microsatélite


Un microsatélite es un tramo de ADN repetitivo en el que ciertos motivos de ADN (que varían en longitud de uno a seis o más pares de bases ) se repiten, normalmente de 5 a 50 veces. [1] [2] Los microsatélites se encuentran en miles de lugares dentro del genoma de un organismo . Tienen una tasa de mutación más alta que otras áreas del ADN [3], lo que lleva a una gran diversidad genética . Los genetistas forenses y en genealogía genética a menudo se refieren a los microsatélites como repeticiones cortas en tándem ( STR ) , o comorepeticiones de secuencia simple ( SSR ) por genetistas de plantas. [4]

Los microsatélites y sus primos más largos, los minisatélites , juntos se clasifican como ADN VNTR (número variable de repeticiones en tándem ). El nombre de ADN "satélite" se refiere a la observación temprana de que la centrifugación del ADN genómico en un tubo de ensayo separa una capa prominente de ADN a granel de las capas "satélite" de ADN repetitivo que la acompañan. [5]

Son ampliamente utilizados para perfiles de ADN en diagnóstico de cáncer , en análisis de parentesco (especialmente pruebas de paternidad ) y en identificación forense. También se utilizan en el análisis de ligamiento genético para localizar un gen o una mutación responsable de un rasgo o enfermedad determinada. Los microsatélites también se utilizan en genética de poblaciones para medir los niveles de parentesco entre subespecies, grupos e individuos.

Aunque el primer microsatélite fue caracterizado en 1984 en la Universidad de Leicester por Weller, Jeffreys y sus colegas como una repetición polimórfica GGAT en el gen de la mioglobina humana, el término "microsatélite" fue introducido más tarde, en 1989, por Litt y Luty. [1] El nombre ADN "satélite" se refiere a la observación temprana de que la centrifugación del ADN genómico en un tubo de ensayo separa una capa prominente de ADN a granel de las capas "satélite" de ADN repetitivo que la acompañan. [5]La creciente disponibilidad de amplificación de ADN por PCR a principios de la década de 1990 desencadenó una gran cantidad de estudios que utilizan la amplificación de microsatélites como marcadores genéticos para medicina forense, pruebas de paternidad y clonación posicional para encontrar el gen subyacente a un rasgo o enfermedad. Las primeras aplicaciones destacadas incluyen la identificación mediante genotipado de microsatélites de los restos óseos de una víctima de asesinato británica de ocho años de edad (Hagelberg et al. 1991) y del médico del campo de concentración de Auschwitz, Josef Mengele , que escapó a América del Sur después de la Segunda Guerra Mundial ( Hagelberg et al. 1991). Jeffreys et al. 1992). [1]

Un microsatélite es un tramo de motivos de ADN repetidos en tándem (es decir, adyacentes) que varían en longitud de uno a seis o hasta diez nucleótidos (la definición exacta y la delimitación de los minisatélites más largos varía de un autor a otro), [1] [2] y por lo general se repiten de 5 a 50 veces. Por ejemplo, la secuencia TATATATATA es un microsatélite de dinucleótido, y GTCGTCGTCGTCGTC es un microsatélite de trinucleótido (donde A es adenina , G guanina , C citosina y T timina) .). Las unidades repetidas de cuatro y cinco nucleótidos se denominan motivos de tetranucleótidos y pentanucleótidos, respectivamente. La mayoría de los eucariotas tienen microsatélites, con la notable excepción de algunas especies de levaduras. Los microsatélites se distribuyen por todo el genoma. [6] [1] [7] El genoma humano, por ejemplo, contiene entre 50 000 y 100 000 microsatélites de dinucleótidos y un número menor de microsatélites de tri, tetra y pentanucleótidos. [8] Muchos están ubicados en partes no codificantes del genoma humano y, por lo tanto, no producen proteínas, pero también pueden ubicarse en regiones reguladoras y codificantes .

Los microsatélites en regiones no codificantes pueden no tener ninguna función específica y, por lo tanto, es posible que no se seleccionen ; esto les permite acumular mutaciones sin obstáculos a lo largo de las generaciones y da lugar a una variabilidad que puede utilizarse con fines de identificación y huellas dactilares del ADN. Otros microsatélites están ubicados en regiones reguladoras flanqueantes o intrónicas de genes, o directamente en codones de genes; las mutaciones de microsatélites en tales casos pueden conducir a cambios fenotípicos y enfermedades, especialmente en enfermedades de expansión de tripletes como el síndrome de X frágil y la enfermedad de Huntington . [9]


Deslizamiento de la cadena de ADN durante la replicación de un locus STR. Las cajas simbolizan unidades repetitivas de ADN. Las flechas indican la dirección en la que se replica una nueva cadena de ADN (recuadros blancos) a partir de la cadena molde (recuadros negros). Se representan tres situaciones durante la replicación del ADN. (a) La replicación del locus STR ha procedido sin mutación. (b) La replicación del locus STR ha llevado a una ganancia de una unidad debido a un bucle en la nueva hebra; el bucle aberrante está estabilizado por unidades flanqueantes complementarias a la hebra opuesta. (c) La replicación del locus STR ha provocado la pérdida de una unidad debido a un bucle en la hebra molde. (Forster et al. 2015)
Un perfil STR humano parcial obtenido con el kit Applied Biosystems Identifiler
Árbol de unión de vecinos por consenso de 249 poblaciones humanas y seis poblaciones de chimpancés. Creado en base a 246 marcadores de microsatélites. [51]
Varias muestras de ADN de especímenes de Littorina plena amplificadas mediante la reacción en cadena de la polimerasa con cebadores dirigidos a un locus de repetición de secuencia simple variable (SSR, también conocido como microsatélite). Las muestras se corrieron en un gel de poliacrilamida al 5 % y se visualizaron mediante tinción con plata.