-02004-4 . ISSN 1432-0991 . PMID 32350604 . S2CID 216650629 .
- ^ Lagier, Jean-Christophe; El Karkouri, Khalid; Mishra, Ajay Kumar; Robert, Catherine; Raoult, Didier; Fournier, Pierre-Edouard (22 de febrero de 2013). "Secuencia del genoma terminado no contiguo y descripción de Enterobacter massiliensis sp. Nov" . Estándares en Ciencias Genómicas . 7 (3): 399–412. doi : 10.4056 / sigs.3396830 . ISSN 1944-3277 . PMC 3764934 . PMID 24019988 .