El cistovirus es un género de virus de ARN bicatenario que infecta a labacteria Pseudomonas , pero puede infectar a otras bacterias. Es el único género de la familia Cystoviridae . El nombre del grupo c ysto deriva del griego kystis que significa vejiga o saco. Hay siete especies en este género. [1] [2] [3]
Cistovirus | |
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Partícula, reconstrucción y genoma del fago phi6 de Pseudomonas | |
Clasificación de virus | |
(no clasificado): | Virus |
Reino : | Riboviria |
Reino: | Orthornavirae |
Filo: | Duplornaviricota |
Clase: | Vidaverviricetes |
Pedido: | Mindivirales |
Familia: | Cystoviridae |
Género: | Cistovirus |
Especies | |
Descubrimiento
El virus de Pseudomonas phi6 fue el primer virus de esta familia en ser descubierto y fue caracterizado inicialmente en 1973 por Anne Vidaver en la Universidad de Nebraska . Encontró que cuando cultivó la cepa bacteriana Pseudomonas phaseolicola HB1OY conpaja de frijol infectadacon halo , se detectaron efectos citopáticos en céspedes cultivados, lo que indica que había un microbio lítico o bacteriófago presente. [4]
En 1999, el laboratorio de Leonard Mindich en el Instituto de Investigación de Salud Pública asociado con la Universidad de Nueva York identificó phi7-14 . Lo hicieron cultivando varias hojas en caldo de lisogenia y luego colocando el caldo en céspedes de Pseudomonas syringae pv phaseolicola . Pudieron identificar placas virales a partir de esto y luego secuenciar sus genomas. [5]
Microbiología
Estructura
Las partículas de cistovirus están envueltas , con geometrías icosaédricas y esféricas, y simetría T = 13, T = 2. El diámetro del virión es de alrededor de 85 nm. Los cistovirus se distinguen por su capa externa de proteínas y su envoltura lipídica . Ningún otro bacteriófago tiene lípidos en su capa externa, aunque Tectiviridae y Corticoviridae tienen lípidos dentro de sus cápsides . [1] [2]
Genoma
Los cistovirus tienen un genoma de ARN bicatenario tripartito que tiene aproximadamente 14 kpb de longitud total. El genoma es lineal y segmentado, y está etiquetado como grande (L) 6,4 kbp, mediano (M) 4 kbp y pequeño (S) 2,9 kb de longitud. El genoma codifica doce proteínas. [1] [2]
Ciclo vital
Los citovirus ingresan a las bacterias por adsorción en su pilus y luego por fusión de la membrana. La replicación viral es citoplasmática. La replicación sigue el modelo de replicación del virus de ARN bicatenario. La transcripción del virus de ARN bicatenario es el método de transcripción. Los virus de la progenie se liberan de la célula por lisis . [1] [2]
La mayoría de los cistovirus identificados infectan especies de Pseudomonas , pero es probable que esto esté sesgado debido al método de detección y enriquecimiento. [6] Hay muchos miembros propuestos de esta familia. Se han identificado y nombrado los virus de Pseudomonas φ7, φ8, φ9, φ10, φ11, φ12 y φ13, [5] pero también se han aislado otros virus similares a los cistovirus. [6] Estos siete parientes putativos se clasifican como parientes cercanos (φ7, φ9, φ10, φ11) o lejanos (φ8, φ12, φ13) de φ6, [5] y se cree que los parientes lejanos infectan a través del LPS en lugar de la pili. [7]
Otros anfitriones
El cistovirus puede infectar a otras bacterias como Streptomyces según un estudio transcriptómico [8] y Lactococcus y Pectobacterium según el NCBI, que incluye dos fagos de ARN no asignados en la familia. [9] Esto sugiere que la gama de huéspedes de cistovirus puede extenderse a bacterias grampositivas . [8]
Taxonomía
Los miembros de Cystoviridae parecen estar más estrechamente relacionados con Reoviridae , [10] pero también comparten homología con Totiviridae . En particular, los genes estructurales de los cistovirus son muy similares a los utilizados por varios virus de ARNdc que infectan eucariotas. [11] El género Cystovirus tiene siete especies: [1]
- Virus de Pseudomonas phi6
- Virus de Pseudomonas phi8
- Virus de Pseudomonas phi12
- Virus de Pseudomonas phi13
- Virus de Pseudomonas phi2954
- PhiNN del virus de Pseudomonas
- Virus de Pseudomonas phiYY
Otros fagos no asignados:
- Streptomyces virus phi0 [8]
- Virus Lactococcus phi7-4 [9]
- Virus de Pectobacterium MA14 [9]
Referencias
- ^ a b c d e "Informe de ICTV Cystoviridae" .
- ^ a b c d "Zona Viral" . EXPASY . Consultado el 15 de junio de 2015 .
- ^ "Explorador de taxonomía NCBI: Cystoviridae" . NCBI . Consultado el 19 de junio de 2016 .
- ^ Vidaver AK, Koski RK, Van Etten JL (mayo de 1973). "Bacteriófago Φ6 un virus que contiene lípidos de Pseudomonas phaseolicola". Revista de Virología . 11 (15): 799–805.
- ^ a b c Mindich L, Qiao X, Qiao J, Onodera S, Romantschuk M, Hoogstraten D (agosto de 1999). "Aislamiento de bacteriófagos adicionales con genomas de ARN bicatenario segmentado" . J. Bacteriol . 181 (15): 4505–8. PMC 103579 . PMID 10419946 .
- ^ a b Silander OK, Weinreich DM, Wright KM, et al. (Diciembre de 2005). "Intercambio genético generalizado entre bacteriófagos terrestres" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 102 (52): 19009–14. Código Bibliográfico : 2005PNAS..10219009S . doi : 10.1073 / pnas.0503074102 . PMC 1323146 . PMID 16365305 .
- ^ Gottlieb P, Potgieter C, Wei H y Toporovsky I (2002). "Caracterización de φ12, un bacteriófago relacionado con φ6: secuencia de nucleótidos del ARN bicatenario grande". Virología . 295 (2): 266–271. doi : 10.1006 / viro.2002.1436 . PMID 12033785 .
- ↑ a b c Siddharth R. Krishnamurthy, Andrew B. Janowski, Guoyan Zhao, Dan Barouch, David Wang (2016). Hiperexpansión de la diversidad de bacteriófagos de ARN . Más uno.
- ^ a b c Cystoviridae . Taxonomía NCBI.
- ^ Butcher SJ, Dokland T, Ojala PM, Bamford DH, Fuller SD (julio de 1997). "Intermedios en la ruta de ensamblaje del virus de ARN bicatenario phi6" . EMBO J . 16 (14): 4477–87. doi : 10.1093 / emboj / 16.14.4477 . PMC 1170074 . PMID 9250692 .
- ^ Koonin, Eugene V .; Dolja, Valerian V .; Krupovic, Mart (2015). "Orígenes y evolución de virus de eucariotas: la modularidad definitiva" . Virología . 479–480: 2–25. doi : 10.1016 / j.virol.2015.02.039 . PMC 5898234 . PMID 25771806 .
enlaces externos
- Informe en línea de ICTV : Cystoviridae
- Zona viral : Cistovirus