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Los citocromos P450 ( CYP ) son una superfamilia de enzimas que contienen hemo como cofactor que funcionan como monooxigenasas . [1] [2] [3] En los mamíferos, estas proteínas oxidan esteroides , ácidos grasos y xenobióticos , y son importantes para la eliminación de varios compuestos, así como para la síntesis y degradación de hormonas. En las plantas, estas proteínas son importantes para la biosíntesis de compuestos defensivos , ácidos grasos y hormonas. [2]

Las enzimas CYP se han identificado en todos los reinos de la vida: animales , plantas , hongos , protistas , bacterias y arqueas , así como en virus . [4] Sin embargo, no son omnipresentes; por ejemplo, no se han encontrado en Escherichia coli . [3] [5] A partir de 2018 , se conocen más de 300.000 proteínas CYP distintas. [6] [7]

Los CYP son, en general, las enzimas oxidasa terminales en las cadenas de transferencia de electrones , categorizadas ampliamente como sistemas que contienen P450 . El término "P450" se deriva del pico espectrofotométrico en la longitud de onda del máximo de absorción de la enzima (450  nm ) cuando está en el estado reducido y complejado con monóxido de carbono . La mayoría de los CYP requieren una proteína asociada para entregar uno o más electrones para reducir el hierro (y eventualmente el oxígeno molecular ).

Nomenclatura [ editar ]

Los genes que codifican las enzimas CYP, y las enzimas mismas, se designan con el símbolo de raíz CYP para la superfamilia , seguido de un número que indica la familia de genes , una letra mayúscula que indica la subfamilia y otro número para el gen individual. La convención es poner en cursiva el nombre cuando se hace referencia al gen. Por ejemplo, CYP2E1 es el gen que codifica la enzima CYP2E1, una de las enzimas involucradas en el metabolismo del paracetamol (acetaminofeno). La nomenclatura CYP es la convención de nomenclatura oficial, aunque ocasionalmente CYP450 o CYP 450se utiliza como sinónimo. Sin embargo, algunos nombres de genes o enzimas para los CYP pueden diferir de esta nomenclatura, lo que indica la actividad catalítica y el nombre del compuesto utilizado como sustrato. Los ejemplos incluyen CYP5A1 , tromboxano A 2 sintasa, abreviada a TBXAS1 ( T hrom B o X ane A 2 S ynthase 1 ), y CYP51A1 , lanosterol 14-α-desmetilasa, a veces no oficial abrevia a LDM de acuerdo con su sustrato ( L anosterol) y actividad ( D e M etilación). [8]

Las pautas de nomenclatura actuales sugieren que los miembros de las nuevas familias CYP comparten al menos el 40% de identidad de aminoácidos , mientras que los miembros de las subfamilias deben compartir al menos el 55% de identidad de aminoácidos. Hay comités de nomenclatura que asignan y rastrean tanto los nombres de genes base ( página de inicio del citocromo P450 ) como los nombres de los alelos ( Comité de nomenclatura de alelos CYP ). [9] [10]

Clasificación [ editar ]

Según la naturaleza de las proteínas de transferencia de electrones, los CYP se pueden clasificar en varios grupos: [11]

Sistemas microsomales P450
en el que los electrones se transfieren desde NADPH a través de la citocromo P450 reductasa (de forma diversa, CPR, POR o CYPOR). El citocromo b 5 (cyb 5 ) también puede contribuir a reducir el poder de este sistema después de ser reducido por la citocromo b 5 reductasa (CYB 5 R).
Sistemas mitocondriales P450
que emplean adrenodoxina reductasa y adrenodoxina para transferir electrones de NADPH a P450.
Sistemas bacterianos P450
que emplean una ferredoxina reductasa y una ferredoxina para transferir electrones a P450.
Sistemas CYB 5 R / cyb 5 / P450 , en los que ambos electrones requeridos por el CYP provienen del citocromo b 5 .
Sistemas FMN / Fd / P450
que se encuentra originalmente en especies de Rhodococcus , en las que una reductasa que contiene un dominio FMN se fusiona con el CYP.
Solo P450
sistemas, que no requieren potencia reductora externa. Los notables incluyen tromboxano sintasa (CYP5), prostaciclina sintasa (CYP8) y CYP74A ( aleno óxido sintasa ).

La reacción más común catalizada por los citocromos P450 es una reacción de monooxigenasa , por ejemplo, la inserción de un átomo de oxígeno en la posición alifática de un sustrato orgánico (RH) mientras que el otro átomo de oxígeno se reduce a agua:

RH + O 2 + NADPH + H + → ROH + H 2 O + NADP +

Muchas reacciones de hidroxilación (inserción de grupos hidroxilo ) utilizan enzimas CYP.

Mecanismo [ editar ]

El "intermedio de Fe (V)" en la parte inferior izquierda es una simplificación: es un Fe (IV) con un ligando hemo radical .

Estructura [ editar ]

El sitio activo del citocromo P450 contiene un centro de hemo- hierro. El hierro está unido a la proteína a través de un ligando de tiolato de cisteína . Esta cisteína y varios residuos flanqueantes están altamente conservados en CYP conocidos y tienen el patrón de consenso de firma PROSITE formal [FW] - [SGNH] - x - [GD] - {F} - [RKHPT] - {P} - C - [LIVMFAP ] - [GAD]. [12] Debido a la gran variedad de reacciones catalizadas por los CYP, las actividades y propiedades de muchos CYP difieren en muchos aspectos. [13] En general, el ciclo catalítico del P450 procede de la siguiente manera:

Ciclo catalítico [ editar ]

  1. El sustrato se une cerca del grupo hemo , en el lado opuesto al tiolato axial. La unión al sustrato induce un cambio en la conformación del sitio activo, a menudo desplazando una molécula de agua de la posición de coordinación axial distal del hierro hemo, [14] y cambiando el estado del hierro hemo de espín bajo a espín alto. [15]
  2. La unión al sustrato induce la transferencia de electrones desde NAD (P) H a través de la citocromo P450 reductasa u otra reductasa asociada . [dieciséis]
  3. El oxígeno molecular se une al centro hemo ferroso resultante en la posición de coordinación axial distal, dando inicialmente un aducto de dioxígeno similar a la oxi-mioglobina.
  4. Se transfiere un segundo electrón, ya sea del citocromo P450 reductasa , ferredoxinas o del citocromo b 5 , reduciendo el aducto de Fe-O 2 para dar un estado peroxo de corta duración.
  5. El grupo peroxo formado en el paso 4 se protona rápidamente dos veces, liberando una molécula de agua y formando la especie altamente reactiva denominada Compuesto 1 P450 (o simplemente Compuesto I). Este intermedio altamente reactivo se aisló en 2010, [17] P450 El compuesto 1 es una especie de hierro (IV) oxo (o ferryl ) con un equivalente oxidante adicional deslocalizado sobre los ligandos de porfirina y tiolato. Falta evidencia de la alternativa de hierro (V) -oxo [14] . [17]
  6. Dependiendo del sustrato y la enzima involucrados, las enzimas P450 pueden catalizar cualquiera de una amplia variedad de reacciones. En esta ilustración se muestra una hidroxilación hipotética. Una vez que el producto se ha liberado del sitio activo, la enzima vuelve a su estado original, con una molécula de agua que vuelve a ocupar la posición de coordinación distal del núcleo de hierro.
Mecanismo de rebote de oxígeno utilizado por el citocromo P450 para la conversión de hidrocarburos en alcoholes mediante la acción del "compuesto I", un óxido de hierro (IV) unido a un catión radical hemo.
  1. Una ruta alternativa para la monooxigenación es a través de la "derivación de peróxido" (ruta "S" en la figura). Esta vía implica la oxidación del complejo de sustrato férrico con donantes de átomos de oxígeno como peróxidos e hipocloritos. [18] En el diagrama se muestra un peróxido hipotético "XOOH".

Espectroscopia [ editar ]

La unión del sustrato se refleja en las propiedades espectrales de la enzima, con un aumento de la absorbancia a 390 nm y una disminución a 420 nm. Esto se puede medir mediante espectroscopias de diferencia y se denomina espectro de diferencia de "tipo I" (consulte el gráfico recuadro en la figura). Algunos sustratos provocan un cambio opuesto en las propiedades espectrales, un espectro de "tipo I inverso", mediante procesos que aún no están claros. Los inhibidores y ciertos sustratos que se unen directamente al hierro hemo dan lugar al espectro diferencial de tipo II, con un máximo a 430 nm y un mínimo a 390 nm (ver gráfico recuadro en la figura). Si no se dispone de equivalentes reductores, este complejo puede permanecer estable, lo que permite determinar el grado de unión a partir de mediciones de absorbancia in vitro [18].C: Si el monóxido de carbono (CO) se une al P450 reducido, el ciclo catalítico se interrumpe. Esta reacción produce el espectro de diferencia de CO clásico con un máximo a 450 nm.

P450s en humanos [ editar ]

Los CYP humanos son principalmente proteínas asociadas a la membrana [19] ubicadas en la membrana interna de las mitocondrias o en el retículo endoplásmico de las células. Los CYP metabolizan miles de sustancias químicas endógenas y exógenas . Algunos CYP metabolizan solo uno (o muy pocos) sustratos, como CYP19 ( aromatasa ), mientras que otros pueden metabolizar múltiples sustratos . Ambas características explican su importancia central en la medicina . Las enzimas del citocromo P450 están presentes en la mayoría de los tejidos del cuerpo y juegan un papel importante en la síntesis y degradación de hormonas (incluyendosíntesis y metabolismo de estrógenos y testosterona ), síntesis de colesterol y metabolismo de la vitamina D. Las enzimas del citocromo P450 también funcionan para metabolizar compuestos potencialmente tóxicos, incluidos fármacos y productos del metabolismo endógeno como la bilirrubina , principalmente en el hígado .

El Proyecto del Genoma Humano ha identificado 57 genes humanos que codifican las diversas enzimas del citocromo P450. [20]

Metabolismo de las drogas [ editar ]

Proporción de fármacos antifúngicos metabolizados por diferentes familias de CYP. [21]

Los CYP son las principales enzimas implicadas en el metabolismo de los fármacos y representan aproximadamente el 75% del metabolismo total. [22] La mayoría de las drogas se desactivan por los CYP, ya sea directamente o por excreción facilitada del cuerpo. Además, muchas sustancias son bioactivadas por los CYP para formar sus compuestos activos, como el fármaco antiplaquetario clopidogrel .

Interacción de drogas [ editar ]

Muchos fármacos pueden aumentar o disminuir la actividad de varias isoenzimas CYP induciendo la biosíntesis de una isoenzima ( inducción enzimática ) o inhibiendo directamente la actividad del CYP ( inhibición enzimática ). Un ejemplo clásico incluye los fármacos antiepilépticos , como la fenitoína , que induce CYP1A2 , CYP2C9 , CYP2C19 y CYP3A4 .

Los efectos sobre la actividad de la isoenzima CYP son una fuente importante de interacciones farmacológicas adversas , ya que los cambios en la actividad de la enzima CYP pueden afectar el metabolismo y la depuración de varios fármacos. Por ejemplo, si un fármaco inhibe el metabolismo mediado por CYP de otro fármaco, el segundo fármaco puede acumularse dentro del cuerpo a niveles tóxicos. Por lo tanto, estas interacciones medicamentosas pueden requerir ajustes de dosis o elegir medicamentos que no interactúen con el sistema CYP. Es especialmente importante tener en cuenta estas interacciones medicamentosas cuando se utilizan medicamentos de vital importancia para el paciente, medicamentos con efectos secundarios importantes o medicamentos con un índice terapéutico estrecho ., pero cualquier fármaco puede estar sujeto a una concentración plasmática alterada debido al metabolismo alterado del fármaco.

Muchos sustratos del CYP3A4 son fármacos con un índice terapéutico estrecho , como la amiodarona [23] o la carbamazepina . [24] Debido a que estos fármacos son metabolizados por CYP3A4, los niveles plasmáticos medios de estos fármacos pueden aumentar debido a la inhibición enzimática o disminuir debido a la inducción enzimática.

Interacción de otras sustancias [ editar ]

Los compuestos de origen natural también pueden inducir o inhibir la actividad CYP. Por ejemplo, se ha descubierto que los compuestos bioactivos que se encuentran en el jugo de toronja y algunos otros jugos de frutas, como bergamottina , dihidroxibergamottina y paradicina-A , inhiben el metabolismo de ciertos medicamentos mediado por CYP3A4 , lo que aumenta la biodisponibilidad y, por lo tanto, la gran posibilidad de sobredosis . [25] Debido a este riesgo, generalmente se recomienda evitar el jugo de toronja y las toronjas frescas por completo mientras se toman medicamentos. [26]

Otros ejemplos:

  • La hierba de San Juan , un remedio herbal común, induce CYP3A4 , pero también inhibe CYP1A1 , CYP1B1 . [27] [28]
  • El tabaquismo induce CYP1A2 (por ejemplo, los sustratos de CYP1A2 son clozapina , olanzapina y fluvoxamina ) [29]
  • En concentraciones relativamente altas, también se ha demostrado que el jugo de carambola inhibe el CYP2A6 y otros CYP. [30] El berro también es un inhibidor conocido del citocromo P450 CYP2E1 , que puede producir alteraciones en el metabolismo del fármaco en personas que toman ciertos medicamentos (p. Ej., Clorzoxazona ). [31]
  • Se ha descubierto que el tributilestaño inhibe la función del citocromo P450, lo que conduce a la masculinización de los moluscos. [32]
  • Se ha demostrado que el sello de oro , con sus dos alcaloides notables, berberina e hidrastina , altera las actividades enzimáticas del marcador P450 (que involucra a CYP2C9, CYP2D6 y CYP3A4). [33]

Otras funciones específicas de CYP [ editar ]

Hormonas esteroides [ editar ]

Esteroidogénesis , que muestra muchas de las actividades enzimáticas que realizan las enzimas del citocromo P450. [34] HSD: hidroxiesteroide deshidrogenasa.

Un subconjunto de enzimas del citocromo P450 juega un papel importante en la síntesis de hormonas esteroides ( esteroidogénesis ) por las glándulas suprarrenales , las gónadas y el tejido periférico:

  • CYP11A1 (también conocido como P450scc o P450c11a1) en las mitocondrias suprarrenales afecta "la actividad antes conocida como 20,22-desmolasa" (esteroide 20α-hidroxilasa, esteroide 22-hidroxilasa, escisión de la cadena lateral del colesterol ).
  • CYP11B1 (que codifica la proteína P450c11β) que se encuentra en la membrana mitocondrial interna de la corteza suprarrenal tiene actividades de esteroide 11β-hidroxilasa, esteroide 18-hidroxilasa y esteroide 18-metiloxidasa.
  • CYP11B2 (que codifica la proteína P450c11AS), que se encuentra sólo en las mitocondrias de la zona glomerulosa suprarrenal , tiene actividades de esteroide 11β-hidroxilasa, esteroide 18-hidroxilasa y esteroide 18-metiloxidasa.
  • CYP17A1 , en el retículo endoplásmico de la corteza suprarrenal tiene actividades de esteroide 17α-hidroxilasa y 17,20-liasa.
  • CYP21A2 (P450c21) en la corteza suprarrenal conduce la actividad 21-hidroxilasa .
  • CYP19A (P450arom, aromatasa ) en el retículo endoplásmico de las gónadas , el cerebro , el tejido adiposo y en otros lugares cataliza la aromatización de andrógenos a estrógenos .

Ácidos grasos poliinsaturados y eicosanoides [ editar ]

Ciertas enzimas del citocromo P450 son críticas para metabolizar los ácidos grasos poliinsaturados (PUFA) a moléculas de señalización celular intercelular biológicamente activas ( eicosanoides ) y / o metabolizar metabolitos biológicamente activos de los PUFA a productos menos activos o inactivos. Estos CYP poseen actividad enzimática citocromo P450 omega hidroxilasa y / o epoxigenasa .

  • CYP1A1 , CYP1A2 y CYP2E1 metabolizan PUFA endógenos a moléculas de señalización: metabolizan el ácido araquidónico (es decir, AA) a ácido 19-hidroxieicosatetraenoico (es decir, 19-HETE; ver ácido 20-hidroxieicosatetraenoico ); ácido eicosapentaenoico (es decir, EPA) a ácidos epoxieicosatetraenoicos (es decir, EEQ); y ácido docosahexaenoico (es decir, DHA) a ácidos epoxidocosapentaenoicos (es decir, EDP).
  • CYP2C8 , CYP2C9 , CYP2C18 , CYP2C19 y CYP2J2 metabolizan PUFA endógenos a moléculas de señalización: metabolizan AA a ácidos epoxieicosatetraenoicos (es decir, EET); EPA a EEQ; y DHA a los EDP.
  • CYP2S1 metaboliza PUFA a moléculas de señalización: metaboliza AA a EET y EPA a EEQ.
  • CYP3A4 metaboliza AA a moléculas de señalización EET.
  • CYP4A11 metaboliza PUFA endógenos a moléculas de señalización: metaboliza AA a 20-HETE y EET; también hidroxila el DHA a 22-hidroxi-DHA (es decir, 12-HDHA).
  • CYP4F2 , CYP4F3A y CYP4F3B (ver CYP4F3 para los dos últimos CYP) metabolizan PUFA a moléculas de señalización: metabolizan AA a 20-HETE. También metabolizan EPA a ácido 19-hidroxieicosapentaenoico (19-HEPE) y ácido 20-hidroxieicosapentaenoico (20-HEPE), así como metabolizan DHA a 22-HDA. También inactivan o reducen la actividad de las moléculas de señalización: metabolizan el leucotrieno B4 (LTB4) a 20-hidroxi-LTB4, ácido 5-hidroxieicosatetraenoico (5-HETE) a 5,20-diHETE, ácido 5-oxo-eicosatetraenoico (5- oxo-ETE) a 5-oxo, 20-hidroxi-ETE, ácido 12-hidroxieicosatetraenoico (12-HETE) a 12,20-diHETE, EET a 20-hidroxi-EET y lipoxinas a productos 20-hidroxi.
  • CYP4F8 y CYP4F12 metabolizan PUFA a moléculas de señalización: metabolizan EPA a EEQ y DHA a EDP. También metabolizan AA a ácido 18-hidroxieicosatetraenoico (18-HETE) y 19-HETE.
  • CYP4F11 inactiva o reduce la actividad de las moléculas de señalización: metaboliza LTB4 a 20-hidroxi-LTB4, (5-HETE) a 5,20-diHETE, (5-oxo-ETE) a 5-oxo, 20-hidroxi-ETE, (12-HETE) a 12,20-diHETE, EET a 20-hidroxi-EET y lipoxinas a productos 20-hidroxi.
  • CYP4F22 ω-hidroxila " ácidos grasos de cadena muy larga" extremadamente largos , es decir, ácidos grasos que tienen 28 o más carbonos de longitud. La ω-hidroxilación de estos ácidos grasos especiales es fundamental para crear y mantener la función de barrera de agua de la piel; Las mutaciones inactivadoras autosómicas recesivas de CYP4F22 están asociadas con el subtipo de ictiosis laminar del eritrodema ictiosiforme congénito en humanos. [35]

Familias CYP en humanos [ editar ]

Los seres humanos tienen 57 genes y más de 59 pseudogenes divididos en 18 familias de genes del citocromo P450 y 43 subfamilias. [36] Este es un resumen de los genes y de las proteínas que codifican. Consulte la página de inicio del Comité de Nomenclatura del citocromo P450 para obtener información detallada. [20]

P450 en otras especies [ editar ]

Animales [ editar ]

Muchos animales tienen tantos o más genes CYP que los humanos. Los números reportados van desde 35 genes en la esponja Amphimedon queenslandica hasta 235 genes en el cefalocordato Branchiostoma floridae . [37] Los ratones tienen genes para 101 CYP y los erizos de mar tienen incluso más (quizás hasta 120 genes). [38] Se presume que la mayoría de las enzimas CYP tienen actividad monooxigenasa, como es el caso de la mayoría de las CYP de mamíferos que se han investigado (excepto, por ejemplo, CYP19 y CYP5 ). La secuenciación de genes y genomas está superando con creces a la bioquímicacaracterización de la función enzimática, aunque se han encontrado muchos genes con homología cercana a los CYP con función conocida, lo que da pistas sobre su funcionalidad.

Las clases de CYP que se investigan con mayor frecuencia en animales no humanos son las que intervienen en el desarrollo (p. Ej., Ácido retinoico o metabolismo hormonal ) o implicadas en el metabolismo de compuestos tóxicos (como aminas heterocíclicas o hidrocarburos poliaromáticos ). A menudo existen diferencias en la regulación genética o la función enzimática.de CYP en animales relacionados que explican las diferencias observadas en la susceptibilidad a compuestos tóxicos (por ejemplo, la incapacidad de los caninos para metabolizar xantinas como la cafeína). Algunos fármacos se metabolizan en ambas especies a través de diferentes enzimas, lo que da lugar a diferentes metabolitos, mientras que otros fármacos se metabolizan en una especie pero se excretan sin cambios en otra especie. Por esta razón, la reacción de una especie a una sustancia no es una indicación confiable de los efectos de la sustancia en los seres humanos. Una especie de Drosophila del desierto de Sonora que utiliza una expresión regulada al alza del gen CYP28A1 para la desintoxicación de la pudrición del cactus es Drosophila mettleri . Las moscas de esta especie se han adaptado a una regulación positiva de este gen debido a la exposición de altos niveles de alcaloides en las plantas hospedadoras.

Los CYP se han examinado extensamente en ratones , ratas , perros y menos en el pez cebra , con el fin de facilitar el uso de estos organismos modelo en el descubrimiento de fármacos y la toxicología . Recientemente, también se han descubierto CYP en especies de aves, en particular pavos, que pueden resultar un modelo útil para la investigación del cáncer en humanos. [39] Se encontró que CYP1A5 y CYP3A37 en pavos eran muy similares a los CYP1A2 y CYP3A4 humanos respectivamente, en términos de sus propiedades cinéticas, así como en el metabolismo de la aflatoxina B1. [40]

Los CYP también se han estudiado exhaustivamente en insectos , a menudo para comprender la resistencia a los pesticidas . Por ejemplo, CYP6G1 está vinculada a resistencia a los insecticidas en DDT resistente a Drosophila melanogaster [41] y CYP6M2 en el mosquito de la malaria vector Anopheles gambiae es capaz de metabolizar directamente piretroides . [42]

Microbiano [ editar ]

Los citocromos microbianos P450 son a menudo enzimas solubles y participan en diversos procesos metabólicos. En las bacterias, la distribución de P450 es muy variable y muchas bacterias no tienen P450 identificadas (por ejemplo, E. coli). Algunas bacterias, predominantemente actinomicetos, tienen numerosos P450 (p. Ej., [43] [44] ). Los hasta ahora identificada en general están involucrados en cualquiera de biotransformación de compuestos xenobióticos (por ejemplo CYP105A1 de Streptomyces griseolus metaboliza sulfonilurea herbicidas a derivados menos tóxicos, [45] ) o son parte de las vías biosintéticas de metabolitos especializados (por ejemplo CYP170B1 catálisis de producción de la albaflavenone sesquiterpenoid en Streptomyces albus [46]). Aunque todavía no se ha demostrado que P450 sea esencial en un microbio, la familia CYP105 está altamente conservada con un representante en cada genoma de estreptomicetos secuenciado hasta ahora. [47]Debido a la solubilidad de las enzimas bacterianas P450, generalmente se considera que es más fácil trabajar con ellas que las P450 eucariotas predominantemente unidas a la membrana. Esto, combinado con la notable química que catalizan, ha dado lugar a muchos estudios que utilizan proteínas expresadas heterólogamente in vitro. Pocos estudios han investigado qué hacen las P450 in vivo, cuáles son los sustratos naturales y cómo las P450 contribuyen a la supervivencia de las bacterias en el entorno natural. Aquí se enumeran tres ejemplos que han contribuido significativamente a los estudios estructurales y mecanicistas, pero muchos diferentes las familias existen.

  • El citocromo P450 cam (CYP101A1) originario de Pseudomonas putida se ha utilizado como modelo para muchos citocromos P450 y fue la primera estructura proteica tridimensional del citocromo P450 resuelta por cristalografía de rayos X. Esta enzima es parte de un ciclo catalítico de hidroxilación de alcanfor que consta de dos pasos de transferencia de electrones de la putidaredoxina , un cofactor de proteína que contiene el grupo 2Fe-2S.
  • El citocromo P450 eryF (CYP107A1) originario de la bacteria actinomiceto Saccharopolyspora erythraea es responsable de la biosíntesis del antibiótico eritromicina por hidroxilación en C6 del macrólido 6-desoxyeritronólido B.
  • El citocromo P450 BM3 (CYP102A1) de la bacteria del suelo Bacillus megaterium cataliza la hidroxilación dependiente de NADPH de varios ácidos grasos de cadena larga en las posiciones ω – 1 a ω – 3. A diferencia de casi todos los demás CYP conocidos (excepto CYP505A1, citocromo P450 foxy), constituye una proteína de fusión natural entre el dominio CYP y un cofactor donador de electrones. Por tanto, BM3 es potencialmente muy útil en aplicaciones biotecnológicas. [48] [49]
  • El citocromo P450 119 ( CYP119A1 ) aislado de la arquea termófila Sulfolobus solfataricus [50] se ha utilizado en una variedad de estudios mecanicistas. [17] Debido a que las enzimas termófilas evolucionaron para funcionar a altas temperaturas, tienden a funcionar más lentamente a temperatura ambiente (si es que lo hacen) y, por lo tanto, son excelentes modelos mecanicistas.

Hongos [ editar ]

Los fármacos antimicóticos de la clase azol comúnmente utilizados actúan mediante la inhibición de la 14α-desmetilasa del citocromo P450 fúngico . Esto interrumpe la conversión de lanosterol en ergosterol , un componente de la membrana celular de los hongos. (Esto es útil solo porque el P450 de los humanos tiene una sensibilidad diferente; así es como funciona esta clase de antifúngicos ). [51]

Se están llevando a cabo importantes investigaciones sobre los hongos P450, ya que varios hongos son patógenos para los seres humanos (como la levadura Candida y Aspergillus ) y para las plantas.

Cunninghamella elegans es un candidato para su uso como modelo para el metabolismo de fármacos en mamíferos.

Plantas [ editar ]

Los citocromos P450 de plantas están involucrados en una amplia gama de reacciones biosintéticas y se dirigen a una amplia gama de biomoléculas. Estas reacciones conducen a varios conjugados de ácidos grasos , hormonas vegetales , metabolitos secundarios , ligninas y una variedad de compuestos defensivos. [52] Las anotaciones del genoma vegetal sugieren que los genes del citocromo P450 constituyen hasta el 1% de los genes vegetales. El número y la diversidad de genes P450 es responsable, en parte, de la multitud de compuestos bioactivos. [53]

La O-desmetilasa aromática del citocromo P450 , que se compone de dos partes promiscuas distintas: una proteína del citocromo P450 (GcoA) y la reductasa de tres dominios, es importante por su capacidad para convertir la lignina, el biopolímero aromático común en las paredes celulares de las plantas, en cadenas de carbono renovables. en un conjunto catabólico de reacciones. En resumen, es un facilitador de un paso crítico en la conversión de lignina.

P450 en biotecnología [ editar ]

La notable reactividad y promiscuidad del sustrato de los P450 han atraído durante mucho tiempo la atención de los químicos. [54] Los avances recientes hacia la realización del potencial del uso de P450 para oxidaciones difíciles han incluido: (i) eliminar la necesidad de cofactores naturales reemplazándolos con moléculas de bajo costo que contienen peróxido, [55] (ii) explorar la compatibilidad de P450 con disolventes orgánicos, [56] y (iii) el uso de auxiliares pequeños no quirales para dirigir de manera predecible la oxidación del P450. [ cita requerida ]

Subfamilias de InterPro [ editar ]

Subfamilias de InterPro :

  • Citocromo P450, clase B InterPro :  IPR002397
  • Citocromo P450, InterPro mitocondrial :  IPR002399
  • Citocromo P450, clase E, grupo I InterPro :  IPR002401
  • Citocromo P450, clase E, grupo II InterPro :  IPR002402
  • Citocromo P450, clase E, grupo IV InterPro :  IPR002403
  • Aromatasa

Clozapina, imipramina, paracetamol, fenacetina Arilaminas heterocíclicas inducibles y CYP1A2 5-10% deficiente oxidan uroporfirinógeno a uroporfirina (CYP1A2) en el metabolismo del hemo, pero pueden tener sustratos endógenos adicionales no descubiertos. son inducibles por algunos hidrocarburos policíclicos, algunos de los cuales se encuentran en el humo del cigarrillo y en los alimentos carbonizados.

Estas enzimas son de interés porque en los ensayos pueden activar compuestos carcinógenos. Los niveles altos de CYP1A2 se han relacionado con un mayor riesgo de cáncer de colon. Dado que la enzima 1A2 puede ser inducida por fumar cigarrillos, esto relaciona el tabaquismo con el cáncer de colon. [57]

Ver también [ editar ]

  • Enzima esteroidogénica
  • Deficiencia de oxidorreductasa del citocromo P450
  • Familia CYP11

Referencias [ editar ]

  1. ^ González FJ, Gelboin HV (noviembre de 1992). "Citocromos humanos P450: evolución y expresión dirigida por ADNc" . Perspectivas de salud ambiental . 98 : 81–5. doi : 10.1289 / ehp.929881 . PMC  1519618 . PMID  1486867 .
  2. ^ a b "Citocromo P450" . InterPro .
  3. ↑ a b Danielson PB (diciembre de 2002). "La superfamilia del citocromo P450: bioquímica, evolución y metabolismo de fármacos en humanos". Metabolismo actual de los fármacos . 3 (6): 561–97. doi : 10.2174 / 1389200023337054 . PMID 12369887 . 
  4. ^ Cordero DC, Lei L, Warrilow AG, Lepesheva GI, Mullins JG, Waterman MR, Kelly SL (agosto de 2009). "El primer citocromo p450 codificado viralmente" . Revista de Virología . 83 (16): 8266–9. doi : 10.1128 / JVI.00289-09 . PMC 2715754 . PMID 19515774 .  
  5. ^ Sigel R, Sigel A, Sigel H (2007). Los roles ubicuos de las proteínas del citocromo P450: iones metálicos en las ciencias de la vida . Nueva York: Wiley. ISBN 978-0-470-01672-5.
  6. ^ Nelson, David R. (enero de 2018). "Diversidad del citocromo P450 en el árbol de la vida" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteínas y proteómica . 1866 (1): 141-154. doi : 10.1016 / j.bbapap.2017.05.003 . PMC 5681887 . PMID 28502748 .  
  7. ^ Nelson D (2009). "Página de inicio del citocromo P450" . Genómica humana . Universidad de Tennessee. 4 (1): 59–65. doi : 10.1186 / 1479-7364-4-1-59 . PMC 3500189 . PMID 19951895 . Consultado el 13 de noviembre de 2014 .  
  8. ^ "Visor de secuencia NCBI" . Consultado el 19 de noviembre de 2007 .
  9. ^ Nelson, DR (octubre de 2009). "La página de inicio del citocromo p450" . Genómica humana . 4 (1): 59–65. doi : 10.1186 / 1479-7364-4-1-59 . PMC 3500189 . PMID 19951895 .  
  10. ^ Nelson, David R. (enero de 2011). "Progreso en el seguimiento de las rutas evolutivas del citocromo P450". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteínas y proteómica . 1814 (1): 14–18. doi : 10.1016 / j.bbapap.2010.08.008 . PMID 20736090 . 
  11. ^ Hanukoglu I (1996). "Proteínas de transferencia de electrones de los sistemas del citocromo P450" (PDF) . Adv. Mol. Cell Biol . Avances en Biología Molecular y Celular. 14 : 29–55. doi : 10.1016 / S1569-2558 (08) 60339-2 . ISBN  9780762301133.
  12. ^ [1] Patrón de consenso PROSITE para P450
  13. Srinivasan, Bharat (8 de octubre de 2020). "Tratamiento explícito de cinética atípica y no Michaelis-Menten en el descubrimiento temprano de fármacos" . dx.doi.org . Consultado el 9 de noviembre de 2020 .
  14. ↑ a b Meunier B, de Visser SP, Shaik S (septiembre de 2004). "Mecanismo de reacciones de oxidación catalizadas por enzimas del citocromo p450". Revisiones químicas . 104 (9): 3947–80. doi : 10.1021 / cr020443g . PMID 15352783 . S2CID 33927145 .  
  15. ^ Poulos TL, Finzel BC, Howard AJ (junio de 1987). "Estructura cristalina de alta resolución del citocromo P450cam". Revista de Biología Molecular . 195 (3): 687–700. doi : 10.1016 / 0022-2836 (87) 90190-2 . PMID 3656428 . 
  16. ^ Sligar SG, Cinti DL, Gibson GG, Schenkman JB (octubre de 1979). "Control de estado de giro del potencial redox del citocromo P450 hepático". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 90 (3): 925–32. doi : 10.1016 / 0006-291X (79) 91916-8 . PMID 228675 . 
  17. ^ a b c Rittle J, Green MT (noviembre de 2010). "Compuesto I del citocromo P450: captura, caracterización y cinética de activación del enlace CH". Ciencia . 330 (6006): 933–7. Código bibliográfico : 2010Sci ... 330..933R . doi : 10.1126 / science.1193478 . PMID 21071661 . S2CID 206528205 .  
  18. ↑ a b Ortiz de Montellano, Paul R .; Paul R. Ortiz de Montellano (2005). Citocromo P450: estructura, mecanismo y bioquímica (3ª ed.). Nueva York: Kluwer Academic / Plenum Publishers. ISBN 978-0-306-48324-0.
  19. ^ Berka K, Hendrychová T, Anzenbacher P, Otyepka M (octubre de 2011). "La posición de la membrana del ibuprofeno concuerda con la entrada de la ruta de acceso sugerida al sitio activo del citocromo P450 2C9" . El Journal of Physical Chemistry A . 115 (41): 11248–55. Código bibliográfico : 2011JPCA..11511248B . doi : 10.1021 / jp204488j . PMC 3257864 . PMID 21744854 .  
  20. ^ a b "Tabla P450" .
  21. ^ doctorfungus> Interacciones de fármacos antimicóticos Archivado el 1 de agosto de 2012 en Archive.today Director de contenido: Russell E. Lewis, Pharm.D. Consultado el 23 de enero de 2010.
  22. ^ Guengerich FP (enero de 2008). "Citocromo p450 y toxicología química". Investigación química en toxicología . 21 (1): 70–83. doi : 10.1021 / tx700079z . PMID 18052394 . S2CID 17548932 .   (El metabolismo en este contexto es la modificación química o degradación de fármacos).
  23. ^ Zahno, A; Brecht, K; Morand, R; Maseneni, S; Török, M; Lindinger, PW; Krähenbühl, S (1 de febrero de 2011). "El papel de CYP3A4 en la toxicidad asociada a amiodarona en las células HepG2". Biochem Pharmacol . 81 (3): 432–41. doi : 10.1016 / j.bcp.2010.11.002 . PMID 21070748 . 
  24. ^ "Carbamazepina: esté atento a muchas interacciones farmacológicas potenciales" . Tiempos de farmacia .
  25. ^ Bailey DG, Dresser GK (2004). "Interacciones entre zumo de pomelo y fármacos cardiovasculares". Revista Estadounidense de Drogas Cardiovasculares . 4 (5): 281–97. doi : 10.2165 / 00129784-200404050-00002 . PMID 15449971 . S2CID 11525439 .  
  26. Zeratsky K (6 de noviembre de 2008). "Jugo de toronja: ¿Puede causar interacciones farmacológicas?" . Pregúntele a un especialista en alimentación y nutrición . MayoClinic.com . Consultado el 9 de febrero de 2009 .
  27. ^ Chaudhary A, Willett KL (enero de 2006). "Inhibición de las enzimas CYP 1 del citocromo humano por los flavonoides de la hierba de San Juan". Toxicología . 217 (2-3): 194-205. doi : 10.1016 / j.tox.2005.09.010 . PMID 16271822 . 
  28. ^ Strandell J, Neil A, Carlin G (febrero de 2004). "Un enfoque para la evaluación in vitro del potencial de inhibición de la enzima citocromo P450 de hierbas y otros remedios naturales". Fitomedicina . 11 (2-3): 98-104. doi : 10.1078 / 0944-7113-00379 . PMID 15070158 . 
  29. ^ Kroon LA (septiembre de 2007). "Interacciones farmacológicas con el tabaquismo". Revista Estadounidense de Farmacia del Sistema de Salud . 64 (18): 1917–21. doi : 10.2146 / ajhp060414 . PMID 17823102 . S2CID 5397510 .  
  30. ^ Zhang JW, Liu Y, Cheng J, Li W, Ma H, Liu HT, Sun J, Wang LM, He YQ, Wang Y, Wang ZT, Yang L (2007). "Inhibición del citocromo P450 del hígado humano por jugo de carambola" . Revista de Farmacia y Ciencias Farmacéuticas . 10 (4): 496–503. doi : 10.18433 / j30593 . PMID 18261370 . 
  31. ^ Leclercq I, Desager JP, Horsmans Y (agosto de 1998). "Inhibición del metabolismo de la clorzoxazona, una sonda clínica para CYP2E1, por una sola ingestión de berros". Farmacología clínica y terapéutica . 64 (2): 144–9. doi : 10.1016 / S0009-9236 (98) 90147-3 . PMID 9728894 . S2CID 43863786 .  
  32. ^ Walmsley, Simon. "Contaminación por tributilestaño a escala mundial. Una descripción general de la investigación reciente y relevante: impactos y problemas" (PDF) . WWF Reino Unido.
  33. ^ Chatterjee P, Franklin MR (noviembre de 2003). "Inhibición del citocromo p450 humano y formación del complejo intermedio metabólico por extracto de sello de oro y sus componentes metilendioxifenilo". Metabolismo y disposición de fármacos . 31 (11): 1391–7. doi : 10.1124 / dmd.31.11.1391 . PMID 14570772 . S2CID 2967171 .  
  34. ^ Häggström, Mikael; Richfield, David (2014). "Diagrama de las vías de la esteroidogénesis humana" . WikiJournal de Medicina . 1 (1). doi : 10.15347 / wjm / 2014.005 . ISSN 2002-4436 . 
  35. ^ Sugiura K, Akiyama M (julio de 2015). "Actualización sobre ictiosis congénita autosómica recesiva: el análisis de ARNm utilizando muestras de cabello es una poderosa herramienta para el diagnóstico genético". Revista de Ciencias Dermatológicas . 79 (1): 4–9. doi : 10.1016 / j.jdermsci.2015.04.009 . PMID 25982146 . 
  36. ^ Nelson D (2003). Citocromos P450 en humanos . Consultado el 9 de mayo de 2005.
  37. ^ Nelson DR, Goldstone JV, Stegeman JJ (febrero de 2013). "El locus de génesis del citocromo P450: el origen y evolución de los animales citocromo P450" . Transacciones filosóficas de la Royal Society de Londres. Serie B, Ciencias Biológicas . 368 (1612): 20120474. doi : 10.1098 / rstb.2012.0474 . PMC 3538424 . PMID 23297357 .  
  38. ^ Goldstone JV, Hamdoun A, Cole BJ, Howard-Ashby M, Nebert DW, Scally M, Dean M, Epel D, Hahn ME, Stegeman JJ (diciembre de 2006). "El defensoma químico: genes de detección y respuesta ambiental en el genoma de Strongylocentrotus purpuratus" . Biología del desarrollo . 300 (1): 366–84. doi : 10.1016 / j.ydbio.2006.08.066 . PMC 3166225 . PMID 17097629 .  
  39. ^ Rawal S, Kim JE, Coulombe R (diciembre de 2010). "Aflatoxina B1 en aves de corral: toxicología, metabolismo y prevención". Investigación en Veterinaria . 89 (3): 325–31. doi : 10.1016 / j.rvsc.2010.04.011 . PMID 20462619 . 
  40. ^ Rawal S, Coulombe RA (agosto de 2011). "Metabolismo de la aflatoxina B1 en microsomas de hígado de pavo: las funciones relativas de los citocromos P450 1A5 y 3A37". Toxicología y Farmacología Aplicada . 254 (3): 349–54. doi : 10.1016 / j.taap.2011.05.010 . PMID 21616088 . 
  41. ^ McCart C, Ffrench-Constant RH (junio de 2008). "Disección del gen Cyp6g1 del citocromo P450 asociado a la resistencia a insecticidas" . Ciencia del manejo de plagas . 64 (6): 639–45. doi : 10.1002 / ps.1567 . PMID 18338338 . 
  42. ^ Ismail, Hanafy; O'Neill, Paul; Hong, David; Finn, Robert; Henderson, Colin; Wright, Aaron; Cravatt, Benjamin; Hemingway, Janet; Paine, Mark (3 de diciembre de 2013). "Sondas basadas en actividad piretroide para perfilar las actividades del citocromo P450 asociadas con interacciones insecticidas" . PNAS . 110 (49): 19766–19771. Código bibliográfico : 2013PNAS..11019766I . doi : 10.1073 / pnas.1320185110 . PMC 3856776 . PMID 24248381 .  
  43. ^ McLean KJ, Clift D, Lewis DG, Sabri M, Balding PR, Sutcliffe MJ, Leys D, Munro AW (mayo de 2006). "La preponderancia de P450s en el genoma de Mycobacterium tuberculosis". Tendencias en microbiología . 14 (5): 220–8. doi : 10.1016 / j.tim.2006.03.002 . PMID 16581251 . 
  44. ^ Ikeda H, Ishikawa J, Hanamoto A, Shinose M, Kikuchi H, Shiba T, Sakaki Y, Hattori M, Omura S (mayo de 2003). "Secuencia completa del genoma y análisis comparativo del microorganismo industrial Streptomyces avermitilis" . Biotecnología de la naturaleza . 21 (5): 526–31. doi : 10.1038 / nbt820 . PMID 12692562 . 
  45. ^ Leto, O'Keefe (1988). "Identificación de citocromos P-450 constitutivos e inducibles por herbicidas en Streptomyces griseolus". Arch Microbiol . 149 (5): 406-12. doi : 10.1007 / BF00425579 . S2CID 35526991 . 
  46. ^ Moody SC, Zhao B, Lei L, Nelson DR, Mullins JG, Waterman MR, Kelly SL, Cordero DC (mayo de 2012). "Investigando la conservación de la vía biosintética de albaflavenona y la bifuncionalidad CYP170 en estreptomicetos" . La revista FEBS . 279 (9): 1640–9. doi : 10.1111 / j.1742-4658.2011.08447.x . PMID 22151149 . 
  47. ^ Moody SC, Loveridge EJ (diciembre de 2014). "CYP105-diversas estructuras, funciones y roles en una intrigante familia de enzimas en Streptomyces" . Revista de microbiología aplicada . 117 (6): 1549–63. doi : 10.1111 / jam.12662 . PMC 4265290 . PMID 25294646 .  
  48. ^ Narhi LO, Fulco AJ (junio de 1986). "Caracterización de una monooxigenasa del citocromo P-450 de 119.000 dalton catalíticamente autosuficiente inducida por barbitúricos en Bacillus megaterium" . La Revista de Química Biológica . 261 (16): 7160–9. PMID 3086309 . Archivado desde el original el 18 de octubre de 2019 . Consultado el 21 de octubre de 2005 . 
  49. ^ Girvan HM, Waltham TN, Neeli R, Collins HF, McLean KJ, Scrutton NS, Leys D, Munro AW (diciembre de 2006). "Flavocitocromo P450 BM3 y el origen de especies de fusión CYP102". Transacciones de la sociedad bioquímica . 34 (Parte 6): 1173–7. doi : 10.1042 / BST0341173 . PMID 17073779 . 
  50. ^ Wright RL, Harris K, Solow B, White RH, Kennelly PJ (abril de 1996). "Clonación de un citocromo P450 potencial del archaeon Sulfolobus solfataricus" . Cartas FEBS . 384 (3): 235–9. doi : 10.1016 / 0014-5793 (96) 00322-5 . PMID 8617361 . S2CID 19579406 .  
  51. ^ Vanden Bossche H, Marichal P, Gorrens J, Coene MC (septiembre de 1990). "Base bioquímica de la actividad y selectividad de los fármacos antimicóticos orales". Revista británica de práctica clínica. Suplemento . 71 : 41–6. PMID 2091733 . 
  52. Schuler MA, Werck-Reichhart D (1 de enero de 2003). "Genómica funcional de P450s". Revisión anual de biología vegetal . 54 (1): 629–67. doi : 10.1146 / annurev.arplant.54.031902.134840 . PMID 14503006 . 
  53. ^ Mizutani M, Sato F (marzo de 2011). "Reacciones inusuales de P450 en el metabolismo secundario de la planta". Archivos de Bioquímica y Biofísica . Mecanismos de catálisis P450. 507 (1): 194-203. doi : 10.1016 / j.abb.2010.09.026 . PMID 20920462 . 
  54. ^ Chefson A, Auclair K (octubre de 2006). "Progreso hacia el uso más fácil de las enzimas P450". Biosistemas moleculares . 2 (10): 462–9. doi : 10.1039 / b607001a . PMID 17216026 . 
  55. ^ Chefson A, Zhao J, Auclair K (junio de 2006). "El reemplazo de cofactores naturales por donantes de peróxido de hidrógeno seleccionados o peróxidos orgánicos da como resultado una actividad mejorada para CYP3A4 y CYP2D6". ChemBioChem . 7 (6): 916–9. doi : 10.1002 / cbic.200600006 . PMID 16671126 . S2CID 39329433 .  
  56. ^ Chefson A, Auclair K (julio de 2007). "Actividad de CYP3A4 en presencia de codisolventes orgánicos, líquidos iónicos o disolventes orgánicos inmiscibles en agua". ChemBioChem . 8 (10): 1189–97. doi : 10.1002 / cbic.200700128 . PMID 17526062 . S2CID 11845235 .  
  57. ^ Petros WP, Younis IR, Ford JN, Weed SA (octubre de 2012). "Efectos del tabaquismo y la nicotina en el tratamiento del cáncer" . Farmacoterapia . 32 (10): 920–31. doi : 10.1002 / j.1875-9114.2012.01117 . PMC 3499669 . PMID 23033231 .  

Lectura adicional [ editar ]

  • Gelboin HV, Krausz K (marzo de 2006). "Anticuerpos monoclonales y citocromo P450 multifuncional: metabolismo de fármacos como paradigma". Revista de farmacología clínica . 46 (3): 353–72. doi : 10.1177 / 0091270005285200 . PMID  16490812 .
  • Gelboin HV, Krausz KW, Gonzalez FJ, Yang TJ (noviembre de 1999). "Anticuerpos monoclonales inhibidores de las enzimas del citocromo P450 humano: una nueva vía para el descubrimiento de fármacos" (PDF) . Tendencias en Ciencias Farmacológicas . 20 (11): 432–8. doi : 10.1016 / S0165-6147 (99) 01382-6 . PMID  10542439 .
  • "Metabolismo carcinógeno y fármaco mediado por el citocromo P450 mediante anticuerpos monoclonales" . home.ccr.cancer.gov . Consultado el 2 de abril de 2018 .
  • Krausz KW, Goldfarb I, Buters JT, Yang TJ, Gonzalez FJ, Gelboin HV (noviembre de 2001). "Anticuerpos monoclonales específicos e inhibidores de los citocromos humanos P450 2C8, 2C9 y 2C19" . Metabolismo y disposición de fármacos . 29 (11): 1410-23. PMID  11602516 .
  • González FJ, Gelboin HV (1994). "Papel de los citocromos humanos P450 en la activación metabólica de carcinógenos químicos y toxinas". Reseñas de metabolismo de fármacos . 26 (1–2): 165–83. doi : 10.3109 / 03602539409029789 . PMID  8082563 .

Enlaces externos [ editar ]

  • Sigaroudi A, Vollbrecht H (2019). "tabla de interacción farmacocinética" . Sigaroudi y Vollbrecht.
  • Preissner S (2010). "Base de datos del citocromo P450" . Investigación de ácidos nucleicos.
  • Degtyarenko K (9 de enero de 2009). "Directorio de sistemas que contienen P450" . Centro Internacional de Ingeniería Genética y Biotecnología . Archivado desde el original el 16 de julio de 2016 . Consultado el 10 de febrero de 2009 .
  • Estabrook RW (diciembre de 2003). "Una pasión por P450s (recuerdos de la historia temprana de la investigación sobre el citocromo P450)". Metabolismo y disposición de fármacos . 31 (12): 1461–73. doi : 10.1124 / dmd.31.12.1461 . PMID  14625342 .
  • Flockhart DA (2007). "Tabla de interacción farmacológica del citocromo P450" . Universidad de Indiana-Universidad Purdue de Indianápolis . Consultado el 10 de febrero de 2009 .
  • Sim SC (4 de septiembre de 2008). "Comité de nomenclatura de alelos del citocromo P450 humano (CYP)" . Karolinska Institutet . Consultado el 10 de febrero de 2009 .