N-terminal
El extremo N-terminal (también conocido como el amino-terminal , NH 2 -terminal , N-terminal final o amina-terminal ) es el inicio de una proteína o polipéptido se refiere a la libre amina grupo (-NH 2 ) situado en el extremo de un polipéptido. Dentro de un péptido, el grupo amina está unido al grupo carboxílico de otro aminoácido convirtiéndolo en una cadena. Eso deja un grupo carboxílico libre en un extremo del péptido llamado C-terminal y un grupo amina libre en el otro extremo llamado N-terminal. Por convención, las secuencias de péptidos se escriben en el extremo N paraC-terminal , de izquierda a derecha (en sistemas de escritura LTR ). [1] Esto correlaciona la dirección de traducción con la dirección del texto (porque cuando una proteína se traduce del ARN mensajero , se crea desde el extremo N al extremo C, los aminoácidos se agregan al extremo carboxilo).
Cada aminoácido tiene un grupo amina y un grupo carboxílico . Los aminoácidos se unen entre sí mediante enlaces peptídicos que se forman a través de una reacción de deshidratación que une el grupo carboxilo de un aminoácido al grupo amina del siguiente de una manera de cabeza a cola para formar una cadena polipeptídica . La cadena tiene dos extremos: un grupo amina, el N-terminal, y un grupo carboxilo no unido, el C-terminal . [2]
Cuando una proteína se traduce del ARN mensajero , se crea desde el extremo N al extremo C. El extremo amino de un aminoácido (en un ARNt cargado ) durante la etapa de elongación de la traducción, se une al extremo carboxilo de la cadena en crecimiento. Dado que el codón de inicio del código genético codifica el aminoácido metionina , la mayoría de las secuencias de proteínas comienzan con una metionina (o, en bacterias, mitocondrias y cloroplastos , la versión modificada N -formilmetionina , fMet). Sin embargo, algunas proteínas se modifican postraduccionalmente, por ejemplo, por escisión de un precursor de proteína y, por lo tanto, puede tener diferentes aminoácidos en su extremo N-terminal.
El extremo N es la primera parte de la proteína que sale del ribosoma durante la biosíntesis de proteínas . A menudo contiene secuencias de péptidos señal , " códigos postales intracelulares " que dirigen la entrega de la proteína al orgánulo adecuado . El péptido señal se elimina típicamente en el destino mediante una peptidasa señal . El aminoácido N-terminal de una proteína es un determinante importante de su vida media (probabilidad de degradación). A esto se le llama la regla N-end .
El péptido señal N-terminal es reconocido por la partícula de reconocimiento de señal (SRP) y da como resultado que la proteína se dirija a la vía secretora . En las células eucariotas , estas proteínas se sintetizan en el retículo endoplásmico rugoso . En las células procariotas , las proteínas se exportan a través de la membrana celular . En los cloroplastos , los péptidos señal dirigen las proteínas a los tilacoides .
El péptido de direccionamiento mitocondrial N-terminal (mtTP) permite que la proteína se importe a la mitocondria .
