Polimerasa
Una polimerasa es una enzima ( EC 2.7.7.6/7/19/48/49) que sintetiza largas cadenas de polímeros o ácidos nucleicos . La ADN polimerasa y la ARN polimerasa se utilizan para ensamblar moléculas de ADN y ARN , respectivamente, copiando una hebra de plantilla de ADN usando interacciones de emparejamiento de bases o ARN mediante replicación de media escalera.
Un ADN polimerasa a partir de la termófila bacteria , Thermus aquaticus ( Taq ) ( PDB 1BGX , EC 2.7.7.7) se utiliza en la reacción en cadena de la polimerasa , una técnica importante de la biología molecular .
Una polimerasa puede depender de la plantilla o ser independiente de la plantilla. La poli-A-polimerasa es un ejemplo de polimerasa independiente de la plantilla. También se sabe que la desoxinucleotidil transferasa terminal tiene actividades independientes del molde y dependientes del molde.
Las polimerasas generalmente se dividen en dos superfamilias, el pliegue de la "mano derecha" ( InterPro : IPR043502 ) y el pliegue de " barril beta doble psi " (a menudo simplemente "doble barril"). El primero se observa en casi todas las ADN polimerasas y casi todas las polimerasas virales de subunidad única; están marcados por un dominio de "palma" conservado. [2] Este último se observa en todas las ARN polimerasas de múltiples subunidades, en cRdRP y en las ADN polimerasas de la "familia D" que se encuentran en las arqueas. [3] [4] La familia "X" representada por la ADN polimerasa beta tiene solo una forma vaga de "palma" y, a veces, se considera una superfamilia diferente ( InterPro : IPR043519 ). [5]
Las primas generalmente no entran en ninguna categoría. Las primasas bacterianas suelen tener el dominio Toprim y están relacionadas con las topoisomerasas y el centelleo helicasa mitocondrial . [6] Archae y eucariotas primasas forman una familia AEP no relacionada, posiblemente relacionada con la palma polimerasa. Sin embargo, ambas familias se asocian al mismo conjunto de helicasas. [7]
