Los ARN de Rsa son ARN no codificantes que se encuentran en la bacteria Staphylococcus aureus . El nombre compartido proviene de su descubrimiento y no implica homología . Las exploraciones bioinformáticas identificaron las 16 familias de ARN Rsa denominadas RsaA-K y RsaOA-OG. [1] [2] Otros, RsaOH-OX, se encontraron gracias a un enfoque RNomic. [3] Aunque los ARN mostraron patrones de expresión variables, se demostró que muchos de los ARN recién descubiertos eran independientes de Hfq y la mayoría portaba un motivo rico en C (UCCC). [1]
RsaA
Reprime la traducción del regulador transcripcional MgrA al unirse a su ARNm, mejora la formación de biopelículas y disminuye la virulencia bacteriana. [4] Otros ARNm: incluidas las enzimas similares a SsaA involucradas en el metabolismo del peptidoglicano y la proteína FLIPr antiinflamatoria secretada se validaron como objetivos directos de RsaA. [5]
RsaE
RsaE se encuentra en otros miembros del género Staphylococcus como Staphylococcus epidermidis y Staphylococcus saprophyticus y es el único Rsa RNA que se encuentra fuera de este género, en Macrococcus caseolyticus y Bacillus . En Bacillus subtilis , RsaE se había identificado previamente como ncr22. [8] [9] RsaE también se encuentra consistentemente aguas abajo de PepF que codifica la oligoendopeptidasa F. La función de RsaE se descubrió mediante análisis de desactivación genética y sobreexpresión de genes; se encontró que regula la expresión de varias enzimas involucradas en el metabolismo a través de la unión antisentido de su ARNm . [1] [3]
Se demostró que la RsaE está regulada por la presencia de óxido nítrico (NO). En Bacillus subtilis controla la expresión de genes con funciones relacionadas con el estrés oxidativo y las reacciones de oxidación-reducción y pasó a denominarse RoxS (relacionado con el estrés oxidativo). [10]
RsaF
En S.aureus especies Rsaf se encuentra en la misma región intergénica como RsaE y solapamientos con extremo 3 'del RsaE en aproximadamente 20 pb. A diferencia de RsaE, RsaF y su gen corriente arriba solo se han identificado en especies de S. aureus . [1]
RsaK
RsaK se encuentra en la secuencia líder del ARNm de glcA que codifica una enzima involucrada en el sistema de fosfotransferasa específico de glucosa . RsaK también contiene un sistema antiterminador ribonucleico conservado , como lo reconoce la proteína GclT. [11]
RsaI
Se cree que RsaOG [2] también renombrado como RsaI [1] afina la regulación de la toxina o los mecanismos de invasión en S. aureus a través de mecanismos de acción trans . Su estructura secundaria contiene un pseudonudo formado entre dos secuencias desaparecidas altamente conservadas. [6]
Patrones de expresión
Se encontró que RsaD, EH y yo estaban altamente expresados en S. aureus . Los niveles de expresión de otros ARN de Rsa variaron en diversas condiciones ambientales, por ejemplo, RsaC se indujo mediante choque frío y RsaA se indujo en respuesta al estrés osmótico . [1] [2] [3]
RsaE y Rsaf genes se solapan en S. aureus especies, pero parecen tener patrones de expresión opuestos. [1] Se propone la interferencia transcripcional debido a una superposición entre un motivo de reconocimiento σ A y un sitio de unión potencial σ B como un mecanismo que causa la expresión diferencial de las dos transcripciones [1] [12]
Ver también
- RsaOG
Referencias
- ↑ a b c d e f g h Geissmann T, Chevalier C, Cros MJ, Boisset S, Fechter P, Noirot C, Schrenzel J, François P, Vandenesch F, Gaspin C, Romby P (noviembre de 2009). "Una búsqueda de pequeños ARN no codificantes en Staphylococcus aureus revela un motivo de secuencia conservada para la regulación" . Investigación de ácidos nucleicos . 37 (21): 7239–7257. doi : 10.1093 / nar / gkp668 . PMC 2790875 . PMID 19786493 .
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