Los ARN pequeños codificados por el virus de Epstein-Barr (EBER) son ARN pequeños no codificantes localizados en el núcleo de células humanas infectadas con el virus de Epstein-Barr (EBV). Descubiertos por primera vez en 1981, los EBER son los ARN más abundantes presentes en las células infectadas. [1] Los EBER interactúan con varias proteínas del huésped para formar complejos de ribonucleoproteína (RNP). Aunque una función precisa para las EBER sigue siendo difícil de alcanzar, se proponen funciones en la transformación y la oncogénesis .
EBER1 | |
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Identificadores | |
Símbolo | EBER1 |
Rfam | RF01789 |
Otros datos | |
Tipo de ARN | Gene |
Dominio (s) | Virus de Epstein Barr |
Estructuras PDB | PDBe |
Fondo
EBER1 y EBER2 son cortos, de 167 y 172 nucleótidos de longitud, respectivamente, ARN no codificantes enriquecidos en núcleos . Estos dos ARN son transcritos por la ARN polimerasa III del huésped durante la infección latente del VEB. [2] [3]
Los EBER 1 y 2 se pueden eliminar del genoma viral sin cambios fenotípicos notables , aunque esto nunca se ha encontrado eliminado en la naturaleza. [2] La expresión de EBER sola puede inducir tumores en ratones inmunodeficientes combinados graves . [4] [5]
EBER1
EBER1 se asocia con la proteína ribosómica humana L22 [6] y hace que esta proteína se mueva del nucleolo al nucleoplasma . [7] EBER1 también interactúa específicamente con al menos tres hnRNP de host (A1, A2 / B1 y D / AUF1 ). [8]
EBER2
De manera similar a EBER1, EBER2 se expresa muy altamente en células infectadas de forma latente. A diferencia de EBER1, la secuencia de EBER2 está menos conservada en herpesvirus relacionados (~ 50% de conservación). Sin embargo, la estructura secundaria de EBER2 está muy conservada (ver Figura 1). Solo se sabe que EBER2 se une a proteínas celulares (específicamente, el dominio La ) en su tramo terminal de uridinas repetidas ; sin embargo, se cree que las otras características de EBER2, en particular sus dos conservadas largo y altamente tallo de bucles , también pueden servir como sitios para las proteínas aún desconocidos de unión. [9]
Referencias
- ^ Lerner MR, Andrews NC, Miller G, Steitz JA (febrero de 1981). "Dos pequeños ARN codificados por el virus de Epstein-Barr y complejados con proteínas son precipitados por anticuerpos de pacientes con lupus eritematoso sistémico" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 78 (2): 805–809. doi : 10.1073 / pnas.78.2.805 . PMC 319891 . PMID 6262773 .
- ^ a b Conrad NK, Fok V, Cazalla D, Borah S, Steitz JA (2006). "El desafío de los snRNPs virales" . Simposios de Cold Spring Harbor sobre biología cuantitativa . 71 : 377–384. doi : 10.1101 / sqb.2006.71.057 . PMID 17381320 .
- ^ Moss WN, Lee N, Pimienta G, Steitz JA (2014). "Familias de ARN en el virus de Epstein-Barr" . Biología del ARN . 11 (1): 10–17. doi : 10.4161 / rna.27488 . PMC 3929418 . PMID 24441309 .
- ^ Komano J, Maruo S, Kurozumi K, Oda T, Takada K (diciembre de 1999). "Papel oncogénico de los ARN codificados por el virus de Epstein-Barr en la línea celular de linfoma de Burkitt Akata" . Revista de Virología . 73 (12): 9827–9831. PMC 113031 . PMID 10559294 .
- ^ Yamamoto N, Takizawa T, Iwanaga Y, Shimizu N, Yamamoto N (noviembre de 2000). "Transformación maligna de la línea celular de linfoma B BJAB por ARN pequeños codificados por el virus de Epstein-Barr". Cartas FEBS . 484 (2): 153-158. doi : 10.1016 / S0014-5793 (00) 02145-1 . PMID 11068051 .
- ^ Fok V, Mitton-Fry RM, Grech A, Steitz JA (mayo de 2006). "Múltiples dominios de EBER 1, un ARN no codificante del virus de Epstein-Barr, reclutan proteína ribosomal humana L22" . ARN . 12 (5): 872–882. doi : 10.1261 / rna.2339606 . PMC 1440895 . PMID 16556938 .
- ^ Toczyski DP, Matera AG, Ward DC, Steitz JA (abril de 1994). "El pequeño RNA EBER1 del virus de Epstein-Barr (EBV) se une y relocaliza la proteína ribosomal L22 en linfocitos B humanos infectados con EBV" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 91 (8): 3463–3467. doi : 10.1073 / pnas.91.8.3463 . PMC 43597 . PMID 8159770 .
- ^ Lee N, Pimienta G, Steitz JA (noviembre de 2012). "AUF1 / hnRNP D es una nueva proteína asociada del ARN no codificante EBER1 del virus Epstein-Barr" . ARN . 18 (11): 2073–2082. doi : 10.1261 / rna.034900.112 . PMC 3479396 . PMID 23012480 .
- ^ Moss WN, Lee N, Pimienta G, Steitz JA (20 de diciembre de 2013). "Familias de ARN en el virus de Epstein-Barr" . Biología del ARN . 11 (1): 10–17. doi : 10.4161 / rna.27488 . PMC 3929418 . PMID 24441309 .
enlaces externos
- Página de ARN nucleolar pequeño del virus del herpes humano 1 en Rfam
- Página de EBER1 en Rfam
- Página para v-snoRNA1 en Rfam
- Página de IRES_EBNA en Rfam
- ARN de secuencia intrónica estable del virus de Epstein-Barr