Una exoribonucleasa es una exonucleasa ribonucleasa , que son enzimas que degradan el ARN eliminando los nucleótidos terminales del extremo 5 ' o del extremo 3' de la molécula de ARN. Las enzimas que eliminan los nucleótidos del extremo 5 'se denominan exoribonucleasas 5'-3' , y las enzimas que eliminan los nucleótidos del extremo 3 'se denominan exoribonucleasas 3'-5' .
Las exoribonucleasas pueden usar agua para escindir el enlace nucleótido-nucleótido (que se llama actividad hidrolítica) o fosfato inorgánico (que se llama actividad fosforolítica). Las exoribonucleasas hidrolíticas se clasifican en el número CE 3.1 y las exoribonucleasas fosforolíticas en el número CE 2.7.7. Como las enzimas fosforolíticas usan fosfato inorgánico para escindir enlaces, liberan difosfatos de nucleótidos , mientras que las enzimas hidrolíticas (que usan agua) liberan monosfosfatos de nucleótidos .
Las exoribonucleasas existen en todos los reinos de la vida, las bacterias , las arqueas y los eucariotas . Las exoribonucleasas participan en la degradación de muchas especies de ARN diferentes, incluido el ARN mensajero , el ARN de transferencia , el ARN ribosómico y el miARN . Las exoribonucleasas pueden ser proteínas únicas (como RNasa D o RNasa PH ) pero también pueden ser complejos de múltiples proteínas, como el complejo de exosomas (en el que están representadas cuatro de las principales familias de exoribonucleasas).
Familias principales
Familia | Miembros de ejemplo | Distribución | Actividad catalítica |
---|---|---|---|
RNR | RNasa R | La mayoría de las bacterias, todos los eucariotas. | Hidrolítico 3'-5 ' |
ARNasa II | |||
Rrp44 | |||
DEDD | ARNasa D | Ciertas bacterias, todas eucariotas | Hidrolítico 3'-5 ' |
RNasa T | |||
PM / Scl-100 | |||
Oligoribonucleasa | |||
RBN | RNasa BN | Ciertas bacterias | Hidrolítico 3'-5 ' |
PDX | PNPase | Todos los reinos | 3'-5 'fosforolítico |
PM / Scl-75 | |||
RNasa PH | |||
PVP4 | Rrp4 | Todos los eucariotas, la mayoría de las arqueas | Hidrolítico 3'-5 ' |
5PX | Exoribonucleasa I | Todos los eucariotas | Hidrolítico 5'-3 ' |
Exoribonucleasa II |
Ver también
Referencias
- Zuo Y; Deutscher MP. (2001). "Superfamilias de exoribonucleasas: análisis estructural y distribución filogenética" . Ácidos nucleicos Res . 29 (5): 1017–26. doi : 10.1093 / nar / 29.5.1017 . PMC 56904 . PMID 11222749 .
enlaces externos
- Exoribonucleasas en los encabezados de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .