Reloj molecular

Técnica para deducir el momento en la prehistoria cuando dos o más formas de vida divergieron

No confundir con reloj químico .

Parte de una serie sobre
Biología evolucionaria
Pinzones de Darwin por John Gould
Temas clave Introducción a la evolución Descendencia común Evidencia
Procesos y resultados Genética de poblaciones Variación Diversidad Mutación Seleccion natural Adaptación Polimorfismo Deriva genética Flujo de genes Especiación Radiación adaptativa Cooperación Coevolución Coextincion Divergencia Convergencia Evolución paralela Extinción
Historia Natural Origen de la vida Historia de vida Cronología de la evolución Evolución humana Filogenia La biodiversidad Biogeografia Clasificación Taxonomía evolutiva Cladística Fósil de transición Evento de extinción
Historia de la teoría evolutiva Descripción general Renacimiento Antes de darwin Darwin Origen de las especies Antes de la síntesis Síntesis moderna Evolución molecular Evo-devo La investigación actual Historia de la especiación Historia de la paleontología ( línea de tiempo )
Campos y aplicaciones Aplicaciones de la evolución Criminología biosocial Genética ecológica Estética evolutiva Antropología evolutiva Computación evolutiva Ecología evolutiva Economía evolutiva Epistemología evolutiva Ética evolutiva Teoría de juegos evolutivos Lingüística evolutiva Medicina evolutiva Neurociencia evolutiva Fisiología evolutiva Psicología Evolutiva Evolución experimental Filogenética Paleontología Crianza selectiva Experimentos de especiación Sociobiología Sistemática Darwinismo universal
Implicaciones sociales La evolución como hecho y teoría Efectos sociales Controversia creación-evolución Objeciones a la evolución Nivel de apoyo
Portal de biología evolutiva  Categoría Temas relacionados
v t mi

El reloj molecular es un término figurativo para una técnica que usa la tasa de mutación de biomoléculas para deducir el momento en la prehistoria en que dos o más formas de vida divergieron . Los datos biomoleculares usados ​​para tales cálculos son generalmente secuencias de nucleótidos para ADN , ARN o secuencias de aminoácidos para proteínas . Los puntos de referencia para determinar la tasa de mutación son a menudo fechas fósiles o arqueológicas. El reloj molecular se probó por primera vez en 1962 en las variantes de la proteína de hemoglobina de varios animales y se usa comúnmente enevolución molecular para estimar tiempos de especiación o radiación . A veces se le llama reloj genético o reloj evolutivo .

Descubrimiento temprano y equidistancia genética

La noción de la existencia de un llamado "reloj molecular" se atribuyó por primera vez a Émile Zuckerkandl y Linus Pauling , quienes, en 1962, notaron que el número de diferencias de aminoácidos en la hemoglobina entre diferentes linajes cambia aproximadamente de forma lineal con el tiempo, según se estima a partir de Evidencia fósil. ^[1] Generalizaron esta observación para afirmar que la tasa de cambio evolutivo de cualquier proteína específica era aproximadamente constante en el tiempo y en diferentes linajes (conocida como la hipótesis del reloj molecular ).

El fenómeno de la equidistancia genética fue observado por primera vez en 1963 por Emanuel Margoliash , quien escribió: "Parece que el número de diferencias de residuos entre el citocromo c de dos especies cualesquiera está condicionado principalmente por el tiempo transcurrido desde las líneas de evolución que condujeron a estas dos especies originalmente. divergentes. Si esto es correcto, el citocromo c de todos los mamíferos debería ser igualmente diferente del citocromo c de todas las aves. Dado que los peces divergen del tallo principal de la evolución de los vertebrados antes que las aves o los mamíferos, el citocromo c tanto de los mamíferos como de las aves debe ser igualmente diferente del citocromo c de los peces. De manera similar, todo el citocromo c de los vertebrados debe ser igualmente diferente de la proteína de levadura ". ^[2]Por ejemplo, la diferencia entre el citocromo c de una carpa y una rana, tortuga, pollo, conejo y caballo es muy constante del 13% al 14%. De manera similar, la diferencia entre el citocromo c de una bacteria y la levadura, el trigo, la polilla, el atún, la paloma y el caballo oscila entre el 64% y el 69%. Junto con el trabajo de Emile Zuckerkandl y Linus Pauling, el resultado de la equidistancia genética condujo directamente a la postulación formal de la hipótesis del reloj molecular a principios de la década de 1960. ^[3]

De manera similar, Vincent Sarich y Allan Wilson en 1967 demostraron que las diferencias moleculares entre los primates modernos en las proteínas de albúmina mostraban que se habían producido tasas de cambio aproximadamente constantes en todos los linajes que evaluaron. ^[4]La lógica básica de su análisis implicaba reconocer que si el linaje de una especie había evolucionado más rápidamente que el linaje de una especie hermana desde su ancestro común, entonces las diferencias moleculares entre una especie exógena (relacionada más lejanamente) y la especie de evolución más rápida deberían ser mayores ( ya que se habrían acumulado más cambios moleculares en ese linaje) que las diferencias moleculares entre las especies exóticas y las especies de evolución más lenta. Este método se conoce como prueba de tasa relativa . El artículo de Sarich y Wilson informó, por ejemplo, que las reacciones cruzadas inmunológicas de albúmina de humanos ( Homo sapiens ) y chimpancés ( Pan troglodytes ) sugirieron que eran casi igualmente diferentes de Ceboidea(Mono del Nuevo Mundo) (dentro del error experimental). Esto significaba que ambos habían acumulado cambios aproximadamente iguales en la albúmina desde su ancestro común compartido. Este patrón también se encontró para todas las comparaciones de primates que probaron. Cuando se calibró con los pocos puntos de ramificación fósiles bien documentados (como ningún fósil de primates de aspecto moderno encontrado antes del límite KT ), esto llevó a Sarich y Wilson a argumentar que la divergencia entre humanos y chimpancés probablemente ocurrió hace solo ~ 4-6 millones de años . ^[5]

Relación con la teoría neutral

La observación de una tasa de cambio molecular similar a un reloj fue originalmente puramente fenomenológica . Más tarde, el trabajo de Motoo Kimura ^[6] desarrolló la teoría neutral de la evolución molecular , que predijo un reloj molecular. Sea N individuos, y para mantener este cálculo simple, permita que los individuos sean haploides (es decir, tengan una copia de cada gen). Sea la tasa de mutaciones neutrales (es decir, mutaciones sin efecto sobre la aptitud ) en un nuevo individuo . La probabilidad de que esta nueva mutación sea fija.${\displaystyle \mu }$en la población es entonces 1 / N, ya que cada copia del gen es tan buena como cualquier otra. Cada generación, cada individuo puede tener nuevas mutaciones, por lo que hay N nuevas mutaciones neutrales en la población en su conjunto. Eso significa que en cada generación, se fijarán nuevas mutaciones neutrales. Si la mayoría de los cambios observados durante la evolución molecular son neutrales, las fijaciones en una población se acumularán a una velocidad de reloj que es igual a la velocidad de mutaciones neutrales en un individuo.${\displaystyle \mu }$${\displaystyle \mu }$

Calibración

El reloj molecular por sí solo solo puede decir que un período de tiempo es dos veces más largo que otro: no puede asignar fechas concretas. Para la filogenética viral y los estudios de ADN antiguo , dos áreas de la biología evolutiva en las que es posible muestrear secuencias en una escala de tiempo evolutiva, las fechas de las muestras intermedias se pueden utilizar para calibrar con mayor precisión el reloj molecular. Sin embargo, la mayoría de las filogenias requieren que el reloj molecular se calibre contra evidencia independiente sobre fechas, como el registro fósil . ^[7] Hay dos métodos generales para calibrar el reloj molecular utilizando datos fósiles: calibración de nodo y calibración de punta. ^[8]

Calibración de nodo

A veces denominada datación de nodos, la calibración de nodos es un método para la calibración de filogenia que se realiza colocando restricciones fósiles en los nodos. Un fósil de calibración de nodos es el representante más antiguo descubierto de ese clado , que se utiliza para restringir su edad mínima. Debido a la naturaleza fragmentaria del registro fósil, es probable que nunca se encuentre el verdadero ancestro común más reciente de un clado. ^[8] Para tener en cuenta esto en los análisis de calibración de nodos, se debe estimar una edad máxima de clado. Determinar la edad máxima del clado es un desafío porque se basa en evidencia negativa: la ausencia de fósiles más antiguos en ese clado. Hay varios métodos para derivar la edad máxima del clado utilizando modelos de nacimiento-muerte, fósilesanálisis de distribución estratigráfica o controles tafonómicos . ^[9] Alternativamente, en lugar de un máximo y un mínimo, se puede establecer una probabilidad previa del tiempo de divergencia y utilizarla para calibrar el reloj. Hay varias distribuciones de probabilidad anteriores incluyendo normales , lognormal , exponencial , gamma , uniforme , etc.) que puede ser utilizado para expresar la probabilidad de la verdadera edad de divergencia con respecto a la edad del fósil; ^[10] sin embargo, existen muy pocos métodos para estimar empíricamente la forma y los parámetros de la distribución de probabilidad. ^[11] La ubicación de los nodos de calibración en el árbol informa la ubicación de los nodos no restringidos, lo que proporciona estimaciones de fechas de divergencia en la filogenia. Los métodos históricos de calibración del reloj solo podían hacer uso de una única restricción fósil (suavizado de velocidad no paramétrico), ^[12] mientras que los análisis modernos ( BEAST ^[13] y r8s ^[14] ) permiten el uso de múltiples fósiles para calibrar la reloj. Los estudios de simulación han demostrado que aumentar el número de restricciones fósiles aumenta la precisión de la estimación del tiempo de divergencia. ^[15]

Calibración de la punta

A veces denominada datación de la punta , la calibración de la punta es un método de calibración de reloj molecular en el que los fósiles se tratan como taxones y se colocan en las puntas del árbol. Esto se logra mediante la creación de una matriz que incluye un conjunto de datos moleculares para los taxones existentes junto con un conjunto de datos morfológicos para los taxones extintos y existentes. ^[9] A diferencia de la calibración de nodos, este método reconstruye la topología del árbol y coloca los fósiles simultáneamente. Los modelos moleculares y morfológicos trabajan juntos simultáneamente, lo que permite que la morfología informe la ubicación de los fósiles. ^[8]La calibración de la punta hace uso de todos los taxones fósiles relevantes durante la calibración del reloj, en lugar de depender solo del fósil más antiguo de cada clado. Este método no se basa en la interpretación de evidencia negativa para inferir edades máximas de clado. ^[9]

Evidencia total datada

Este enfoque de la calibración de la punta va un paso más allá al estimar simultáneamente la ubicación de los fósiles, la topología y la escala de tiempo evolutiva. En este método, la edad de un fósil puede informar su posición filogenética además de su morfología. Al permitir que todos los aspectos de la reconstrucción de árboles ocurran simultáneamente, se reduce el riesgo de resultados sesgados. ^[8] Este enfoque se ha mejorado al combinarlo con diferentes modelos. Un método actual de calibración del reloj molecular es la datación de evidencia total emparejada con el modelo fosilizado de nacimiento-muerte (FBD) y un modelo de evolución morfológica. ^[16] El modelo FBD es novedoso ya que permite "antepasados ​​muestreados", que son taxones fósiles que son el antepasado directo de un taxón o linaje vivo.. Esto permite que los fósiles se coloquen en una rama sobre un organismo existente, en lugar de limitarse a las puntas. ^[17]

Métodos

Los métodos bayesianos pueden proporcionar estimaciones más apropiadas de los tiempos de divergencia, especialmente si se emplean grandes conjuntos de datos, como los obtenidos por la filogenómica . ^[18]

Tasa no constante de reloj molecular

A veces, solo se puede estimar una única fecha de divergencia a partir de los fósiles, y todas las demás fechas se infieren de eso. Otros conjuntos de especies tienen abundantes fósiles disponibles, lo que permite probar la hipótesis de tasas de divergencia constantes. Las secuencias de ADN que experimentaron niveles bajos de selección negativa mostraron tasas de divergencia del 0,7% al 0,8% por  Myr en bacterias, mamíferos, invertebrados y plantas. ^[19] En el mismo estudio, las regiones genómicas que experimentaron una selección muy alta negativa o purificadora (que codifica el ARNr) fueron considerablemente más lentas (1% por 50 Myr).

Además de tal variación en la tasa con la posición genómica, desde principios de la década de 1990, la variación entre taxones también ha demostrado ser un terreno fértil para la investigación, ^[20] incluso durante períodos comparativamente cortos de tiempo evolutivo (por ejemplo, sinsontes ^[21] ). Las aves marinas de nariz tubular tienen relojes moleculares que, en promedio, funcionan a la mitad de la velocidad de muchas otras aves, ^[22] posiblemente debido a los largos tiempos de generación , y muchas tortugas tienen un reloj molecular que funciona a un octavo de la velocidad que tienen los mamíferos pequeños, o aún más lento. ^[23] También es probable que los efectos del pequeño tamaño de la población confundan los análisis del reloj molecular. Investigadores como Francisco J. Ayalahan desafiado más fundamentalmente la hipótesis del reloj molecular. ^{[24] [25] [26]} Según el estudio de Ayala de 1999, cinco factores se combinan para limitar la aplicación de modelos de reloj molecular:

• Tiempos de generación cambiantes (si la tasa de nuevas mutaciones depende, al menos en parte, del número de generaciones más que del número de años)
• Tamaño de la población (la deriva genética es más fuerte en poblaciones pequeñas, por lo que más mutaciones son efectivamente neutrales)
• Diferencias específicas de especies (debido a diferentes metabolismos, ecología, historia evolutiva, ...)
• Cambio en la función de la proteína estudiada (se puede evitar en especies estrechamente relacionadas utilizando secuencias de ADN no codificantes o enfatizando mutaciones silenciosas )
• Cambios en la intensidad de la selección natural.

Los bambúes leñosos (tribus Arundinarieae y Bambuseae ) tienen tiempos de generación prolongados y tasas de mutación más bajas, expresadas por ramas cortas en el árbol filogenético , que los bambúes herbáceos de rápida evolución ( Olyreae ).

Los usuarios de relojes moleculares han desarrollado soluciones alternativas utilizando una serie de enfoques estadísticos que incluyen técnicas de máxima verosimilitud y modelos bayesianos posteriores . En particular, se han propuesto modelos que toman en cuenta la variación de la tasa entre linajes para obtener mejores estimaciones de los tiempos de divergencia. Estos modelos se denominan relojes moleculares relajados ^[27] porque representan una posición intermedia entre la hipótesis del reloj molecular "estricto" y el modelo de muchas velocidades de Joseph Felsenstein ^[28] y son posibles gracias a MCMCtécnicas que exploran una gama ponderada de topologías de árboles y estiman simultáneamente los parámetros del modelo de sustitución elegido. Debe recordarse que las fechas de divergencia inferidas usando un reloj molecular se basan en inferencias estadísticas y no en evidencia directa .

El reloj molecular se enfrenta a desafíos particulares en escalas de tiempo muy cortas y muy largas. En escalas de tiempo largas, el problema es la saturación . Cuando ha pasado suficiente tiempo, muchos sitios han sufrido más de un cambio, pero es imposible detectar más de uno. Esto significa que el número observado de cambios ya no es lineal con el tiempo, sino que se aplana. Incluso a distancias genéticas intermedias, con datos filogenéticos todavía suficientes para estimar la topología, la señal para la escala general del árbol puede ser débil en modelos de verosimilitud complejos, lo que lleva a estimaciones de reloj molecular altamente inciertas. ^[29]

En escalas de tiempo muy cortas, muchas diferencias entre muestras no representan la fijación de diferentes secuencias en las diferentes poblaciones. En cambio, representan alelos alternativos que estaban presentes como parte de un polimorfismo en el ancestro común. La inclusión de diferencias que aún no se han fijado conduce a una inflación potencialmente dramática de la tasa aparente del reloj molecular en escalas de tiempo muy cortas. ^{[30] [31]}

Usos

La técnica del reloj molecular es una herramienta importante en la sistemática molecular , el uso de información genética molecular para determinar la clasificación científica correcta de organismos o para estudiar la variación en las fuerzas selectivas. El conocimiento de la tasa aproximadamente constante de evolución molecular en conjuntos particulares de linajes también facilita la estimación de las fechas de los eventos filogenéticos , incluidos los no documentados por fósiles , como las divergencias entre taxones vivos . En estos casos, especialmente durante largos períodos de tiempo, deben considerarse las limitaciones de la hipótesis del reloj molecular (arriba); tales estimaciones pueden tener una diferencia del 50% o más.

Ver también

• Charles Darwin
• Órdenes genéticas
• Reloj molecular mitocondrial humano
• Eva mitocondrial y Adán cromosómico Y
• Modelos de evolución del ADN
• Evolución molecular
• Teoría neutral de la evolución molecular

Referencias

1. Zuckerkandl, E. y Pauling, LB (1962). "Enfermedad molecular, evolución y heterogeneidad génica" . En Kasha, M .; Pullman, B (eds.). Horizontes de la bioquímica . Academic Press, Nueva York. págs.  189–225 .
2. Margoliash E (octubre de 1963). "Estructura primaria y evolución del citocromo C" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 50 (4): 672–9. Código Bibliográfico : 1963PNAS ... 50..672M . doi : 10.1073 / pnas.50.4.672 . PMC 221244 . PMID 14077496 .  
3. Kumar S (agosto de 2005). "Relojes moleculares: cuatro décadas de evolución". Nat. Rev. Genet . 6 (8): 654–62. doi : 10.1038 / nrg1659 . PMID 16136655 . S2CID 14261833 .  
4. Sarich, VM; Wilson, AC (julio de 1967). "Tasas de evolución de la albúmina en primates" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 58 (1): 142-148. Código Bibliográfico : 1967PNAS ... 58..142S . doi : 10.1073 / pnas.58.1.142 . ISSN 0027-8424 . PMC 335609 . PMID 4962458 .   
5. Sarich, Vincent M .; Wilson, Allan C. (1967). "Escala de tiempo inmunológico para la evolución de los homínidos". Ciencia . 158 (3805): 1200–1203. Código bibliográfico : 1967Sci ... 158.1200S . doi : 10.1126 / science.158.3805.1200 . JSTOR 1722843 . PMID 4964406 . S2CID 7349579 .   
6. Kimura, Motoo (1968). "Tasa evolutiva a nivel molecular". Naturaleza . 217 (5129): 624–626. Código Bibliográfico : 1968Natur.217..624K . doi : 10.1038 / 217624a0 . PMID 5637732 . S2CID 4161261 .  
7. Benton, MJ y Donoghue, PCJ (2007). "Evidencia paleontológica hasta la fecha del Árbol de la Vida" . Biología Molecular y Evolución . 24 (1): 26–53. doi : 10.1093 / molbev / msl150 . PMID 17047029 . 
8. Donoghue, PCJ y Ziheng, Y. (2016). "La evolución de los métodos para establecer escalas de tiempo evolutivas" . Phil. Trans. R. Soc. B . 371 (1): 20160020. doi : 10.1098 / rstb.2016.0020 . PMC 4920342 . PMID 27325838 .  
9. O'Reilly, JE y Mario DR (2015). "Consejos de citas para la estimación del tiempo de divergencia" (PDF) . Tendencias en Genética . 31 (11): 637–650. doi : 10.1016 / j.tig.2015.08.001 . hdl : 1983 / ba7bbcf4-1d51-4b74-a800-9948edb3bbe6 . PMID 26439502 .  
10. Drummond A, Suchard MA, Xie D, Rambaut A (2012). "Filogenética Bayesiana con BEAUti y la BESTIA 1.7" . Biología Molecular y Evolución . 29 (8): 1969-1973. doi : 10.1093 / molbev / mss075 . PMC 3408070 . PMID 22367748 .  
11. Claramunt, S .; Cracraft, J. (2015). "Un nuevo árbol del tiempo revela la huella de la historia de la Tierra en la evolución de las aves modernas" . Sci Adv . 1 (11): e1501005. Código bibliográfico : 2015SciA .... 1E1005C . doi : 10.1126 / sciadv.1501005 . PMC 4730849 . PMID 26824065 .  
12. Sanderson, M. (1997). "Un enfoque no paramétrico para estimar los tiempos de divergencia en ausencia de constancia de velocidad" (PDF) . Biología Molecular y Evolución . 14 (12): 1218-1231. doi : 10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025731 . S2CID 17647010 . Archivado desde el original (PDF) el 21 de abril de 2017.  
13. Drummond A, Suchard MA, Xie D, Rambaut A (2012). "Filogenética Bayesiana con BEAUti y la BESTIA 1.7" . Biología Molecular y Evolución . 29 (8): 1969-1973. doi : 10.1093 / molbev / mss075 . PMC 3408070 . PMID 22367748 .  
14. Sanderson, M. (2003). "r8s: inferir tasas absolutas de evolución molecular y tiempos de divergencia en ausencia de un reloj molecular" (PDF) . Bioinformática . 19 (2): 301-302. doi : 10.1093 / bioinformatics / 19.2.301 . PMID 12538260 .  
15. Zheng Y. y Wiens JJ (2015). "¿Los datos faltantes influyen en la precisión de la estimación del tiempo de divergencia con BEAST?". Filogenética molecular y evolución . 85 (1): 41–49. doi : 10.1016 / j.ympev.2015.02.002 . PMID 25681677 . 
16. Heath, TA y Huelsenbeck, JP (2014). "El proceso de nacimiento-muerte fosilizado para una calibración coherente de las estimaciones de tiempo de divergencia" . PNAS . 111 (29): E2957 – E2966. arXiv : 1310.2968 . Código bibliográfico : 2014PNAS..111E2957H . doi : 10.1073 / pnas.1319091111 . PMC 4115571 . PMID 25009181 .  
17. Gavryushkina, A .; Heath, TA; Ksepka, DT; Stadler, T .; Welch, D. y Drummond, AJ (2016). "La datación bayesiana de evidencia total revela la radiación reciente de la corona de los pingüinos" . Biología sistemática . 66 (1): 1–17. arXiv : 1506.04797 . doi : 10.1093 / sysbio / syw060 . PMC 5410945 . PMID 28173531 .  
18. Dos Reis, M .; Inoue, J .; Hasegawa, M .; Asher, RJ; Donoghue, PCJ; Yang, Z. (2012). "Los conjuntos de datos filogenómicos proporcionan precisión y exactitud en la estimación de la escala de tiempo de la filogenia de los mamíferos placentarios" . Actas de la Royal Society B: Ciencias Biológicas . 279 (1742): 3491–3500. doi : 10.1098 / rspb.2012.0683 . PMC 3396900 . PMID 22628470 .  
19. Ochman H, Wilson AC (1987). "Evolución en bacterias: evidencia de una tasa de sustitución universal en genomas celulares". J Mol Evol . 26 (1–2): 74–86. Código bibliográfico : 1987JMolE..26 ... 74O . doi : 10.1007 / BF02111283 . PMID 3125340 . S2CID 8260277 .  
20. Douzery, EJP, Delsuc, F., Stanhope, MJ y Huchon, D. (2003). "Relojes moleculares locales en tres genes nucleares: tiempos de divergencia para roedores y otros mamíferos, e incompatibilidad entre calibraciones fósiles" (PDF) . Revista de evolución molecular . 57 : S201 – S213. Código bibliográfico : 2003JMolE..57S.201D . CiteSeerX 10.1.1.535.897 . doi : 10.1007 / s00239-003-0028-x . PMID 15008417 . S2CID 23887665 .    
21. Hunt, JS, Bermingham, E. y Ricklefs, RE (2001). "Sistemática molecular y biogeografía de trilladores, temblores y sinsontes de las Antillas (Aves: Mimidae)". Auk . 118 (1): 35–55. doi : 10.1642 / 0004-8038 (2001) 118 [0035: MSABOA] 2.0.CO; 2 . ISSN 0004-8038 . 
22. Rheindt, FE y Austin, J. (2005). "Principales deficiencias analíticas y conceptuales en una revisión taxonómica reciente de los Procellariiformes - Una respuesta a Penhallurick y Wink (2004)" (PDF) . Emu . 105 (2): 181–186. doi : 10.1071 / MU04039 . S2CID 20390465 .  
23. Avise, JC, Bowen, W., Lamb, T., Meylan, AB y Bermingham, E. (1 de mayo de 1992). "Evolución del ADN mitocondrial al ritmo de una tortuga: evidencia de baja variabilidad genética y tasa microevolutiva reducida en las pruebas" . Biología Molecular y Evolución . 9 (3): 457–473. doi : 10.1093 / oxfordjournals.molbev.a040735 . PMID 1584014 . 
24. Ayala, FJ (1999). "Espejismos del reloj molecular" . BioEssays . 21 (1): 71–75. doi : 10.1002 / (SICI) 1521-1878 (199901) 21: 1 <71 :: AID-BIES9> 3.0.CO; 2-B . PMID 10070256 . Archivado desde el original el 16 de diciembre de 2012. 
25. Schwartz, JH y Maresca, B. (2006). "¿Funcionan los relojes moleculares? Una crítica de la sistemática molecular". Teoría biológica . 1 (4): 357–371. CiteSeerX 10.1.1.534.4502 . doi : 10.1162 / biot.2006.1.4.357 . S2CID 28166727 . Resumen de Lay - Science Daily .  
26. Pascual-García, A .; Arenas, M. y Bastolla, U. (2019). "El reloj molecular en la evolución de las estructuras proteicas". Biología sistemática . 68 (6): 987–1002. doi : 10.1093 / sysbio / syz022 . PMID 31111152 . Resumen de laicos . 
27. Drummond, AJ, Ho, SYW, Phillips, MJ y Rambaut A. (2006). "Filogenética relajada y citas con confianza" . PLoS Biology . 4 (5): e88. doi : 10.1371 / journal.pbio.0040088 . PMC 1395354 . PMID 16683862 .  
28. Felsenstein, J (2001). "Teniendo en cuenta la variación de las tasas evolutivas entre sitios al inferir filogenias". J Mol Evol . 53 (4–5): 447–55. Código Bibliográfico : 2001JMolE..53..447F . doi : 10.1007 / s002390010234 . PMID 11675604 . S2CID 9791493 .  
29. Marshall, DC y col. 2016. Inflación de las tasas y fechas del reloj molecular: filogenética molecular, biogeografía y diversificación de una radiación de cigarra global de Australasia (Hemiptera: Cicadidae: Cicadettini). Biología sistemática 65 (1): 16–34 .
30. Ho SY, Phillips MJ, Cooper A, Drummond AJ (2005). "Dependencia del tiempo de las estimaciones de la tasa molecular y sobreestimación sistemática de los tiempos de divergencia recientes" . Biología Molecular y Evolución . 22 (7): 1561-1568. doi : 10.1093 / molbev / msi145 . PMID 15814826 . 
31. Peterson GI, Masel J (2009). "Predicción cuantitativa del reloj molecular y Ka / Ks en escalas de tiempo cortas" . Biología Molecular y Evolución . 26 (11): 2595–2603. doi : 10.1093 / molbev / msp175 . PMC 2912466 . PMID 19661199 .  

Lectura adicional

• Ho, SYW, ed. (2020). El reloj evolutivo molecular: teoría y práctica . Springer, Cham. doi : 10.1007 / 978-3-030-60181-2 . ISBN 978-3-030-60180-5. S2CID  231672167 .
• Kumar, S. (2005). "Relojes moleculares: cuatro décadas de evolución". Nature Reviews Genética . 6 (8): 654–662. doi : 10.1038 / nrg1659 . PMID  16136655 . S2CID  14261833 .
• Morgan, GJ (1998). "Emile Zuckerkandl, Linus Pauling y el reloj evolutivo molecular, 1959-1965". Revista de Historia de la Biología . 31 (2): 155-178. doi : 10.1023 / A: 1004394418084 . PMID  11620303 . S2CID  5660841 .
• Zuckerkandl, E .; Pauling, LB (1965). "Divergencia evolutiva y convergencia en proteínas". En Bryson, V .; Vogel, HJ (eds.). Evolución de genes y proteínas . Academic Press, Nueva York. págs. 97-166.

Enlaces externos

• Allan Wilson y el reloj molecular
• Explicación del reloj molecular del fenómeno de la equidistancia molecular
• Servicio Date-a-Clade para el árbol molecular de la vida